MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 77013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017304	GCG	2	6	22064	22069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777406
502	NC_017304	CTG	2	6	22096	22101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777406
503	NC_017304	TGC	2	6	22107	22112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777406
504	NC_017304	GC	3	6	22169	22174	0 %	0 %	50 %	50 %	385777406
505	NC_017304	ACA	2	6	22187	22192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777406
506	NC_017304	TGA	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777406
507	NC_017304	TGT	2	6	22245	22250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777406
508	NC_017304	CAG	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777406
509	NC_017304	TAT	2	6	22314	22319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777406
510	NC_017304	TGT	2	6	22458	22463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777406
511	NC_017304	GAA	3	9	22486	22494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777406
512	NC_017304	GTT	2	6	22549	22554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777406
513	NC_017304	AGG	2	6	22589	22594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777406
514	NC_017304	GA	3	6	22619	22624	50 %	0 %	50 %	0 %	385777407
515	NC_017304	TTTGC	2	10	22760	22769	0 %	60 %	20 %	20 %	385777407
516	NC_017304	AG	3	6	22910	22915	50 %	0 %	50 %	0 %	385777407
517	NC_017304	AAAT	2	8	22982	22989	75 %	25 %	0 %	0 %	385777408
518	NC_017304	TGC	2	6	23001	23006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777408
519	NC_017304	TTG	2	6	23084	23089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777408
520	NC_017304	AT	3	6	23184	23189	50 %	50 %	0 %	0 %	385777408
521	NC_017304	TA	3	6	23203	23208	50 %	50 %	0 %	0 %	385777408
522	NC_017304	GGC	2	6	23238	23243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777408
523	NC_017304	GGAT	2	8	23317	23324	25 %	25 %	50 %	0 %	385777408
524	NC_017304	AGG	2	6	23348	23353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777408
525	NC_017304	ACA	2	6	23360	23365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777408
526	NC_017304	TTA	2	6	23435	23440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777408
527	NC_017304	TGG	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777408
528	NC_017304	TCT	2	6	23523	23528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777408
529	NC_017304	ATT	2	6	23576	23581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777408
530	NC_017304	CAG	2	6	23596	23601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777408
531	NC_017304	GAA	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777408
532	NC_017304	GAA	2	6	23669	23674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777408
533	NC_017304	T	6	6	23683	23688	0 %	100 %	0 %	0 %	385777408
534	NC_017304	GAA	2	6	23689	23694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777408
535	NC_017304	GAT	2	6	23704	23709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777408
536	NC_017304	TTG	2	6	23723	23728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777408
537	NC_017304	CGA	2	6	23766	23771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777408
538	NC_017304	A	6	6	23788	23793	100 %	0 %	0 %	0 %	385777408
539	NC_017304	TGA	2	6	23835	23840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777408
540	NC_017304	GGA	2	6	23911	23916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777408
541	NC_017304	TTA	2	6	23975	23980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777408
542	NC_017304	TGA	2	6	24018	24023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777408
543	NC_017304	GTT	2	6	24031	24036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777408
544	NC_017304	AG	3	6	24103	24108	50 %	0 %	50 %	0 %	385777408
545	NC_017304	AGG	2	6	24110	24115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777408
546	NC_017304	AAG	2	6	24140	24145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777409
547	NC_017304	A	7	7	24150	24156	100 %	0 %	0 %	0 %	385777409
548	NC_017304	TG	3	6	24185	24190	0 %	50 %	50 %	0 %	385777409
549	NC_017304	GTT	2	6	24275	24280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777409
550	NC_017304	TTCA	2	8	24328	24335	25 %	50 %	0 %	25 %	385777409
551	NC_017304	GAA	2	6	24396	24401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777409
552	NC_017304	A	6	6	24400	24405	100 %	0 %	0 %	0 %	385777409
553	NC_017304	GGT	2	6	24442	24447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777409
554	NC_017304	CGG	2	6	24450	24455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777409
555	NC_017304	TG	3	6	24519	24524	0 %	50 %	50 %	0 %	385777409
556	NC_017304	TCT	2	6	24565	24570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777409
557	NC_017304	AGA	2	6	24614	24619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777409
558	NC_017304	ATC	2	6	24668	24673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777409
559	NC_017304	ACA	2	6	24806	24811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777409
560	NC_017304	AT	3	6	24888	24893	50 %	50 %	0 %	0 %	385777409
561	NC_017304	AT	3	6	24984	24989	50 %	50 %	0 %	0 %	385777409
