MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017305	CCT	2	6	51646	51651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509940
1002	NC_017305	T	7	7	51678	51684	0 %	100 %	0 %	0 %	384509940
1003	NC_017305	ATG	2	6	51778	51783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509940
1004	NC_017305	GCGGT	2	10	51784	51793	0 %	20 %	60 %	20 %	384509940
1005	NC_017305	CTT	2	6	51854	51859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509940
1006	NC_017305	TGT	2	6	51902	51907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509940
1007	NC_017305	TGG	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509940
1008	NC_017305	CGAT	2	8	51940	51947	25 %	25 %	25 %	25 %	384509940
1009	NC_017305	ATGA	2	8	52074	52081	50 %	25 %	25 %	0 %	384509940
1010	NC_017305	TGC	2	6	52086	52091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509940
1011	NC_017305	GCG	2	6	52129	52134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509940
1012	NC_017305	CAA	2	6	52163	52168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509940
1013	NC_017305	TCC	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509941
1014	NC_017305	CTGG	2	8	52475	52482	0 %	25 %	50 %	25 %	384509941
1015	NC_017305	GAT	2	6	52541	52546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509941
1016	NC_017305	GTG	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509941
1017	NC_017305	TTC	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509941
1018	NC_017305	TGT	2	6	52659	52664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017305	TTGGA	2	10	52670	52679	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017305	AAC	2	6	52688	52693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017305	TTGAT	2	10	52705	52714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017305	CTT	2	6	52781	52786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017305	TGCAC	2	10	52799	52808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_017305	TGC	2	6	52812	52817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017305	TTG	3	9	52820	52828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017305	CGT	2	6	52829	52834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017305	GCC	2	6	52848	52853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_017305	AC	3	6	52928	52933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017305	TTC	2	6	52995	53000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509942
1030	NC_017305	TTC	2	6	53004	53009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509942
1031	NC_017305	CTGGC	2	10	53058	53067	0 %	20 %	40 %	40 %	384509942
1032	NC_017305	TGG	2	6	53091	53096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509942
1033	NC_017305	TGC	2	6	53136	53141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509942
1034	NC_017305	TGG	2	6	53169	53174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509942
1035	NC_017305	TAA	2	6	53266	53271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509942
1036	NC_017305	GGC	2	6	53273	53278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509942
1037	NC_017305	TCG	2	6	53496	53501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509942
1038	NC_017305	CTGGCG	2	12	53513	53524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384509942
1039	NC_017305	GCAGC	2	10	53557	53566	20 %	0 %	40 %	40 %	384509942
1040	NC_017305	GACTG	2	10	53573	53582	20 %	20 %	40 %	20 %	384509942
1041	NC_017305	ATG	2	6	53760	53765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509942
1042	NC_017305	ATGC	2	8	53796	53803	25 %	25 %	25 %	25 %	384509942
1043	NC_017305	GC	3	6	53926	53931	0 %	0 %	50 %	50 %	384509942
1044	NC_017305	GAA	2	6	53992	53997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509942
1045	NC_017305	TGAT	2	8	54030	54037	25 %	50 %	25 %	0 %	384509942
1046	NC_017305	AGC	2	6	54093	54098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509942
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1048	NC_017305	TGG	3	9	54160	54168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509942
1049	NC_017305	AGC	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509942
1050	NC_017305	ACTT	2	8	54206	54213	25 %	50 %	0 %	25 %	384509942
1051	NC_017305	AAT	3	9	54242	54250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509942
1052	NC_017305	T	6	6	54622	54627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017305	CCA	2	6	54668	54673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017305	A	6	6	54681	54686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017305	GA	3	6	54740	54745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017305	ATC	2	6	54846	54851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509943
1057	NC_017305	CGG	2	6	54945	54950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509943
1058	NC_017305	TAG	2	6	55003	55008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509943
1059	NC_017305	AGT	2	6	55073	55078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509943
1060	NC_017305	T	6	6	55204	55209	0 %	100 %	0 %	0 %	384509943
