MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017301	CTA	2	6	130299	130304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505825
2503	NC_017301	GGTGTA	2	12	130352	130363	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384505825
2504	NC_017301	CGT	2	6	130402	130407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505825
2505	NC_017301	CTT	2	6	130486	130491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505825
2506	NC_017301	CTG	2	6	130626	130631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505825
2507	NC_017301	TGC	2	6	130657	130662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505825
2508	NC_017301	CCG	2	6	130741	130746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505825
2509	NC_017301	GCG	2	6	130782	130787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505825
2510	NC_017301	A	6	6	130801	130806	100 %	0 %	0 %	0 %	384505825
2511	NC_017301	TA	3	6	130876	130881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017301	TTAAG	2	10	130892	130901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_017301	TG	3	6	130951	130956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_017301	TC	3	6	131071	131076	0 %	50 %	0 %	50 %	384505826
2515	NC_017301	TAT	2	6	131081	131086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505826
2516	NC_017301	CAT	2	6	131087	131092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505826
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2519	NC_017301	CAA	2	6	131180	131185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505826
2520	NC_017301	GA	3	6	131242	131247	50 %	0 %	50 %	0 %	384505826
2521	NC_017301	GCC	2	6	131259	131264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505826
2522	NC_017301	CGG	2	6	131329	131334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505826
2523	NC_017301	GCG	2	6	131358	131363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505826
2524	NC_017301	GTGCG	2	10	131432	131441	0 %	20 %	60 %	20 %	384505826
2525	NC_017301	CAA	2	6	131477	131482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505826
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2529	NC_017301	CGT	2	6	131662	131667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505826
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2531	NC_017301	TGG	2	6	131698	131703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505826
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2533	NC_017301	GAG	3	9	131874	131882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505826
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2537	NC_017301	G	6	6	132105	132110	0 %	0 %	100 %	0 %	384505826
2538	NC_017301	G	6	6	132158	132163	0 %	0 %	100 %	0 %	384505826
2539	NC_017301	CGG	2	6	132221	132226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505826
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2541	NC_017301	GCG	2	6	132277	132282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505826
2542	NC_017301	GAT	2	6	132318	132323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505826
2543	NC_017301	T	6	6	132323	132328	0 %	100 %	0 %	0 %	384505826
2544	NC_017301	GAT	2	6	132379	132384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505826
2545	NC_017301	GGTG	2	8	132407	132414	0 %	25 %	75 %	0 %	384505826
2546	NC_017301	TCT	2	6	132439	132444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_017301	ATT	2	6	132472	132477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505827
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2549	NC_017301	TTGA	2	8	132728	132735	25 %	50 %	25 %	0 %	384505827
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2552	NC_017301	GTTT	2	8	132904	132911	0 %	75 %	25 %	0 %	384505827
2553	NC_017301	GAT	2	6	132964	132969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505827
2554	NC_017301	GCA	2	6	133056	133061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505827
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2564	NC_017301	GGCA	2	8	133738	133745	25 %	0 %	50 %	25 %	384505828
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2571	NC_017301	CTC	2	6	134190	134195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505829
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2573	NC_017301	CGT	2	6	134231	134236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505829
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2582	NC_017301	GCG	2	6	134890	134895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505829
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2590	NC_017301	GAT	2	6	135286	135291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505830
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2593	NC_017301	AGACG	2	10	135420	135429	40 %	0 %	40 %	20 %	384505830
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2598	NC_017301	GGGGC	2	10	135638	135647	0 %	0 %	80 %	20 %	384505831
2599	NC_017301	TCG	2	6	135653	135658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505831
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2603	NC_017301	GTG	2	6	135876	135881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505831
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2606	NC_017301	T	7	7	135959	135965	0 %	100 %	0 %	0 %	384505831
