MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 44177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017306	AGCT	2	8	258859	258866	25 %	25 %	25 %	25 %	387135794
5002	NC_017306	TGC	2	6	258887	258892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135794
5003	NC_017306	GAT	2	6	258942	258947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135794
5004	NC_017306	AGA	2	6	259103	259108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135794
5005	NC_017306	ATC	2	6	259225	259230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135794
5006	NC_017306	TC	3	6	259229	259234	0 %	50 %	0 %	50 %	387135794
5007	NC_017306	GAC	2	6	259257	259262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135794
5008	NC_017306	TGA	2	6	259357	259362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135794
5009	NC_017306	GCT	2	6	259483	259488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135795
5010	NC_017306	GAG	2	6	259514	259519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135795
5011	NC_017306	CAG	2	6	259631	259636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135795
5012	NC_017306	CTG	2	6	259689	259694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135795
5013	NC_017306	TCAA	2	8	259769	259776	50 %	25 %	0 %	25 %	387135795
5014	NC_017306	TGC	2	6	259846	259851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135795
5015	NC_017306	TGAT	2	8	259983	259990	25 %	50 %	25 %	0 %	387135795
5016	NC_017306	GGCA	2	8	260050	260057	25 %	0 %	50 %	25 %	387135795
5017	NC_017306	CCG	2	6	260067	260072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135795
5018	NC_017306	CAA	2	6	260083	260088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135795
5019	NC_017306	TTC	2	6	260105	260110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135795
5020	NC_017306	GAC	2	6	260120	260125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135795
5021	NC_017306	ACTC	2	8	260153	260160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017306	TCG	2	6	260298	260303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135796
5023	NC_017306	GTGG	2	8	260321	260328	0 %	25 %	75 %	0 %	387135796
5024	NC_017306	GC	3	6	260365	260370	0 %	0 %	50 %	50 %	387135796
5025	NC_017306	TGC	2	6	260387	260392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135796
5026	NC_017306	CTAC	2	8	260419	260426	25 %	25 %	0 %	50 %	387135796
5027	NC_017306	TTA	2	6	260428	260433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135796
5028	NC_017306	TGCTC	2	10	260453	260462	0 %	40 %	20 %	40 %	387135796
5029	NC_017306	TGG	2	6	260465	260470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135796
5030	NC_017306	CCA	2	6	260483	260488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135796
5031	NC_017306	CGC	2	6	260493	260498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135796
5032	NC_017306	ATGA	2	8	260625	260632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017306	ATTA	2	8	260688	260695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017306	CCT	2	6	260844	260849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135797
5035	NC_017306	TGC	2	6	260918	260923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135797
5036	NC_017306	T	7	7	260929	260935	0 %	100 %	0 %	0 %	387135797
5037	NC_017306	TGGG	2	8	260979	260986	0 %	25 %	75 %	0 %	387135797
5038	NC_017306	GGC	2	6	260996	261001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135797
5039	NC_017306	GAA	2	6	261107	261112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135797
5040	NC_017306	CG	3	6	261256	261261	0 %	0 %	50 %	50 %	387135797
5041	NC_017306	TTA	2	6	261322	261327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135797
5042	NC_017306	ACC	2	6	261368	261373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135797
5043	NC_017306	CAG	2	6	261390	261395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135797
5044	NC_017306	GGC	2	6	261405	261410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135797
5045	NC_017306	AAG	2	6	261453	261458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135797
5046	NC_017306	GC	4	8	261500	261507	0 %	0 %	50 %	50 %	387135797
5047	NC_017306	CTT	2	6	261508	261513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135797
5048	NC_017306	TGG	2	6	261538	261543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135797
5049	NC_017306	GGCA	2	8	261613	261620	25 %	0 %	50 %	25 %	387135797
5050	NC_017306	TGA	2	6	261647	261652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135797
5051	NC_017306	TGC	2	6	261731	261736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135797
5052	NC_017306	CTG	2	6	261798	261803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135797
5053	NC_017306	GAT	2	6	261855	261860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135797
5054	NC_017306	GC	4	8	261880	261887	0 %	0 %	50 %	50 %	387135797
5055	NC_017306	ATT	2	6	261942	261947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135797
5056	NC_017306	TGG	2	6	262003	262008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135797
5057	NC_017306	CTG	2	6	262130	262135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017306	CTT	2	6	262198	262203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135798
5059	NC_017306	GGC	2	6	262206	262211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135798
5060	NC_017306	GCT	2	6	262228	262233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135798
5061	NC_017306	AGC	2	6	262254	262259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135798
5062	NC_017306	TGGG	2	8	262312	262319	0 %	25 %	75 %	0 %	387135798
5063	NC_017306	GCT	2	6	262320	262325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135798
5064	NC_017306	TTGGA	2	10	262371	262380	20 %	40 %	40 %	0 %	387135798
5065	NC_017306	GGT	3	9	262483	262491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135799
5066	NC_017306	TGA	2	6	262519	262524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135799
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5069	NC_017306	GGCTC	2	10	262693	262702	0 %	20 %	40 %	40 %	387135799