1061	NC_017305	TGG	2	6	55271	55276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509943
1062	NC_017305	CGG	2	6	55280	55285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509943
1063	NC_017305	CCGT	2	8	55310	55317	0 %	25 %	25 %	50 %	384509943
1064	NC_017305	CGG	2	6	55353	55358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509943
1065	NC_017305	TG	3	6	55419	55424	0 %	50 %	50 %	0 %	384509944
1066	NC_017305	AGCA	2	8	55498	55505	50 %	0 %	25 %	25 %	384509944
1067	NC_017305	TA	3	6	55510	55515	50 %	50 %	0 %	0 %	384509944
1068	NC_017305	GCCGTG	2	12	55586	55597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384509944
1069	NC_017305	CGG	2	6	55635	55640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509944
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1072	NC_017305	GTG	2	6	55791	55796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509944
1073	NC_017305	AAGGC	2	10	55814	55823	40 %	0 %	40 %	20 %	384509944
1074	NC_017305	GC	3	6	55854	55859	0 %	0 %	50 %	50 %	384509944
1075	NC_017305	CTA	2	6	55881	55886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509944
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1080	NC_017305	CG	3	6	56567	56572	0 %	0 %	50 %	50 %	384509945
1081	NC_017305	GCGG	2	8	56577	56584	0 %	0 %	75 %	25 %	384509945
1082	NC_017305	TAA	2	6	56618	56623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509945
1083	NC_017305	GCT	2	6	56653	56658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509945
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1085	NC_017305	GAC	2	6	56728	56733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509946
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1088	NC_017305	CAT	2	6	56932	56937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509946
1089	NC_017305	CAC	4	12	56942	56953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509946
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1092	NC_017305	CATC	2	8	57037	57044	25 %	25 %	0 %	50 %	384509946
1093	NC_017305	GCT	3	9	57091	57099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509946
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1097	NC_017305	GGA	2	6	57407	57412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509946
1098	NC_017305	CAA	2	6	57415	57420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509946
1099	NC_017305	GGT	2	6	57425	57430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509946
1100	NC_017305	GTT	2	6	57458	57463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509946
1101	NC_017305	CTG	2	6	57505	57510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509946
1102	NC_017305	ATTG	2	8	57585	57592	25 %	50 %	25 %	0 %	384509946
1103	NC_017305	TGG	2	6	57721	57726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017305	CAT	2	6	57766	57771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017305	AGC	2	6	57798	57803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017305	TTGG	2	8	57810	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017305	TGC	3	9	57865	57873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017305	TCT	2	6	57960	57965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509947
1109	NC_017305	TCG	2	6	58019	58024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509947
1110	NC_017305	TTG	2	6	58094	58099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509947
1111	NC_017305	TCT	2	6	58248	58253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509948
1112	NC_017305	TCA	2	6	58266	58271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509948
1113	NC_017305	TGCGCG	2	12	58284	58295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384509948
1114	NC_017305	CGC	2	6	58342	58347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509948
1115	NC_017305	GC	3	6	58350	58355	0 %	0 %	50 %	50 %	384509948
1116	NC_017305	GCC	2	6	58376	58381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509948
1117	NC_017305	GAA	2	6	58415	58420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509948
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1120	NC_017305	TGA	2	6	58489	58494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509948
1121	NC_017305	AGGG	2	8	58574	58581	25 %	0 %	75 %	0 %	384509948
1122	NC_017305	GGA	2	6	58642	58647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509948
1123	NC_017305	ATGGC	2	10	58674	58683	20 %	20 %	40 %	20 %	384509948
1124	NC_017305	TGC	2	6	58688	58693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509948
1125	NC_017305	CG	3	6	58769	58774	0 %	0 %	50 %	50 %	384509948
1126	NC_017305	GTC	2	6	58793	58798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509948
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1128	NC_017305	GTG	2	6	59036	59041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509948
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1141	NC_017305	GAG	2	6	59714	59719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_017305	TCG	2	6	66002	66007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509955
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