2607	NC_017301	CGC	2	6	136086	136091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_017301	A	6	6	136179	136184	100 %	0 %	0 %	0 %	384505832
2609	NC_017301	CGC	2	6	136248	136253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505832
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2612	NC_017301	TCG	2	6	136446	136451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_017301	TGGT	2	8	136500	136507	0 %	50 %	50 %	0 %	384505833
2614	NC_017301	TGCT	2	8	136528	136535	0 %	50 %	25 %	25 %	384505833
2615	NC_017301	GGT	2	6	136542	136547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505833
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2617	NC_017301	CAAT	2	8	136588	136595	50 %	25 %	0 %	25 %	384505833
2618	NC_017301	A	6	6	136649	136654	100 %	0 %	0 %	0 %	384505833
2619	NC_017301	GAA	2	6	136713	136718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505833
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2622	NC_017301	TGC	2	6	136825	136830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2623	NC_017301	TGG	2	6	136852	136857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505833
2624	NC_017301	GAG	2	6	136872	136877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505833
2625	NC_017301	GCG	2	6	137004	137009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505833
2626	NC_017301	CGATC	2	10	137066	137075	20 %	20 %	20 %	40 %	384505833
2627	NC_017301	GCC	2	6	137115	137120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505833
2628	NC_017301	ATC	2	6	137121	137126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505833
2629	NC_017301	GC	3	6	137143	137148	0 %	0 %	50 %	50 %	384505833
2630	NC_017301	GCT	2	6	137154	137159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2631	NC_017301	CAT	2	6	137180	137185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505833
2632	NC_017301	CAT	2	6	137210	137215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505833
2633	NC_017301	TAA	2	6	137240	137245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505833
2634	NC_017301	TGA	2	6	137266	137271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505833
2635	NC_017301	TGGCC	2	10	137273	137282	0 %	20 %	40 %	40 %	384505833
2636	NC_017301	TATT	2	8	137302	137309	25 %	75 %	0 %	0 %	384505833
2637	NC_017301	TTAC	2	8	137331	137338	25 %	50 %	0 %	25 %	384505833
2638	NC_017301	TGG	2	6	137425	137430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505833
2639	NC_017301	TATT	2	8	137491	137498	25 %	75 %	0 %	0 %	384505833
2640	NC_017301	A	7	7	137583	137589	100 %	0 %	0 %	0 %	384505833
2641	NC_017301	TGGTG	2	10	137651	137660	0 %	40 %	60 %	0 %	384505833
2642	NC_017301	CA	3	6	137756	137761	50 %	0 %	0 %	50 %	384505833
2643	NC_017301	TTG	2	6	137821	137826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505833
2644	NC_017301	GAG	2	6	137901	137906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505833
2645	NC_017301	AGC	2	6	137918	137923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2646	NC_017301	GGC	2	6	138017	138022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505833
2647	NC_017301	GAT	2	6	138057	138062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505833
2648	NC_017301	GCT	2	6	138086	138091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2649	NC_017301	CAG	2	6	138096	138101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2650	NC_017301	GGAGT	2	10	138123	138132	20 %	20 %	60 %	0 %	384505833
2651	NC_017301	GTG	2	6	138213	138218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505833
2652	NC_017301	ATC	2	6	138228	138233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505833
2653	NC_017301	TTG	2	6	138291	138296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505833
2654	NC_017301	GCG	2	6	138478	138483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505833
2655	NC_017301	GAA	2	6	138519	138524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505833
2656	NC_017301	TGT	2	6	138527	138532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505833
2657	NC_017301	AGT	2	6	138557	138562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505833
2658	NC_017301	GCG	2	6	138570	138575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505833
2659	NC_017301	TTG	2	6	138595	138600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505833
2660	NC_017301	TTA	2	6	138625	138630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505833
2661	NC_017301	TGC	2	6	138785	138790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505833
2662	NC_017301	TGG	2	6	138862	138867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_017301	ATG	2	6	138922	138927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505834
2664	NC_017301	CGCC	2	8	138985	138992	0 %	0 %	25 %	75 %	384505834
2665	NC_017301	CCG	2	6	139035	139040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505834
2666	NC_017301	TTCG	2	8	139045	139052	0 %	50 %	25 %	25 %	384505834
2667	NC_017301	ATC	2	6	139084	139089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505834
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2670	NC_017301	TGC	2	6	139136	139141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505834