5070	NC_017306	CAC	2	6	262762	262767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135799
5071	NC_017306	GA	3	6	262785	262790	50 %	0 %	50 %	0 %	387135799
5072	NC_017306	GCA	2	6	262796	262801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135799
5073	NC_017306	CGA	2	6	262843	262848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135799
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5076	NC_017306	CTA	2	6	263133	263138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135800
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5079	NC_017306	GCT	2	6	263309	263314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135800
5080	NC_017306	GGA	2	6	263388	263393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135800
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5093	NC_017306	GTTG	2	8	264270	264277	0 %	50 %	50 %	0 %	387135801
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5102	NC_017306	CGG	2	6	264667	264672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135801
5103	NC_017306	CTCAAG	2	12	264749	264760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387135801
5104	NC_017306	GGT	2	6	264908	264913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017306	ACA	2	6	264941	264946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017306	GC	3	6	265017	265022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_017306	GTG	2	6	265038	265043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135802
5108	NC_017306	GA	3	6	265054	265059	50 %	0 %	50 %	0 %	387135802
5109	NC_017306	GCT	3	9	265067	265075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135802
5110	NC_017306	TCT	2	6	265169	265174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135802
5111	NC_017306	TGCATT	2	12	265209	265220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387135802
5112	NC_017306	GAAT	2	8	265303	265310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017306	TCA	2	6	265390	265395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135803
5114	NC_017306	CCATG	2	10	265496	265505	20 %	20 %	20 %	40 %	387135803
5115	NC_017306	TTGCC	2	10	265583	265592	0 %	40 %	20 %	40 %	387135803
5116	NC_017306	TG	3	6	265680	265685	0 %	50 %	50 %	0 %	387135803
5117	NC_017306	GTC	2	6	265704	265709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135803
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5119	NC_017306	CGA	2	6	265832	265837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135803
5120	NC_017306	GAT	2	6	265938	265943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135803
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5122	NC_017306	TCA	2	6	266083	266088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135803
5123	NC_017306	GCC	2	6	266091	266096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135803
5124	NC_017306	TTGC	2	8	266154	266161	0 %	50 %	25 %	25 %	387135803
5125	NC_017306	AC	3	6	266177	266182	50 %	0 %	0 %	50 %	387135803
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5240	NC_017306	TGGC	2	8	272161	272168	0 %	25 %	50 %	25 %	387135807
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5244	NC_017306	GCG	2	6	272673	272678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135808
5245	NC_017306	CGT	2	6	272729	272734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135808
5246	NC_017306	AGG	2	6	272853	272858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135808
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5248	NC_017306	GCA	2	6	272876	272881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135808
5249	NC_017306	CGGG	2	8	272886	272893	0 %	0 %	75 %	25 %	387135808
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5282	NC_017306	TGG	2	6	274764	274769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_017306	GGTC	2	8	274849	274856	0 %	25 %	50 %	25 %	387135810
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5356	NC_017306	GA	3	6	278627	278632	50 %	0 %	50 %	0 %	387135814
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5363	NC_017306	CCAG	2	8	278807	278814	25 %	0 %	25 %	50 %	387135814
5364	NC_017306	CTG	2	6	278828	278833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135814
5365	NC_017306	CGT	2	6	278843	278848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135814
5366	NC_017306	CTCA	2	8	278885	278892	25 %	25 %	0 %	50 %	387135814
5367	NC_017306	GCT	2	6	278923	278928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135814
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5394	NC_017306	CGG	2	6	279765	279770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5395	NC_017306	TGA	2	6	279811	279816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5431	NC_017306	TCA	2	6	281439	281444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135819
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5435	NC_017306	TGG	2	6	281571	281576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_017306	CTG	2	6	281704	281709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135820
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5469	NC_017306	GCT	2	6	283152	283157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135821
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5478	NC_017306	CGGAGT	2	12	283508	283519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387135822
5479	NC_017306	ATT	2	6	283797	283802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135822
5480	NC_017306	TTC	2	6	283812	283817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135822
5481	NC_017306	CGG	2	6	283843	283848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135822
5482	NC_017306	TAA	2	6	283853	283858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135822
5483	NC_017306	CTG	2	6	283892	283897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135822
5484	NC_017306	AGGA	2	8	283944	283951	50 %	0 %	50 %	0 %	387135822
5485	NC_017306	T	6	6	283974	283979	0 %	100 %	0 %	0 %	387135822
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5489	NC_017306	CGG	2	6	284263	284268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135822
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