MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017301	T	6	6	208015	208020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017301	CTTT	2	8	208045	208052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_017301	ATC	2	6	208059	208064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017301	TCAC	2	8	208223	208230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_017301	GCT	2	6	208251	208256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017301	TGT	2	6	208259	208264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017301	CGG	2	6	208286	208291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017301	GGA	2	6	208317	208322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017301	CCA	2	6	208342	208347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_017301	CAG	2	6	208370	208375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017301	ATCT	2	8	208408	208415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_017301	ATC	2	6	208484	208489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017301	ACGA	2	8	208515	208522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_017301	GAC	2	6	208563	208568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017301	AAG	2	6	208578	208583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017301	GC	3	6	208699	208704	0 %	0 %	50 %	50 %	384505892
4017	NC_017301	TCG	2	6	208711	208716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505892
4018	NC_017301	CAT	2	6	208834	208839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505892
4019	NC_017301	G	6	6	208857	208862	0 %	0 %	100 %	0 %	384505892
4020	NC_017301	AGT	2	6	208926	208931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505892
4021	NC_017301	TG	3	6	208935	208940	0 %	50 %	50 %	0 %	384505892
4022	NC_017301	AGC	2	6	208957	208962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505892
4023	NC_017301	GT	3	6	208967	208972	0 %	50 %	50 %	0 %	384505892
4024	NC_017301	TGA	2	6	208980	208985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505892
4025	NC_017301	CA	3	6	209002	209007	50 %	0 %	0 %	50 %	384505892
4026	NC_017301	TGAT	2	8	209128	209135	25 %	50 %	25 %	0 %	384505892
4027	NC_017301	CTA	2	6	209158	209163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017301	CGG	2	6	209215	209220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017301	GTG	2	6	209238	209243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017301	CGG	2	6	209264	209269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017301	ATTG	2	8	209319	209326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017301	CTC	2	6	209360	209365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017301	TGC	2	6	209369	209374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017301	GGC	2	6	209462	209467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017301	ATC	2	6	209496	209501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017301	GCA	2	6	209552	209557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017301	CA	3	6	209600	209605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_017301	TGG	2	6	209633	209638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017301	TTG	2	6	209704	209709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017301	CTT	2	6	209804	209809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017301	GGT	2	6	209876	209881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017301	TGA	2	6	209921	209926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017301	TCA	2	6	209932	209937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017301	ACT	2	6	210009	210014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017301	CG	3	6	210095	210100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_017301	GCA	2	6	210166	210171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017301	TGG	2	6	210229	210234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017301	TCA	2	6	210247	210252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017301	CGG	2	6	210255	210260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017301	TTC	2	6	210294	210299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017301	TTG	2	6	210317	210322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017301	AAC	2	6	210435	210440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017301	AC	3	6	210453	210458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_017301	CAAA	2	8	210476	210483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_017301	CGAA	2	8	210571	210578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_017301	GC	3	6	210579	210584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_017301	GTA	2	6	210637	210642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017301	AAC	2	6	210643	210648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017301	GCAA	2	8	210839	210846	50 %	0 %	25 %	25 %	384505893
4060	NC_017301	ACA	2	6	210878	210883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505893
4061	NC_017301	GCA	2	6	210932	210937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505893
4062	NC_017301	TTC	2	6	210981	210986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505893
4063	NC_017301	GTC	2	6	210990	210995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505893
4064	NC_017301	GTG	2	6	211002	211007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505893
4065	NC_017301	GTC	2	6	211011	211016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505893
4066	NC_017301	GC	3	6	211105	211110	0 %	0 %	50 %	50 %	384505893
4067	NC_017301	AAT	2	6	211196	211201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505893
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4069	NC_017301	TTC	2	6	211354	211359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505893
4070	NC_017301	AAC	2	6	211593	211598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505893
4071	NC_017301	AGA	2	6	211616	211621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505894
4072	NC_017301	ACC	2	6	211636	211641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505894
4073	NC_017301	GGA	2	6	211707	211712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505894
4074	NC_017301	TCGC	2	8	211763	211770	0 %	25 %	25 %	50 %	384505894
