MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 77013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017304	CT	3	6	141264	141269	0 %	50 %	0 %	50 %	385777510
3002	NC_017304	GA	3	6	141294	141299	50 %	0 %	50 %	0 %	385777510
3003	NC_017304	AT	3	6	141341	141346	50 %	50 %	0 %	0 %	385777510
3004	NC_017304	TCG	2	6	141383	141388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777510
3005	NC_017304	ATT	2	6	141398	141403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777510
3006	NC_017304	TTTCA	2	10	141418	141427	20 %	60 %	0 %	20 %	385777510
3007	NC_017304	GCAG	2	8	141458	141465	25 %	0 %	50 %	25 %	385777510
3008	NC_017304	T	6	6	141503	141508	0 %	100 %	0 %	0 %	385777510
3009	NC_017304	GT	3	6	141531	141536	0 %	50 %	50 %	0 %	385777510
3010	NC_017304	TGT	3	9	141576	141584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777510
3011	NC_017304	GTT	2	6	141595	141600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777510
3012	NC_017304	TCC	2	6	141641	141646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777510
3013	NC_017304	GAG	2	6	141650	141655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777510
3014	NC_017304	TCA	2	6	141699	141704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777510
3015	NC_017304	AT	3	6	141750	141755	50 %	50 %	0 %	0 %	385777510
3016	NC_017304	AC	3	6	141780	141785	50 %	0 %	0 %	50 %	385777510
3017	NC_017304	A	6	6	141804	141809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017304	TAT	2	6	141815	141820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017304	TTA	2	6	141831	141836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017304	TAA	2	6	141851	141856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017304	AGTT	2	8	141884	141891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017304	T	8	8	141975	141982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017304	TATT	2	8	141991	141998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017304	A	7	7	142005	142011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017304	TAA	2	6	142014	142019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017304	T	7	7	142076	142082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3032	NC_017304	GGC	2	6	142483	142488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777511
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3035	NC_017304	ATG	2	6	142633	142638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777511
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3037	NC_017304	GCAG	2	8	142771	142778	25 %	0 %	50 %	25 %	385777512
3038	NC_017304	CGG	2	6	142855	142860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777512
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3040	NC_017304	ATT	2	6	143204	143209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017304	CTC	2	6	143211	143216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_017304	TGA	2	6	143302	143307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017304	TA	3	6	143322	143327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017304	TAA	2	6	143360	143365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017304	ATT	2	6	143385	143390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_017304	CTT	2	6	143455	143460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017304	T	6	6	143498	143503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017304	AAT	2	6	143526	143531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017304	T	7	7	143542	143548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017304	TCA	2	6	143572	143577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017304	A	6	6	143673	143678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017304	CAT	2	6	143745	143750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017304	AT	3	6	143763	143768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017304	GCT	2	6	143814	143819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017304	TGA	2	6	143821	143826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017304	TGG	2	6	143853	143858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017304	GCA	2	6	143895	143900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3060	NC_017304	ATT	2	6	143922	143927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017304	AGTT	2	8	143942	143949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017304	ATT	2	6	143957	143962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017304	A	6	6	143971	143976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_017304	TAAT	2	8	144113	144120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_017304	ATAA	2	8	144880	144887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_017304	GAT	2	6	145696	145701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777515
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3101	NC_017304	AAAGA	2	10	145743	145752	80 %	0 %	20 %	0 %	385777515
3102	NC_017304	AAG	2	6	145756	145761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777515
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3107	NC_017304	CCT	2	6	145855	145860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777515
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3109	NC_017304	TA	4	8	145872	145879	50 %	50 %	0 %	0 %	385777515
3110	NC_017304	TGCC	2	8	145950	145957	0 %	25 %	25 %	50 %	385777515
3111	NC_017304	GAAA	2	8	145996	146003	75 %	0 %	25 %	0 %	385777515
3112	NC_017304	GGCGG	2	10	146005	146014	0 %	0 %	80 %	20 %	385777515
3113	NC_017304	ATGC	2	8	146044	146051	25 %	25 %	25 %	25 %	385777515
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3115	NC_017304	AGA	2	6	146169	146174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777515
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3119	NC_017304	TAAA	2	8	146415	146422	75 %	25 %	0 %	0 %	385777515
3120	NC_017304	TAA	2	6	146432	146437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017304	ATATT	2	10	146457	146466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017304	ATAC	2	8	146473	146480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_017304	ATA	2	6	146484	146489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017304	TA	3	6	146498	146503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017304	GGAG	2	8	146510	146517	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017304	TCT	2	6	146580	146585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777516
3127	NC_017304	T	6	6	146585	146590	0 %	100 %	0 %	0 %	385777516
3128	NC_017304	TGC	2	6	146726	146731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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