MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_017301	CTG	2	6	1646679	1646684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507193
31002	NC_017301	CCG	2	6	1646694	1646699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507193
31003	NC_017301	TGGC	2	8	1646750	1646757	0 %	25 %	50 %	25 %	384507193
31004	NC_017301	CTG	2	6	1646769	1646774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507193
31005	NC_017301	GC	3	6	1646800	1646805	0 %	0 %	50 %	50 %	384507193
31006	NC_017301	ACG	2	6	1646821	1646826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507193
31007	NC_017301	CCA	2	6	1646841	1646846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507193
31008	NC_017301	GCT	2	6	1646894	1646899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507193
31009	NC_017301	CG	3	6	1646907	1646912	0 %	0 %	50 %	50 %	384507193
31010	NC_017301	TCT	2	6	1646945	1646950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507193
31011	NC_017301	GCC	2	6	1647047	1647052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507193
31012	NC_017301	AAC	2	6	1647073	1647078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507193
31013	NC_017301	CCCT	2	8	1647278	1647285	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31014	NC_017301	GCT	2	6	1647375	1647380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507194
31015	NC_017301	AAAG	2	8	1647429	1647436	75 %	0 %	25 %	0 %	384507194
31016	NC_017301	AGC	2	6	1647601	1647606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507194
31017	NC_017301	ATGG	2	8	1647635	1647642	25 %	25 %	50 %	0 %	384507195
31018	NC_017301	AAG	2	6	1647654	1647659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507195
31019	NC_017301	ATC	2	6	1647665	1647670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507195
31020	NC_017301	AAT	2	6	1647734	1647739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507195
31021	NC_017301	AC	3	6	1647745	1647750	50 %	0 %	0 %	50 %	384507195
31022	NC_017301	CG	3	6	1647766	1647771	0 %	0 %	50 %	50 %	384507195
31023	NC_017301	AGC	2	6	1647845	1647850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507195
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31025	NC_017301	TGT	2	6	1647886	1647891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507195
31026	NC_017301	TACT	2	8	1647936	1647943	25 %	50 %	0 %	25 %	384507195
31027	NC_017301	CCCA	2	8	1647948	1647955	25 %	0 %	0 %	75 %	384507195
31028	NC_017301	TGT	2	6	1647961	1647966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507195
31029	NC_017301	ACC	2	6	1648004	1648009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507195
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31031	NC_017301	GC	3	6	1648032	1648037	0 %	0 %	50 %	50 %	384507195
31032	NC_017301	ATG	2	6	1648172	1648177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507195
31033	NC_017301	TGA	2	6	1648221	1648226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507195
31034	NC_017301	TGA	2	6	1648306	1648311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507195
31035	NC_017301	CCA	2	6	1648341	1648346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507195
31036	NC_017301	TCCT	2	8	1648379	1648386	0 %	50 %	0 %	50 %	384507195
31037	NC_017301	TAC	2	6	1648406	1648411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507195
31038	NC_017301	CAG	2	6	1648435	1648440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31039	NC_017301	TCG	2	6	1648547	1648552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507196
31040	NC_017301	ACG	2	6	1648565	1648570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507196
31041	NC_017301	CCGTT	2	10	1648599	1648608	0 %	40 %	20 %	40 %	384507196
31042	NC_017301	GC	3	6	1648631	1648636	0 %	0 %	50 %	50 %	384507196
31043	NC_017301	T	7	7	1648762	1648768	0 %	100 %	0 %	0 %	384507196
31044	NC_017301	TTCC	2	8	1648773	1648780	0 %	50 %	0 %	50 %	384507196
31045	NC_017301	AC	3	6	1648963	1648968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31046	NC_017301	CGGT	2	8	1649065	1649072	0 %	25 %	50 %	25 %	384507197
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31049	NC_017301	AAG	2	6	1649322	1649327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507197
31050	NC_017301	TCG	2	6	1649431	1649436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507197
31051	NC_017301	TTC	3	9	1649463	1649471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507197
31052	NC_017301	CAG	3	9	1649474	1649482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507197
31053	NC_017301	AGA	2	6	1649502	1649507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507197
31054	NC_017301	CAGC	2	8	1649666	1649673	25 %	0 %	25 %	50 %	384507197
31055	NC_017301	CTAG	2	8	1649686	1649693	25 %	25 %	25 %	25 %	384507197
31056	NC_017301	TCCTA	2	10	1649805	1649814	20 %	40 %	0 %	40 %	384507198
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31061	NC_017301	ACC	2	6	1650089	1650094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507198
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31067	NC_017301	ACG	2	6	1650495	1650500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507198