562	NC_017304	GAA	2	6	24994	24999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777409
563	NC_017304	AGAA	2	8	25004	25011	75 %	0 %	25 %	0 %	385777409
564	NC_017304	GA	3	6	25027	25032	50 %	0 %	50 %	0 %	385777409
565	NC_017304	A	6	6	25058	25063	100 %	0 %	0 %	0 %	385777409
566	NC_017304	ATA	2	6	25079	25084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017304	T	6	6	25134	25139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017304	ATT	2	6	25153	25158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017304	AAG	2	6	25196	25201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777410
570	NC_017304	A	6	6	25233	25238	100 %	0 %	0 %	0 %	385777410
571	NC_017304	CCA	2	6	25285	25290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385777410
572	NC_017304	T	8	8	25300	25307	0 %	100 %	0 %	0 %	385777410
573	NC_017304	ATT	2	6	25337	25342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017304	ATT	2	6	25351	25356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017304	ATT	2	6	25378	25383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017304	ATA	2	6	25414	25419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017304	TTA	2	6	25484	25489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777411
578	NC_017304	T	6	6	25511	25516	0 %	100 %	0 %	0 %	385777411
579	NC_017304	TA	4	8	25534	25541	50 %	50 %	0 %	0 %	385777411
580	NC_017304	TTA	2	6	25564	25569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777411
581	NC_017304	T	6	6	25606	25611	0 %	100 %	0 %	0 %	385777411
582	NC_017304	TAA	2	6	25665	25670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777411
583	NC_017304	TGA	2	6	25683	25688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777411
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585	NC_017304	AATT	2	8	25773	25780	50 %	50 %	0 %	0 %	385777411
586	NC_017304	AATAT	2	10	25782	25791	60 %	40 %	0 %	0 %	385777411
587	NC_017304	TAC	2	6	25824	25829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777411
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591	NC_017304	TGA	2	6	26013	26018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777411
592	NC_017304	ATA	2	6	26078	26083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777411
593	NC_017304	TAA	2	6	26085	26090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777411
594	NC_017304	GGA	2	6	26123	26128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777411
595	NC_017304	AAT	2	6	26195	26200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777411
596	NC_017304	A	7	7	26227	26233	100 %	0 %	0 %	0 %	385777411
597	NC_017304	AT	3	6	26293	26298	50 %	50 %	0 %	0 %	385777411
598	NC_017304	TAA	2	6	26316	26321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017304	ATT	2	6	26349	26354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017304	T	6	6	26363	26368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017304	T	6	6	26393	26398	0 %	100 %	0 %	0 %	385777412
602	NC_017304	TATC	2	8	26416	26423	25 %	50 %	0 %	25 %	385777412
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604	NC_017304	TATG	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	385777412
605	NC_017304	GGA	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777412
606	NC_017304	GGC	2	6	26573	26578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777412
607	NC_017304	TC	4	8	26604	26611	0 %	50 %	0 %	50 %	385777412
608	NC_017304	TA	3	6	26720	26725	50 %	50 %	0 %	0 %	385777412
609	NC_017304	TTGAT	2	10	26745	26754	20 %	60 %	20 %	0 %	385777412
610	NC_017304	GTC	2	6	26774	26779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777412
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612	NC_017304	ATA	2	6	26808	26813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777412
613	NC_017304	T	6	6	26823	26828	0 %	100 %	0 %	0 %	385777412
614	NC_017304	T	8	8	26849	26856	0 %	100 %	0 %	0 %	385777412
615	NC_017304	GCT	2	6	26886	26891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777412
616	NC_017304	TTGGA	2	10	26953	26962	20 %	40 %	40 %	0 %	385777412
617	NC_017304	T	6	6	27056	27061	0 %	100 %	0 %	0 %	385777412
618	NC_017304	AATT	2	8	27144	27151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017304	GTT	2	6	27157	27162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017304	TAAA	2	8	27167	27174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017304	A	6	6	27193	27198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017304	ACAA	2	8	27247	27254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_017304	AAT	2	6	27271	27276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017304	A	7	7	27295	27301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017304	AT	3	6	27306	27311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017304	TGT	2	6	27364	27369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017304	T	6	6	27396	27401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017304	AAAGT	2	10	27410	27419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017304	TAA	2	6	27427	27432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017304	T	7	7	27437	27443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017304	T	6	6	27518	27523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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