MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017305	CAT	2	6	26629	26634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509917
502	NC_017305	GAA	2	6	26640	26645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509917
503	NC_017305	ATC	2	6	26815	26820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509917
504	NC_017305	GTG	2	6	26849	26854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509917
505	NC_017305	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509917
506	NC_017305	CAG	3	9	26899	26907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509917
507	NC_017305	TCA	2	6	26946	26951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509917
508	NC_017305	CGG	2	6	27020	27025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509918
509	NC_017305	AAG	2	6	27087	27092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509918
510	NC_017305	TGA	2	6	27101	27106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509918
511	NC_017305	TAC	2	6	27213	27218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509918
512	NC_017305	CTG	2	6	27512	27517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509918
513	NC_017305	ACC	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509918
514	NC_017305	GCT	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509918
515	NC_017305	CAC	2	6	27560	27565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509918
516	NC_017305	AGTGCT	2	12	27577	27588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384509918
517	NC_017305	GAA	2	6	27604	27609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509918
518	NC_017305	AGC	2	6	27645	27650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509918
519	NC_017305	AATT	2	8	27656	27663	50 %	50 %	0 %	0 %	384509918
520	NC_017305	GA	3	6	27707	27712	50 %	0 %	50 %	0 %	384509918
521	NC_017305	AGG	2	6	27754	27759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509918
522	NC_017305	CA	3	6	27781	27786	50 %	0 %	0 %	50 %	384509918
523	NC_017305	TGG	2	6	27788	27793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509918
524	NC_017305	TGGA	2	8	27813	27820	25 %	25 %	50 %	0 %	384509918
525	NC_017305	CAG	2	6	27909	27914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509918
526	NC_017305	GCG	2	6	27933	27938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509918
527	NC_017305	GAAG	2	8	27968	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	384509918
528	NC_017305	GAA	2	6	28168	28173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
529	NC_017305	GGT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509919
530	NC_017305	GTT	2	6	28351	28356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509919
531	NC_017305	ACT	2	6	28417	28422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509919
532	NC_017305	AGA	2	6	28506	28511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
533	NC_017305	TGC	2	6	28515	28520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509919
534	NC_017305	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	384509919
535	NC_017305	GC	3	6	28554	28559	0 %	0 %	50 %	50 %	384509919
536	NC_017305	TCT	2	6	28601	28606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509919
537	NC_017305	GAAA	2	8	28629	28636	75 %	0 %	25 %	0 %	384509919
538	NC_017305	CTTC	2	8	28638	28645	0 %	50 %	0 %	50 %	384509919
539	NC_017305	AGAA	2	8	28670	28677	75 %	0 %	25 %	0 %	384509919
540	NC_017305	CAG	2	6	28736	28741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509919
541	NC_017305	CTT	2	6	28756	28761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509919
542	NC_017305	CAA	2	6	28794	28799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509919
543	NC_017305	TC	3	6	28801	28806	0 %	50 %	0 %	50 %	384509919
544	NC_017305	TGA	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509919
545	NC_017305	TC	3	6	28880	28885	0 %	50 %	0 %	50 %	384509919
546	NC_017305	TCT	2	6	28919	28924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509919
547	NC_017305	GAA	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
548	NC_017305	GAA	2	6	29004	29009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
549	NC_017305	GAC	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509919
550	NC_017305	GAA	2	6	29083	29088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
551	NC_017305	AAG	2	6	29107	29112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509919
552	NC_017305	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017305	TC	3	6	29157	29162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017305	TAT	2	6	29175	29180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017305	CAT	2	6	29325	29330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509920
556	NC_017305	TAG	2	6	29373	29378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509920
557	NC_017305	ATG	2	6	29401	29406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509920
558	NC_017305	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	384509920
559	NC_017305	TA	3	6	29535	29540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017305	CGG	2	6	29709	29714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509921
561	NC_017305	TGAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	50 %	0 %	384509921
562	NC_017305	GCA	2	6	29810	29815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
563	NC_017305	TTG	2	6	29901	29906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509921
564	NC_017305	CAA	2	6	29943	29948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509921
565	NC_017305	GTAC	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	384509921
566	NC_017305	CAC	2	6	30046	30051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509921
567	NC_017305	TGA	2	6	30087	30092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509921
568	NC_017305	TTC	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
569	NC_017305	CTT	2	6	30210	30215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
570	NC_017305	GC	3	6	30247	30252	0 %	0 %	50 %	50 %	384509921
571	NC_017305	AGA	2	6	30283	30288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509921
572	NC_017305	GTG	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
573	NC_017305	T	7	7	30311	30317	0 %	100 %	0 %	0 %	384509921
574	NC_017305	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509921
575	NC_017305	GCT	2	6	30411	30416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
576	NC_017305	TGC	2	6	30486	30491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
577	NC_017305	GCC	2	6	30520	30525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509921
578	NC_017305	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	384509921
579	NC_017305	GATC	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	384509921
580	NC_017305	TTC	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
581	NC_017305	GTG	2	6	30710	30715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
582	NC_017305	AGC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
583	NC_017305	GCA	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
584	NC_017305	GGA	2	6	30986	30991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509921
585	NC_017305	GA	3	6	31079	31084	50 %	0 %	50 %	0 %	384509921
586	NC_017305	TGG	2	6	31128	31133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
587	NC_017305	CGT	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
588	NC_017305	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	384509921
589	NC_017305	ATC	2	6	31193	31198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509921
590	NC_017305	CGT	2	6	31236	31241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
591	NC_017305	TCT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
592	NC_017305	CAA	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509921
593	NC_017305	GCA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
594	NC_017305	CCT	2	6	31630	31635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
595	NC_017305	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
596	NC_017305	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	384509922
597	NC_017305	GGC	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509922
598	NC_017305	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509922
599	NC_017305	TTC	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509922
600	NC_017305	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509922
601	NC_017305	TCC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
602	NC_017305	CAA	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509922
603	NC_017305	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	384509922
604	NC_017305	TGC	2	6	32019	32024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
605	NC_017305	GAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509922
606	NC_017305	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
607	NC_017305	TTG	2	6	32093	32098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509922
608	NC_017305	GTG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509922
609	NC_017305	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	384509922
610	NC_017305	CTG	2	6	32250	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
611	NC_017305	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	384509922
612	NC_017305	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
613	NC_017305	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509922
614	NC_017305	GCC	3	9	32620	32628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
615	NC_017305	AGG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509922
616	NC_017305	AAT	2	6	32724	32729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509922
617	NC_017305	GCC	2	6	32743	32748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
618	NC_017305	GA	3	6	32811	32816	50 %	0 %	50 %	0 %	384509922
619	NC_017305	CAC	2	6	32819	32824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509922
620	NC_017305	GAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
621	NC_017305	GTC	2	6	33024	33029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
622	NC_017305	GCC	2	6	33051	33056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
623	NC_017305	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
624	NC_017305	GC	3	6	33156	33161	0 %	0 %	50 %	50 %	384509923
625	NC_017305	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509923
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627	NC_017305	GGC	2	6	33205	33210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509923
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