31068	NC_017301	GATCA	2	10	1650503	1650512	40 %	20 %	20 %	20 %	384507198
31069	NC_017301	GTCT	2	8	1650583	1650590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31070	NC_017301	GT	3	6	1650645	1650650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31071	NC_017301	CCG	2	6	1650653	1650658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31072	NC_017301	CAA	2	6	1650944	1650949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31073	NC_017301	TA	3	6	1651041	1651046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31074	NC_017301	TCT	2	6	1651048	1651053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31077	NC_017301	CTT	2	6	1651232	1651237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31078	NC_017301	CAT	2	6	1651242	1651247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31079	NC_017301	TC	3	6	1651261	1651266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31080	NC_017301	TAGG	2	8	1651307	1651314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31084	NC_017301	A	6	6	1651568	1651573	100 %	0 %	0 %	0 %	384507199
31085	NC_017301	AGCA	2	8	1651579	1651586	50 %	0 %	25 %	25 %	384507199
31086	NC_017301	GCA	2	6	1651743	1651748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507200
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31091	NC_017301	CTA	2	6	1652015	1652020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507200
31092	NC_017301	GCC	2	6	1652022	1652027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507200
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31094	NC_017301	CGT	2	6	1652341	1652346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31095	NC_017301	CGCGA	2	10	1652383	1652392	20 %	0 %	40 %	40 %	384507201
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31101	NC_017301	AGA	2	6	1652879	1652884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507201
31102	NC_017301	ATA	2	6	1653004	1653009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507201
31103	NC_017301	CG	3	6	1653012	1653017	0 %	0 %	50 %	50 %	384507201
31104	NC_017301	CGA	2	6	1653052	1653057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31105	NC_017301	AAT	2	6	1653131	1653136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507201
31106	NC_017301	AGC	2	6	1653287	1653292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31107	NC_017301	GGCC	2	8	1653298	1653305	0 %	0 %	50 %	50 %	384507201
31108	NC_017301	TCA	2	6	1653306	1653311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507201
31109	NC_017301	ATC	2	6	1653350	1653355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507201
31110	NC_017301	CTC	2	6	1653386	1653391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507201
31111	NC_017301	GCAT	2	8	1653438	1653445	25 %	25 %	25 %	25 %	384507201
31112	NC_017301	CCA	3	9	1653469	1653477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507201
31113	NC_017301	TCTT	2	8	1653501	1653508	0 %	75 %	0 %	25 %	384507201
31114	NC_017301	CCAAA	2	10	1653517	1653526	60 %	0 %	0 %	40 %	384507201
31115	NC_017301	ACG	2	6	1653659	1653664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31116	NC_017301	GCA	2	6	1653745	1653750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31117	NC_017301	TGC	2	6	1653810	1653815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31118	NC_017301	ACG	2	6	1653920	1653925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507201
31119	NC_017301	CTC	2	6	1653938	1653943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507201
31120	NC_017301	GC	3	6	1653947	1653952	0 %	0 %	50 %	50 %	384507201
31121	NC_017301	CTCCAT	2	12	1654034	1654045	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384507201
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31222	NC_017301	GAC	2	6	1659383	1659388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31224	NC_017301	CG	3	6	1659409	1659414	0 %	0 %	50 %	50 %	384507207
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31235	NC_017301	TTC	2	6	1659953	1659958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507207
31236	NC_017301	TCCAAT	2	12	1659960	1659971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507207
31237	NC_017301	CGGAGC	2	12	1659992	1660003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384507207
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31240	NC_017301	AGA	2	6	1660205	1660210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507207
31241	NC_017301	ATGA	2	8	1660269	1660276	50 %	25 %	25 %	0 %	384507207
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31247	NC_017301	CGC	2	6	1660517	1660522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507207
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31251	NC_017301	GCA	2	6	1660856	1660861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507207
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31254	NC_017301	GGC	2	6	1661096	1661101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507207
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31321	NC_017301	TCAA	2	8	1664228	1664235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31322	NC_017301	TCG	2	6	1664444	1664449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507212