4075	NC_017301	GAC	2	6	211888	211893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505894
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4077	NC_017301	GAA	2	6	211927	211932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505894
4078	NC_017301	CAGGC	2	10	212006	212015	20 %	0 %	40 %	40 %	384505894
4079	NC_017301	GCG	2	6	212047	212052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505894
4080	NC_017301	GCT	2	6	212073	212078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017301	AGC	2	6	212097	212102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4082	NC_017301	TGT	2	6	212103	212108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505895
4083	NC_017301	GTC	2	6	212123	212128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4084	NC_017301	GTT	2	6	212144	212149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505895
4085	NC_017301	TGG	2	6	212185	212190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505895
4086	NC_017301	TCT	2	6	212391	212396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505895
4087	NC_017301	TTGTA	2	10	212416	212425	20 %	60 %	20 %	0 %	384505895
4088	NC_017301	TGC	2	6	212444	212449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4089	NC_017301	GCG	2	6	212466	212471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
4090	NC_017301	CGGG	2	8	212484	212491	0 %	0 %	75 %	25 %	384505895
4091	NC_017301	TCG	2	6	212493	212498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4092	NC_017301	CCG	2	6	212499	212504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505895
4093	NC_017301	GA	3	6	212527	212532	50 %	0 %	50 %	0 %	384505895
4094	NC_017301	GTT	2	6	212559	212564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505895
4095	NC_017301	AT	3	6	212577	212582	50 %	50 %	0 %	0 %	384505895
4096	NC_017301	GTG	2	6	212640	212645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505895
4097	NC_017301	GGC	2	6	212654	212659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
4098	NC_017301	TGA	2	6	212710	212715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505895
4099	NC_017301	GGTC	2	8	212812	212819	0 %	25 %	50 %	25 %	384505895
4100	NC_017301	CAC	2	6	212844	212849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505895
4101	NC_017301	AGC	2	6	212870	212875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4102	NC_017301	GCC	2	6	213170	213175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505895
4103	NC_017301	GGC	2	6	213248	213253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
4104	NC_017301	CCA	2	6	213295	213300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505895
4105	NC_017301	GGA	2	6	213302	213307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505895
4106	NC_017301	GAA	2	6	213316	213321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505895
4107	NC_017301	GAA	2	6	213360	213365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505895
4108	NC_017301	GAT	2	6	213404	213409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505895
4109	NC_017301	GGT	2	6	213497	213502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505895
4110	NC_017301	T	6	6	213548	213553	0 %	100 %	0 %	0 %	384505895
4111	NC_017301	GCG	2	6	213600	213605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
4112	NC_017301	G	6	6	213628	213633	0 %	0 %	100 %	0 %	384505895
4113	NC_017301	CTT	3	9	213673	213681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505895
4114	NC_017301	TCA	2	6	213697	213702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505895
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4116	NC_017301	TGC	3	9	213851	213859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4117	NC_017301	GTT	2	6	213875	213880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505895
4118	NC_017301	GCG	2	6	213996	214001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
4119	NC_017301	TCG	2	6	214008	214013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4120	NC_017301	AAG	2	6	214031	214036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505895
4121	NC_017301	CG	3	6	214115	214120	0 %	0 %	50 %	50 %	384505895
4122	NC_017301	GAC	2	6	214178	214183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4123	NC_017301	CTGT	2	8	214195	214202	0 %	50 %	25 %	25 %	384505895
4124	NC_017301	TGG	2	6	214279	214284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505895
4125	NC_017301	TTG	2	6	214333	214338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505895
4126	NC_017301	GTGC	2	8	214344	214351	0 %	25 %	50 %	25 %	384505895
4127	NC_017301	CTG	2	6	214408	214413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505895
4128	NC_017301	GCG	2	6	214422	214427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505895
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4130	NC_017301	AGG	2	6	214638	214643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_017301	TGA	2	6	214839	214844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505896
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4233	NC_017301	TCC	2	6	220257	220262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4482	NC_017301	CTT	2	6	232064	232069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505918
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4485	NC_017301	TGGCT	2	10	232161	232170	0 %	40 %	40 %	20 %	384505918
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4489	NC_017301	T	7	7	232322	232328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_017301	AC	3	6	232359	232364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4491	NC_017301	TGG	2	6	232396	232401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4492	NC_017301	GTG	2	6	232446	232451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4496	NC_017301	CCG	2	6	232793	232798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4497	NC_017301	T	6	6	232806	232811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_017301	G	6	6	232832	232837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_017301	TTA	2	6	232861	232866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_017301	GTA	2	6	232900	232905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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