MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017301	ATG	2	6	51778	51783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505752
1002	NC_017301	GCGGT	2	10	51784	51793	0 %	20 %	60 %	20 %	384505752
1003	NC_017301	CTT	2	6	51854	51859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505752
1004	NC_017301	TGT	2	6	51902	51907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505752
1005	NC_017301	TGG	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505752
1006	NC_017301	CGAT	2	8	51940	51947	25 %	25 %	25 %	25 %	384505752
1007	NC_017301	ATGA	2	8	52074	52081	50 %	25 %	25 %	0 %	384505752
1008	NC_017301	TGC	2	6	52086	52091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505752
1009	NC_017301	GCG	2	6	52129	52134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505752
1010	NC_017301	CAA	2	6	52163	52168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505752
1011	NC_017301	TCC	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505753
1012	NC_017301	CTGG	2	8	52475	52482	0 %	25 %	50 %	25 %	384505753
1013	NC_017301	GAT	2	6	52541	52546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505753
1014	NC_017301	GTG	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505753
1015	NC_017301	TTC	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505753
1016	NC_017301	TGT	2	6	52659	52664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017301	TTGGA	2	10	52670	52679	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017301	AAC	2	6	52688	52693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017301	TTGAT	2	10	52705	52714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017301	CTT	2	6	52781	52786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017301	TGCAC	2	10	52799	52808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_017301	TGC	2	6	52812	52817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017301	TTG	3	9	52820	52828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017301	CGT	2	6	52829	52834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017301	GCC	2	6	52848	52853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_017301	AC	3	6	52928	52933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017301	TTC	2	6	52995	53000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505754
1028	NC_017301	TTC	2	6	53004	53009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505754
1029	NC_017301	CTGGC	2	10	53058	53067	0 %	20 %	40 %	40 %	384505754
1030	NC_017301	TGG	2	6	53091	53096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505754
1031	NC_017301	TGC	2	6	53136	53141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505754
1032	NC_017301	TGG	2	6	53169	53174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505754
1033	NC_017301	TAA	2	6	53266	53271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505754
1034	NC_017301	GGC	2	6	53273	53278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505754
1035	NC_017301	TCG	2	6	53496	53501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505754
1036	NC_017301	CTGGCG	2	12	53513	53524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384505754
1037	NC_017301	GCAGC	2	10	53557	53566	20 %	0 %	40 %	40 %	384505754
1038	NC_017301	GACTG	2	10	53573	53582	20 %	20 %	40 %	20 %	384505754
1039	NC_017301	ATG	2	6	53760	53765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505754
1040	NC_017301	ATGC	2	8	53796	53803	25 %	25 %	25 %	25 %	384505754
1041	NC_017301	GC	3	6	53926	53931	0 %	0 %	50 %	50 %	384505754
1042	NC_017301	GAA	2	6	53992	53997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505754
1043	NC_017301	TGAT	2	8	54030	54037	25 %	50 %	25 %	0 %	384505754
1044	NC_017301	AGC	2	6	54093	54098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505754
1045	NC_017301	CAAG	2	8	54115	54122	50 %	0 %	25 %	25 %	384505754
1046	NC_017301	TGG	3	9	54160	54168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505754
1047	NC_017301	AGC	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505754
1048	NC_017301	ACTT	2	8	54206	54213	25 %	50 %	0 %	25 %	384505754
1049	NC_017301	AAT	3	9	54242	54250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505754
1050	NC_017301	T	6	6	54622	54627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017301	CCA	2	6	54668	54673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505755
1052	NC_017301	A	6	6	54681	54686	100 %	0 %	0 %	0 %	384505755
1053	NC_017301	GA	3	6	54740	54745	50 %	0 %	50 %	0 %	384505755
1054	NC_017301	ATC	2	6	54846	54851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505755
1055	NC_017301	CGG	2	6	54945	54950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505755
1056	NC_017301	TAG	2	6	55003	55008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505755
1057	NC_017301	AGT	2	6	55073	55078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505755
1058	NC_017301	T	6	6	55204	55209	0 %	100 %	0 %	0 %	384505755
1059	NC_017301	TGG	2	6	55271	55276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505755
1060	NC_017301	CGG	2	6	55280	55285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505755
1061	NC_017301	CCGT	2	8	55310	55317	0 %	25 %	25 %	50 %	384505755
1062	NC_017301	CGG	2	6	55353	55358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505755
1063	NC_017301	TG	3	6	55419	55424	0 %	50 %	50 %	0 %	384505756
1064	NC_017301	AGCA	2	8	55498	55505	50 %	0 %	25 %	25 %	384505756
1065	NC_017301	TA	3	6	55510	55515	50 %	50 %	0 %	0 %	384505756
