MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017301	TACGC	2	10	156344	156353	20 %	20 %	20 %	40 %	384505849
3002	NC_017301	TGAA	2	8	156456	156463	50 %	25 %	25 %	0 %	384505849
3003	NC_017301	CAG	2	6	156507	156512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505849
3004	NC_017301	CG	3	6	156595	156600	0 %	0 %	50 %	50 %	384505849
3005	NC_017301	CGG	2	6	156608	156613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505849
3006	NC_017301	CAA	2	6	156703	156708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505849
3007	NC_017301	GGT	2	6	156747	156752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017301	ACC	2	6	156773	156778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_017301	TCC	2	6	156811	156816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017301	GCT	2	6	156846	156851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505850
3011	NC_017301	CAG	2	6	156864	156869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505850
3012	NC_017301	TTCA	2	8	156903	156910	25 %	50 %	0 %	25 %	384505850
3013	NC_017301	CAT	2	6	156911	156916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505850
3014	NC_017301	TCC	2	6	156940	156945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505850
3015	NC_017301	TGG	2	6	157024	157029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505850
3016	NC_017301	GT	3	6	157033	157038	0 %	50 %	50 %	0 %	384505850
3017	NC_017301	T	6	6	157080	157085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017301	TG	3	6	157106	157111	0 %	50 %	50 %	0 %	384505851
3019	NC_017301	ACC	2	6	157135	157140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505851
3020	NC_017301	AT	3	6	157176	157181	50 %	50 %	0 %	0 %	384505851
3021	NC_017301	ATGC	2	8	157252	157259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_017301	G	6	6	157267	157272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017301	AGA	2	6	157288	157293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017301	TCG	2	6	157355	157360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505852
3025	NC_017301	TGG	2	6	157578	157583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505852
3026	NC_017301	CGG	2	6	157626	157631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505852
3027	NC_017301	GTG	2	6	157694	157699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505852
3028	NC_017301	CGGC	2	8	157793	157800	0 %	0 %	50 %	50 %	384505852
3029	NC_017301	TGC	2	6	157804	157809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505852
3030	NC_017301	GCC	2	6	157819	157824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505852
3031	NC_017301	CTG	2	6	157842	157847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505852
3032	NC_017301	CGT	2	6	157989	157994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505852
3033	NC_017301	GGA	2	6	158019	158024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505852
3034	NC_017301	GTCA	2	8	158041	158048	25 %	25 %	25 %	25 %	384505852
3035	NC_017301	AG	3	6	158238	158243	50 %	0 %	50 %	0 %	384505853
3036	NC_017301	CTC	2	6	158253	158258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505853
3037	NC_017301	AG	3	6	158280	158285	50 %	0 %	50 %	0 %	384505853
3038	NC_017301	TGC	2	6	158407	158412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505853
3039	NC_017301	TCG	2	6	158446	158451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505853
3040	NC_017301	GCG	2	6	158567	158572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505853
3041	NC_017301	CCT	2	6	158576	158581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505853
3042	NC_017301	CGA	2	6	158607	158612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505853
3043	NC_017301	GA	3	6	158627	158632	50 %	0 %	50 %	0 %	384505853
3044	NC_017301	CGT	2	6	158723	158728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505853
3045	NC_017301	CGT	2	6	158813	158818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505853
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3048	NC_017301	GC	3	6	158899	158904	0 %	0 %	50 %	50 %	384505853
3049	NC_017301	TTG	2	6	158911	158916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505853
3050	NC_017301	GAG	2	6	158955	158960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505853
3051	NC_017301	ATG	2	6	158969	158974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505853
3052	NC_017301	CGG	2	6	158993	158998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505853
3053	NC_017301	GAT	2	6	159063	159068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505853
3054	NC_017301	CGC	2	6	159086	159091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505853
3055	NC_017301	GTTG	2	8	159096	159103	0 %	50 %	50 %	0 %	384505853
3056	NC_017301	GGT	2	6	159144	159149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505853
3057	NC_017301	AG	3	6	159202	159207	50 %	0 %	50 %	0 %	384505853
3058	NC_017301	GCC	2	6	159243	159248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505853
3059	NC_017301	GTC	2	6	159359	159364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505854
3060	NC_017301	TCGC	2	8	159366	159373	0 %	25 %	25 %	50 %	384505854
3061	NC_017301	CATG	2	8	159448	159455	25 %	25 %	25 %	25 %	384505854
3062	NC_017301	CAA	2	6	159463	159468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505854
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3067	NC_017301	TGC	2	6	159810	159815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505854
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3069	NC_017301	AAC	2	6	159908	159913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505854
3070	NC_017301	CGG	2	6	159987	159992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505854
3071	NC_017301	GCG	2	6	160029	160034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505854
3072	NC_017301	TCT	2	6	160167	160172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505854
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3074	NC_017301	TTGT	2	8	160315	160322	0 %	75 %	25 %	0 %	384505854
