MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 77013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017304	CAC	2	6	162814	162819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_017304	ATT	2	6	162823	162828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017304	GAA	2	6	162841	162846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017304	TCA	2	6	162885	162890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017304	TAC	2	6	162893	162898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017304	ATTT	2	8	162912	162919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017304	T	8	8	162917	162924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017304	A	6	6	162962	162967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017304	ATA	2	6	162990	162995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017304	AAT	2	6	163037	163042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3511	NC_017304	AAC	2	6	163051	163056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777531
3512	NC_017304	ATA	2	6	163156	163161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3513	NC_017304	TTA	2	6	163181	163186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777531
3514	NC_017304	TAA	2	6	163206	163211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3515	NC_017304	TCT	2	6	163223	163228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777531
3516	NC_017304	TCA	2	6	163298	163303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777531
3517	NC_017304	TAA	2	6	163310	163315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3518	NC_017304	AT	3	6	163320	163325	50 %	50 %	0 %	0 %	385777531
3519	NC_017304	CTT	2	6	163329	163334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777531
3520	NC_017304	TTC	2	6	163363	163368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777531
3521	NC_017304	TCA	2	6	163391	163396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777531
3522	NC_017304	TAA	2	6	163421	163426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3523	NC_017304	T	6	6	163466	163471	0 %	100 %	0 %	0 %	385777531
3524	NC_017304	T	6	6	163524	163529	0 %	100 %	0 %	0 %	385777531
3525	NC_017304	TTTA	2	8	163537	163544	25 %	75 %	0 %	0 %	385777531
3526	NC_017304	T	6	6	163549	163554	0 %	100 %	0 %	0 %	385777531
3527	NC_017304	AGT	2	6	163593	163598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777531
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3529	NC_017304	ATT	2	6	163660	163665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777531
3530	NC_017304	T	6	6	163692	163697	0 %	100 %	0 %	0 %	385777531
3531	NC_017304	GTA	2	6	163750	163755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777531
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3534	NC_017304	TTG	2	6	163884	163889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777531
3535	NC_017304	GAG	2	6	164025	164030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777531
3536	NC_017304	TAA	2	6	164046	164051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3537	NC_017304	T	6	6	164186	164191	0 %	100 %	0 %	0 %	385777531
3538	NC_017304	TCT	2	6	164210	164215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777531
3539	NC_017304	AT	3	6	164235	164240	50 %	50 %	0 %	0 %	385777531
3540	NC_017304	TAT	3	9	164277	164285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777531
3541	NC_017304	TTC	2	6	164305	164310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777531
3542	NC_017304	TATC	2	8	164325	164332	25 %	50 %	0 %	25 %	385777531
3543	NC_017304	CAT	2	6	164340	164345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777531
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3545	NC_017304	ATT	2	6	164440	164445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777531
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3547	NC_017304	A	6	6	164504	164509	100 %	0 %	0 %	0 %	385777531
3548	NC_017304	TCA	2	6	164579	164584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777531
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3550	NC_017304	TGT	2	6	164629	164634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777531
3551	NC_017304	ATT	3	9	164716	164724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777531
3552	NC_017304	TAA	2	6	164745	164750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777531
3553	NC_017304	ATT	3	9	164804	164812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017304	TCC	2	6	164846	164851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_017304	AT	3	6	164867	164872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017304	GAT	2	6	164961	164966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017304	G	6	6	164984	164989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017304	TA	3	6	165029	165034	50 %	50 %	0 %	0 %	385777532
3559	NC_017304	AT	3	6	165127	165132	50 %	50 %	0 %	0 %	385777532
3560	NC_017304	TCC	2	6	165245	165250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777532
3561	NC_017304	A	6	6	165259	165264	100 %	0 %	0 %	0 %	385777532
3562	NC_017304	TCT	2	6	165318	165323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777532
3563	NC_017304	TA	3	6	165381	165386	50 %	50 %	0 %	0 %	385777532
3564	NC_017304	ATTG	2	8	165499	165506	25 %	50 %	25 %	0 %	385777532
3565	NC_017304	CTC	2	6	165558	165563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777532
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3570	NC_017304	AATA	2	8	165730	165737	75 %	25 %	0 %	0 %	385777532
3571	NC_017304	GTA	2	6	165789	165794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777532
3572	NC_017304	CTTA	2	8	165808	165815	25 %	50 %	0 %	25 %	385777532
3573	NC_017304	TAT	2	6	165901	165906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777532
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3575	NC_017304	GTATC	2	10	166125	166134	20 %	40 %	20 %	20 %	385777532
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3577	NC_017304	CTTT	2	8	166215	166222	0 %	75 %	0 %	25 %	385777532
3578	NC_017304	TTA	2	6	166230	166235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777532
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3580	NC_017304	CTC	2	6	166258	166263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_017304	TAT	2	6	166272	166277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017304	TAT	3	9	166327	166335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017304	A	6	6	166359	166364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_017304	T	6	6	166588	166593	0 %	100 %	0 %	0 %	385777533
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3591	NC_017304	ATT	2	6	166700	166705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777533
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3593	NC_017304	CATTG	2	10	166717	166726	20 %	40 %	20 %	20 %	385777533
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3597	NC_017304	TCGTT	2	10	166998	167007	0 %	60 %	20 %	20 %	385777533
3598	NC_017304	TAT	2	6	167026	167031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777533
3599	NC_017304	T	6	6	167033	167038	0 %	100 %	0 %	0 %	385777533
3600	NC_017304	GTT	2	6	167040	167045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777533
3601	NC_017304	AT	3	6	167133	167138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017304	TTA	2	6	167147	167152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017304	T	6	6	167156	167161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017304	A	6	6	167162	167167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017304	TCC	2	6	167216	167221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_017304	TA	4	8	167244	167251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017304	ATC	2	6	167269	167274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017304	TAAAT	2	10	167349	167358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017304	TTG	2	6	167359	167364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017304	TAT	2	6	167450	167455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017304	TCC	2	6	167466	167471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_017304	CTT	2	6	167485	167490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017304	TTA	2	6	167529	167534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017304	T	6	6	167537	167542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017304	AGA	2	6	167608	167613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017304	TAA	2	6	167777	167782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017304	TAT	2	6	167819	167824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017304	AAG	2	6	167832	167837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017304	TAT	2	6	167838	167843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017304	TAG	2	6	167853	167858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017304	T	7	7	167895	167901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017304	AACAA	2	10	167929	167938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3623	NC_017304	TA	3	6	167981	167986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017304	TA	3	6	168007	168012	50 %	50 %	0 %	0 %	385777534
3625	NC_017304	GCT	2	6	168014	168019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777534
3626	NC_017304	TAT	2	6	168144	168149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777534
3627	NC_017304	TTC	2	6	168170	168175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777534
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