2671	NC_017301	CCTA	2	8	139161	139168	25 %	25 %	0 %	50 %	384505834
2672	NC_017301	TGA	2	6	139192	139197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505834
2673	NC_017301	GAA	2	6	139248	139253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505834
2674	NC_017301	GAA	2	6	139268	139273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505834
2675	NC_017301	TGA	2	6	139409	139414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505834
2676	NC_017301	GATA	2	8	139427	139434	50 %	25 %	25 %	0 %	384505834
2677	NC_017301	CGC	2	6	139641	139646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505834
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2679	NC_017301	AGAAAA	2	12	139679	139690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384505834
2680	NC_017301	TCG	2	6	139702	139707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505834
2681	NC_017301	CGA	2	6	139718	139723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505834
2682	NC_017301	CTT	2	6	139749	139754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505834
2683	NC_017301	GTG	2	6	139843	139848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505834
2684	NC_017301	GGT	2	6	139929	139934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505834
2685	NC_017301	CG	3	6	139953	139958	0 %	0 %	50 %	50 %	384505834
2686	NC_017301	ATC	2	6	139966	139971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505834
2687	NC_017301	ATA	2	6	140047	140052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505834
2688	NC_017301	AGGT	2	8	140124	140131	25 %	25 %	50 %	0 %	384505834
2689	NC_017301	GTG	2	6	140147	140152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2690	NC_017301	TCA	2	6	140206	140211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505835
2691	NC_017301	GAA	2	6	140320	140325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505835
2692	NC_017301	CCTA	2	8	140326	140333	25 %	25 %	0 %	50 %	384505835
2693	NC_017301	AGG	2	6	140417	140422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505835
2694	NC_017301	GAG	2	6	140494	140499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505835
2695	NC_017301	CGT	2	6	140500	140505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505835
2696	NC_017301	CCT	2	6	140561	140566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505835
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2698	NC_017301	GGC	2	6	140587	140592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505835
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2700	NC_017301	GCA	2	6	140637	140642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505835
2701	NC_017301	GCT	2	6	140683	140688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505835
2702	NC_017301	GTA	2	6	140704	140709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505835
2703	NC_017301	TCT	2	6	140721	140726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505835
2704	NC_017301	TTC	2	6	140727	140732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505835
2705	NC_017301	AT	3	6	140784	140789	50 %	50 %	0 %	0 %	384505835
2706	NC_017301	TGAC	2	8	140864	140871	25 %	25 %	25 %	25 %	384505835
2707	NC_017301	CG	3	6	140957	140962	0 %	0 %	50 %	50 %	384505835
2708	NC_017301	TTG	2	6	141004	141009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2709	NC_017301	TGCG	2	8	141056	141063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2710	NC_017301	TTG	2	6	141147	141152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2711	NC_017301	AAT	2	6	141155	141160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2712	NC_017301	GGT	2	6	141179	141184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2713	NC_017301	GCT	2	6	141249	141254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505836
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2717	NC_017301	CGGG	2	8	141479	141486	0 %	0 %	75 %	25 %	384505836
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2720	NC_017301	CTG	2	6	141781	141786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505836
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2722	NC_017301	CTGG	2	8	141871	141878	0 %	25 %	50 %	25 %	384505836
2723	NC_017301	GTG	2	6	141925	141930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505836
2724	NC_017301	TGC	2	6	141990	141995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505836
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2726	NC_017301	ATTGC	2	10	142057	142066	20 %	40 %	20 %	20 %	384505836
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2728	NC_017301	TGGT	2	8	142288	142295	0 %	50 %	50 %	0 %	384505836
2729	NC_017301	GGC	2	6	142374	142379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505836
2730	NC_017301	CGG	2	6	142380	142385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505836
2731	NC_017301	TACG	2	8	142514	142521	25 %	25 %	25 %	25 %	384505836
2732	NC_017301	TGG	2	6	142541	142546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505836
2733	NC_017301	AGC	2	6	142619	142624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505837
2734	NC_017301	TCG	2	6	142668	142673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505837
2735	NC_017301	GCAA	2	8	142755	142762	50 %	0 %	25 %	25 %	384505837