1066	NC_017301	GCCGTG	2	12	55586	55597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384505756
1067	NC_017301	CGG	2	6	55635	55640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505756
1068	NC_017301	TAA	2	6	55665	55670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505756
1069	NC_017301	GC	4	8	55694	55701	0 %	0 %	50 %	50 %	384505756
1070	NC_017301	GTG	2	6	55791	55796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505756
1071	NC_017301	AAGGC	2	10	55814	55823	40 %	0 %	40 %	20 %	384505756
1072	NC_017301	GC	3	6	55854	55859	0 %	0 %	50 %	50 %	384505756
1073	NC_017301	CTA	2	6	55881	55886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505756
1074	NC_017301	GGC	2	6	55939	55944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505756
1075	NC_017301	CAC	2	6	56015	56020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505756
1076	NC_017301	CAG	2	6	56171	56176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505757
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1078	NC_017301	CG	3	6	56567	56572	0 %	0 %	50 %	50 %	384505757
1079	NC_017301	GCGG	2	8	56577	56584	0 %	0 %	75 %	25 %	384505757
1080	NC_017301	TAA	2	6	56618	56623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505757
1081	NC_017301	GCT	2	6	56653	56658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505757
1082	NC_017301	CGAC	2	8	56718	56725	25 %	0 %	25 %	50 %	384505758
1083	NC_017301	GAC	2	6	56728	56733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505758
1084	NC_017301	GTG	2	6	56772	56777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505758
1085	NC_017301	CAC	2	6	56894	56899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505758
1086	NC_017301	CAT	2	6	56932	56937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505758
1087	NC_017301	CAC	4	12	56942	56953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505758
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1089	NC_017301	GC	3	6	57000	57005	0 %	0 %	50 %	50 %	384505758
1090	NC_017301	CATC	2	8	57037	57044	25 %	25 %	0 %	50 %	384505758
1091	NC_017301	GCT	3	9	57091	57099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505758
1092	NC_017301	CCG	2	6	57102	57107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505758
1093	NC_017301	GAGG	2	8	57250	57257	25 %	0 %	75 %	0 %	384505758
1094	NC_017301	GCC	2	6	57260	57265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505758
1095	NC_017301	GGA	2	6	57407	57412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505758
1096	NC_017301	CAA	2	6	57415	57420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505758
1097	NC_017301	GGT	2	6	57425	57430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505758
1098	NC_017301	GTT	2	6	57458	57463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505758
1099	NC_017301	CTG	2	6	57505	57510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505758
1100	NC_017301	ATTG	2	8	57585	57592	25 %	50 %	25 %	0 %	384505758
1101	NC_017301	TGG	2	6	57721	57726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017301	CAT	2	6	57766	57771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017301	AGC	2	6	57798	57803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017301	TTGG	2	8	57810	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017301	TGC	3	9	57865	57873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017301	TCT	2	6	57960	57965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505759
1107	NC_017301	TCG	2	6	58019	58024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505759
1108	NC_017301	TTG	2	6	58094	58099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505759
1109	NC_017301	TCT	2	6	58248	58253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505760
1110	NC_017301	TCA	2	6	58266	58271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505760
1111	NC_017301	TGCGCG	2	12	58284	58295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384505760
1112	NC_017301	CGC	2	6	58342	58347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505760
1113	NC_017301	GC	3	6	58350	58355	0 %	0 %	50 %	50 %	384505760
1114	NC_017301	GCC	2	6	58376	58381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505760
1115	NC_017301	GAA	2	6	58415	58420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505760
1116	NC_017301	CAG	2	6	58424	58429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505760
1117	NC_017301	TC	3	6	58434	58439	0 %	50 %	0 %	50 %	384505760
1118	NC_017301	TGA	2	6	58489	58494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505760
1119	NC_017301	AGGG	2	8	58574	58581	25 %	0 %	75 %	0 %	384505760
1120	NC_017301	GGA	2	6	58642	58647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505760
1121	NC_017301	ATGGC	2	10	58674	58683	20 %	20 %	40 %	20 %	384505760
1122	NC_017301	TGC	2	6	58688	58693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505760
1123	NC_017301	CG	3	6	58769	58774	0 %	0 %	50 %	50 %	384505760
1124	NC_017301	GTC	2	6	58793	58798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505760
1125	NC_017301	ACG	2	6	58829	58834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505760
1126	NC_017301	GTG	2	6	59036	59041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505760
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1128	NC_017301	TCT	2	6	59211	59216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505760
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