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3076	NC_017301	GGT	2	6	160563	160568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017301	TGG	2	6	160571	160576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017301	ATCA	2	8	160740	160747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3081	NC_017301	ATAC	2	8	160813	160820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_017301	CAGG	2	8	160833	160840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_017301	CGG	2	6	160877	160882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017301	GTT	2	6	160896	160901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_017301	GTAG	2	8	160947	160954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017301	ATA	2	6	161030	161035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017301	TTC	2	6	161101	161106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017301	GGTTG	2	10	161114	161123	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017301	CAC	2	6	161208	161213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_017301	GCT	2	6	161215	161220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017301	TGG	2	6	161225	161230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017301	CCG	2	6	161259	161264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505855
3095	NC_017301	GTAA	2	8	161287	161294	50 %	25 %	25 %	0 %	384505855
3096	NC_017301	AT	3	6	161348	161353	50 %	50 %	0 %	0 %	384505855
3097	NC_017301	TCG	2	6	161369	161374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505855
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3101	NC_017301	CCTTG	2	10	161490	161499	0 %	40 %	20 %	40 %	384505855
3102	NC_017301	GCA	2	6	161513	161518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505855
3103	NC_017301	GCG	2	6	161546	161551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505855
3104	NC_017301	CTG	2	6	161569	161574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505855
3105	NC_017301	CGC	2	6	161640	161645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505855
3106	NC_017301	GGA	2	6	161674	161679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505855
3107	NC_017301	GGTC	2	8	161718	161725	0 %	25 %	50 %	25 %	384505855
3108	NC_017301	CGC	2	6	161742	161747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505855
3109	NC_017301	TCC	2	6	161852	161857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505855
3110	NC_017301	TTA	2	6	161918	161923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505855
3111	NC_017301	CGC	2	6	161967	161972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505855
3112	NC_017301	CGG	2	6	162023	162028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505855
3113	NC_017301	CGG	3	9	162180	162188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505855
3114	NC_017301	GAT	2	6	162229	162234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505855
3115	NC_017301	TGA	3	9	162324	162332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505855
3116	NC_017301	ACT	2	6	162365	162370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505855
3117	NC_017301	CTT	2	6	162381	162386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505855
3118	NC_017301	TGA	2	6	162474	162479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505855
3119	NC_017301	CGG	2	6	162483	162488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505855
3120	NC_017301	T	6	6	162503	162508	0 %	100 %	0 %	0 %	384505855
3121	NC_017301	ACA	2	6	162533	162538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505855
3122	NC_017301	GAT	2	6	162685	162690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505855
3123	NC_017301	CGT	2	6	162782	162787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505855
3124	NC_017301	TGG	2	6	162870	162875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505855
3125	NC_017301	T	6	6	162906	162911	0 %	100 %	0 %	0 %	384505855
3126	NC_017301	GCA	2	6	162920	162925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505855
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3131	NC_017301	CGGC	2	8	163114	163121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_017301	T	6	6	163156	163161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017301	CGC	2	6	163174	163179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3135	NC_017301	GCATA	2	10	163214	163223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3154	NC_017301	ATGC	2	8	164305	164312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3155	NC_017301	GAG	2	6	164348	164353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3157	NC_017301	TGG	2	6	164405	164410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_017301	TGTGC	2	10	164437	164446	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3159	NC_017301	GAG	2	6	164501	164506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3235	NC_017301	ATC	2	6	168736	168741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505860
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3239	NC_017301	GGATG	2	10	168849	168858	20 %	20 %	60 %	0 %	384505860
3240	NC_017301	GCC	2	6	168893	168898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505860
3241	NC_017301	GTT	2	6	168937	168942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505860
3242	NC_017301	GGTG	2	8	168948	168955	0 %	25 %	75 %	0 %	384505860
3243	NC_017301	GGCT	2	8	168989	168996	0 %	25 %	50 %	25 %	384505860
3244	NC_017301	GATG	2	8	169195	169202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_017301	AAT	2	6	169215	169220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_017301	ATT	2	6	169327	169332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_017301	AAG	2	6	169480	169485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3489	NC_017301	CCT	2	6	182531	182536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3490	NC_017301	ATT	2	6	182555	182560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_017301	TGGGGC	2	12	182617	182628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3492	NC_017301	TG	3	6	182640	182645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_017301	GTG	2	6	182661	182666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_017301	TGC	2	6	182670	182675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_017301	TGACTA	2	12	182717	182728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384505868
3496	NC_017301	CGT	2	6	182736	182741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3497	NC_017301	GAG	2	6	182785	182790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505868
3498	NC_017301	T	6	6	182817	182822	0 %	100 %	0 %	0 %	384505868
3499	NC_017301	CTG	2	6	182837	182842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3500	NC_017301	TC	3	6	182908	182913	0 %	50 %	0 %	50 %	384505868

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