MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017305	TACGC	2	10	156267	156276	20 %	20 %	20 %	40 %	384510035
3002	NC_017305	TGAA	2	8	156379	156386	50 %	25 %	25 %	0 %	384510035
3003	NC_017305	CAG	2	6	156430	156435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510035
3004	NC_017305	CG	3	6	156518	156523	0 %	0 %	50 %	50 %	384510035
3005	NC_017305	CGG	2	6	156531	156536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510035
3006	NC_017305	CAA	2	6	156626	156631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510035
3007	NC_017305	GGT	2	6	156670	156675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017305	ACC	2	6	156696	156701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_017305	TCC	2	6	156734	156739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017305	GCT	2	6	156769	156774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510036
3011	NC_017305	CAG	2	6	156787	156792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510036
3012	NC_017305	TTCA	2	8	156826	156833	25 %	50 %	0 %	25 %	384510036
3013	NC_017305	CAT	2	6	156834	156839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510036
3014	NC_017305	TCC	2	6	156863	156868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510036
3015	NC_017305	TGG	2	6	156947	156952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510036
3016	NC_017305	GT	3	6	156956	156961	0 %	50 %	50 %	0 %	384510036
3017	NC_017305	T	6	6	157003	157008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017305	TG	3	6	157029	157034	0 %	50 %	50 %	0 %	384510037
3019	NC_017305	ACC	2	6	157058	157063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510037
3020	NC_017305	AT	3	6	157099	157104	50 %	50 %	0 %	0 %	384510037
3021	NC_017305	ATGC	2	8	157175	157182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_017305	G	6	6	157190	157195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017305	AGA	2	6	157211	157216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017305	TCG	2	6	157278	157283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
3025	NC_017305	TGG	2	6	157501	157506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510038
3026	NC_017305	CGG	2	6	157549	157554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510038
3027	NC_017305	GTG	2	6	157617	157622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510038
3028	NC_017305	CGGC	2	8	157716	157723	0 %	0 %	50 %	50 %	384510038
3029	NC_017305	TGC	2	6	157727	157732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
3030	NC_017305	GCC	2	6	157742	157747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510038
3031	NC_017305	CTG	2	6	157765	157770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
3032	NC_017305	CGT	2	6	157912	157917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
3033	NC_017305	GGA	2	6	157942	157947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510038
3034	NC_017305	GTCA	2	8	157964	157971	25 %	25 %	25 %	25 %	384510038
3035	NC_017305	AG	3	6	158161	158166	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
3036	NC_017305	CTC	2	6	158176	158181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510039
3037	NC_017305	AG	3	6	158203	158208	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
3038	NC_017305	TGC	2	6	158330	158335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
3039	NC_017305	TCG	2	6	158369	158374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
3040	NC_017305	GCG	2	6	158490	158495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510039
3041	NC_017305	CCT	2	6	158499	158504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510039
3042	NC_017305	CGA	2	6	158530	158535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510039
3043	NC_017305	GA	3	6	158550	158555	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
3044	NC_017305	CGT	2	6	158646	158651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
3045	NC_017305	CGT	2	6	158736	158741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
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3048	NC_017305	GC	3	6	158822	158827	0 %	0 %	50 %	50 %	384510039
3049	NC_017305	TTG	2	6	158834	158839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510039
3050	NC_017305	GAG	2	6	158878	158883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510039
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3052	NC_017305	CGG	2	6	158916	158921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510039
3053	NC_017305	GAT	2	6	158986	158991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510039
3054	NC_017305	CGC	2	6	159009	159014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510039
3055	NC_017305	GTTG	2	8	159019	159026	0 %	50 %	50 %	0 %	384510039
3056	NC_017305	GGT	2	6	159067	159072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510039
3057	NC_017305	AG	3	6	159125	159130	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
3058	NC_017305	GCC	2	6	159166	159171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510039
3059	NC_017305	GTC	2	6	159282	159287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510040
3060	NC_017305	TCGC	2	8	159289	159296	0 %	25 %	25 %	50 %	384510040
3061	NC_017305	CATG	2	8	159371	159378	25 %	25 %	25 %	25 %	384510040
3062	NC_017305	CAA	2	6	159386	159391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510040
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3065	NC_017305	AAG	2	6	159659	159664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510040
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3067	NC_017305	TGC	2	6	159733	159738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510040
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3069	NC_017305	AAC	2	6	159831	159836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510040
3070	NC_017305	CGG	2	6	159910	159915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510040
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3072	NC_017305	TCT	2	6	160090	160095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510040
3073	NC_017305	CTG	2	6	160096	160101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510040
3074	NC_017305	TTGT	2	8	160238	160245	0 %	75 %	25 %	0 %	384510040
3075	NC_017305	ATA	2	6	160480	160485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017305	GGT	2	6	160486	160491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017305	TGG	2	6	160494	160499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017305	ATCA	2	8	160663	160670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_017305	CGG	2	6	160674	160679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017305	CCG	2	6	160728	160733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_017305	ATAC	2	8	160736	160743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_017305	CAGG	2	8	160756	160763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_017305	CGG	2	6	160800	160805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017305	GTT	2	6	160819	160824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017305	CGA	2	6	160857	160862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017305	A	6	6	160864	160869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017305	GTAG	2	8	160870	160877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017305	ATA	2	6	160953	160958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017305	TTC	2	6	161024	161029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017305	GGTTG	2	10	161037	161046	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017305	CAC	2	6	161131	161136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_017305	GCT	2	6	161138	161143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017305	TGG	2	6	161148	161153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017305	CCG	2	6	161182	161187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510041