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31337	NC_017301	AGACA	2	10	1665073	1665082	60 %	0 %	20 %	20 %	384507213
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31352	NC_017301	CAG	2	6	1665916	1665921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507214
31353	NC_017301	CTT	2	6	1665934	1665939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507214
31354	NC_017301	AGCT	2	8	1665971	1665978	25 %	25 %	25 %	25 %	384507214
31355	NC_017301	GCG	2	6	1666027	1666032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507214
31356	NC_017301	AT	3	6	1666071	1666076	50 %	50 %	0 %	0 %	384507214
31357	NC_017301	ATA	2	6	1666105	1666110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507214
31358	NC_017301	TG	3	6	1666138	1666143	0 %	50 %	50 %	0 %	384507214
31359	NC_017301	TCA	2	6	1666159	1666164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507214
31360	NC_017301	CGT	2	6	1666198	1666203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507214
31361	NC_017301	GCA	2	6	1666218	1666223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507214
31362	NC_017301	CACG	2	8	1666267	1666274	25 %	0 %	25 %	50 %	384507214
31363	NC_017301	TCA	3	9	1666323	1666331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507214
31364	NC_017301	AGCGCA	2	12	1666365	1666376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507214
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31366	NC_017301	AGAA	2	8	1666508	1666515	75 %	0 %	25 %	0 %	384507214
31367	NC_017301	TCTTT	2	10	1666536	1666545	0 %	80 %	0 %	20 %	384507214
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31370	NC_017301	TCC	2	6	1666685	1666690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507215
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31388	NC_017301	GTC	2	6	1667867	1667872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507216
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31461	NC_017301	GAT	2	6	1671691	1671696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507220
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31465	NC_017301	CGA	2	6	1671840	1671845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507220
31466	NC_017301	CATC	2	8	1671876	1671883	25 %	25 %	0 %	50 %	384507220
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31468	NC_017301	CGCGCC	2	12	1671995	1672006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507221
31469	NC_017301	TTC	2	6	1672021	1672026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507221
31470	NC_017301	GTC	2	6	1672030	1672035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507221
31471	NC_017301	CTG	2	6	1672080	1672085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507221
31472	NC_017301	AAGT	2	8	1672086	1672093	50 %	25 %	25 %	0 %	384507221
31473	NC_017301	TCT	2	6	1672109	1672114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507221
31474	NC_017301	GAA	2	6	1672122	1672127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507221
31475	NC_017301	TCC	2	6	1672159	1672164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507221
31476	NC_017301	ACC	2	6	1672196	1672201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507221
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31480	NC_017301	GATC	2	8	1672416	1672423	25 %	25 %	25 %	25 %	384507221
31481	NC_017301	GAA	2	6	1672443	1672448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507221
31482	NC_017301	AGGT	2	8	1672544	1672551	25 %	25 %	50 %	0 %	384507221
31483	NC_017301	CG	3	6	1672658	1672663	0 %	0 %	50 %	50 %	384507221
31484	NC_017301	ATG	2	6	1672664	1672669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507221
31485	NC_017301	GCGA	2	8	1672804	1672811	25 %	0 %	50 %	25 %	384507221
31486	NC_017301	TCG	2	6	1672898	1672903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507221
31487	NC_017301	TGC	2	6	1672928	1672933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507221
31488	NC_017301	ATCT	2	8	1672936	1672943	25 %	50 %	0 %	25 %	384507221
31489	NC_017301	TGA	2	6	1672956	1672961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507221
31490	NC_017301	TTG	2	6	1672990	1672995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507221
31491	NC_017301	GTT	2	6	1673031	1673036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31492	NC_017301	CTGT	2	8	1673039	1673046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31493	NC_017301	CGA	2	6	1673093	1673098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507222
31494	NC_017301	CG	3	6	1673146	1673151	0 %	0 %	50 %	50 %	384507222
31495	NC_017301	TTC	2	6	1673175	1673180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507222
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31497	NC_017301	CTG	2	6	1673256	1673261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507222
31498	NC_017301	GCA	2	6	1673273	1673278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507222
31499	NC_017301	TCG	2	6	1673348	1673353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507222
31500	NC_017301	CGT	2	6	1673365	1673370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507222

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