2736	NC_017301	CATGTA	2	12	142777	142788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384505837
2737	NC_017301	GC	3	6	142843	142848	0 %	0 %	50 %	50 %	384505837
2738	NC_017301	CGC	2	6	142861	142866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505837
2739	NC_017301	GAGC	2	8	142879	142886	25 %	0 %	50 %	25 %	384505837
2740	NC_017301	CGT	2	6	142924	142929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505837
2741	NC_017301	TTG	2	6	142953	142958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505837
2742	NC_017301	ATC	2	6	142979	142984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505837
2743	NC_017301	GCCGGA	2	12	143042	143053	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384505837
2744	NC_017301	CAC	2	6	143086	143091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505838
2745	NC_017301	CGG	2	6	143115	143120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505838
2746	NC_017301	GTGA	2	8	143161	143168	25 %	25 %	50 %	0 %	384505838
2747	NC_017301	TCA	2	6	143219	143224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505838
2748	NC_017301	CTT	2	6	143253	143258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505838
2749	NC_017301	GCA	2	6	143301	143306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505838
2750	NC_017301	CAC	2	6	143338	143343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505838
2751	NC_017301	GCT	2	6	143363	143368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505838
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2758	NC_017301	CGCC	2	8	143638	143645	0 %	0 %	25 %	75 %	384505838
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2765	NC_017301	GA	3	6	144269	144274	50 %	0 %	50 %	0 %	384505839
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2777	NC_017301	TGA	2	6	144728	144733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505839
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2781	NC_017301	GGA	2	6	144922	144927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2782	NC_017301	TCC	2	6	145001	145006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2783	NC_017301	TG	3	6	145090	145095	0 %	50 %	50 %	0 %	384505840
2784	NC_017301	TTG	2	6	145106	145111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505840
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2788	NC_017301	AT	3	6	145331	145336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2831	NC_017301	CCA	2	6	147911	147916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505843
2832	NC_017301	CAT	2	6	147958	147963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505843
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2844	NC_017301	TG	3	6	148517	148522	0 %	50 %	50 %	0 %	384505843
2845	NC_017301	TGC	3	9	148529	148537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505843
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2852	NC_017301	TGC	2	6	148929	148934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505843
2853	NC_017301	CG	4	8	148942	148949	0 %	0 %	50 %	50 %	384505843
2854	NC_017301	AAG	2	6	148978	148983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505843
2855	NC_017301	ATA	2	6	149057	149062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505843
2856	NC_017301	CAT	2	6	149106	149111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505843
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2861	NC_017301	CTG	2	6	149318	149323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505843
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2864	NC_017301	CGC	2	6	149390	149395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505843
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2880	NC_017301	GGCGCA	2	12	150133	150144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384505844
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2984	NC_017301	GATA	2	8	155464	155471	50 %	25 %	25 %	0 %	384505848
2985	NC_017301	TAAG	2	8	155639	155646	50 %	25 %	25 %	0 %	384505848
2986	NC_017301	GTTT	2	8	155654	155661	0 %	75 %	25 %	0 %	384505848
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2989	NC_017301	TTCC	2	8	155758	155765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2990	NC_017301	GTACC	2	10	155787	155796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2991	NC_017301	GCT	2	6	155817	155822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_017301	CGCA	2	8	155905	155912	25 %	0 %	25 %	50 %	384505849
2993	NC_017301	ATG	2	6	155952	155957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505849
2994	NC_017301	GCT	2	6	155965	155970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505849
2995	NC_017301	ATC	2	6	156071	156076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505849
2996	NC_017301	TG	3	6	156077	156082	0 %	50 %	50 %	0 %	384505849
2997	NC_017301	CGA	2	6	156181	156186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505849
2998	NC_017301	GTG	2	6	156242	156247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505849
2999	NC_017301	CGGAGG	2	12	156279	156290	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384505849
3000	NC_017301	TGA	2	6	156312	156317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505849

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