3095	NC_017305	GTAA	2	8	161210	161217	50 %	25 %	25 %	0 %	384510041
3096	NC_017305	AT	3	6	161271	161276	50 %	50 %	0 %	0 %	384510041
3097	NC_017305	TCG	2	6	161292	161297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510041
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3099	NC_017305	TGC	2	6	161313	161318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510041
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3101	NC_017305	CCTTG	2	10	161413	161422	0 %	40 %	20 %	40 %	384510041
3102	NC_017305	GCA	2	6	161436	161441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510041
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3104	NC_017305	CTG	2	6	161492	161497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510041
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3106	NC_017305	GGA	2	6	161597	161602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510041
3107	NC_017305	GGTC	2	8	161641	161648	0 %	25 %	50 %	25 %	384510041
3108	NC_017305	CGC	2	6	161665	161670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510041
3109	NC_017305	TCC	2	6	161775	161780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510041
3110	NC_017305	TTA	2	6	161841	161846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510041
3111	NC_017305	CGC	2	6	161890	161895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510041
3112	NC_017305	CGG	2	6	161946	161951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510041
3113	NC_017305	CGG	3	9	162103	162111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510041
3114	NC_017305	GAT	2	6	162152	162157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510041
3115	NC_017305	TGA	3	9	162247	162255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510041
3116	NC_017305	ACT	2	6	162288	162293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510041
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3118	NC_017305	TGA	2	6	162397	162402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510041
3119	NC_017305	CGG	2	6	162406	162411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510041
3120	NC_017305	T	6	6	162426	162431	0 %	100 %	0 %	0 %	384510041
3121	NC_017305	ACA	2	6	162456	162461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510041
3122	NC_017305	GAT	2	6	162608	162613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510041
3123	NC_017305	CGT	2	6	162705	162710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510041
3124	NC_017305	TGG	2	6	162793	162798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510041
3125	NC_017305	T	6	6	162829	162834	0 %	100 %	0 %	0 %	384510041
3126	NC_017305	GCA	2	6	162843	162848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510041
3127	NC_017305	GTT	2	6	162886	162891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510041
3128	NC_017305	CGG	2	6	162910	162915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510041
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3131	NC_017305	CGGC	2	8	163037	163044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_017305	T	6	6	163079	163084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017305	CGC	2	6	163097	163102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_017305	AGA	2	6	163108	163113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017305	GCATA	2	10	163137	163146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3141	NC_017305	ATG	2	6	163603	163608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510042
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3153	NC_017305	TTTG	2	8	164202	164209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_017305	ATGC	2	8	164228	164235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3155	NC_017305	GAG	2	6	164271	164276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_017305	AAC	2	6	164304	164309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_017305	TGG	2	6	164328	164333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_017305	TGTGC	2	10	164360	164369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3159	NC_017305	CGC	2	6	164513	164518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510043
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3165	NC_017305	CAT	2	6	164752	164757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510043
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3224	NC_017305	TGC	2	6	168022	168027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510046
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3228	NC_017305	GGC	2	6	168261	168266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510046
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3230	NC_017305	TGC	2	6	168476	168481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510046
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3232	NC_017305	GAA	2	6	168564	168569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510046
3233	NC_017305	GGA	2	6	168643	168648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510046
3234	NC_017305	ATC	2	6	168656	168661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510046
3235	NC_017305	CAC	2	6	168685	168690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510046
3236	NC_017305	GCC	2	6	168691	168696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510046
3237	NC_017305	GGAA	2	8	168742	168749	50 %	0 %	50 %	0 %	384510046
3238	NC_017305	GGATG	2	10	168769	168778	20 %	20 %	60 %	0 %	384510046
3239	NC_017305	GCC	2	6	168813	168818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510046
3240	NC_017305	GTT	2	6	168857	168862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510046
3241	NC_017305	GGTG	2	8	168868	168875	0 %	25 %	75 %	0 %	384510046
3242	NC_017305	GGCT	2	8	168909	168916	0 %	25 %	50 %	25 %	384510046
3243	NC_017305	GATG	2	8	169115	169122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_017305	AAT	2	6	169135	169140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_017305	TGTT	2	8	169189	169196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_017305	ATT	2	6	169247	169252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_017305	AAG	2	6	169267	169272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_017305	AAG	2	6	169400	169405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_017305	TCCC	2	8	169458	169465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3250	NC_017305	A	6	6	169554	169559	100 %	0 %	0 %	0 %	384510047
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3288	NC_017305	CACTT	2	10	171575	171584	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3289	NC_017305	GGAC	2	8	171688	171695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3489	NC_017305	ATT	2	6	182475	182480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_017305	TGGGGC	2	12	182537	182548	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3492	NC_017305	GTG	2	6	182581	182586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_017305	TGC	2	6	182590	182595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_017305	TGACTA	2	12	182637	182648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384510054
3495	NC_017305	CGT	2	6	182656	182661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054
3496	NC_017305	GAG	2	6	182705	182710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510054
3497	NC_017305	T	6	6	182737	182742	0 %	100 %	0 %	0 %	384510054
3498	NC_017305	CTG	2	6	182757	182762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054
3499	NC_017305	TC	3	6	182828	182833	0 %	50 %	0 %	50 %	384510054
3500	NC_017305	GCA	2	6	182868	182873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510054

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