MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017301	CATCGG	2	12	309827	309838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384505991
6002	NC_017301	CCT	2	6	309854	309859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505991
6003	NC_017301	TGTCA	2	10	309873	309882	20 %	40 %	20 %	20 %	384505991
6004	NC_017301	CA	4	8	309881	309888	50 %	0 %	0 %	50 %	384505991
6005	NC_017301	CGT	3	9	310046	310054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505991
6006	NC_017301	CGC	2	6	310106	310111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505991
6007	NC_017301	CCA	2	6	310129	310134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505991
6008	NC_017301	GCG	2	6	310188	310193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505991
6009	NC_017301	TCG	2	6	310219	310224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505991
6010	NC_017301	GGT	2	6	310313	310318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505991
6011	NC_017301	TGC	2	6	310473	310478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017301	CTT	2	6	310482	310487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_017301	GCTG	2	8	310489	310496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_017301	TGCGA	2	10	310508	310517	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6015	NC_017301	AGGT	2	8	310537	310544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017301	ATAA	2	8	310551	310558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017301	GT	3	6	310570	310575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017301	CAA	2	6	310588	310593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_017301	CGA	2	6	310651	310656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_017301	GA	3	6	310678	310683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017301	TGGA	2	8	310737	310744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017301	GGC	2	6	310823	310828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017301	GAA	2	6	310872	310877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017301	GCT	2	6	310884	310889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017301	CTG	2	6	310969	310974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017301	A	6	6	310995	311000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017301	GAT	2	6	311051	311056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017301	CAA	2	6	311062	311067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017301	ACG	2	6	311142	311147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_017301	AAG	2	6	311153	311158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017301	GGA	2	6	311170	311175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017301	CG	3	6	311202	311207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_017301	TGC	2	6	311266	311271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_017301	CGA	2	6	311297	311302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017301	CCA	2	6	311319	311324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_017301	GAT	2	6	311454	311459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017301	CGG	2	6	311507	311512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017301	GAG	2	6	311541	311546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017301	CAC	2	6	311661	311666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_017301	AGT	2	6	311776	311781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017301	GAA	2	6	311803	311808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017301	GGC	2	6	311847	311852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017301	GAG	2	6	311859	311864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017301	GCG	2	6	311929	311934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_017301	T	6	6	312053	312058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017301	ATCG	2	8	312097	312104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_017301	TGTTC	2	10	312141	312150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6048	NC_017301	CAA	2	6	312207	312212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017301	ATG	2	6	312233	312238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017301	GC	3	6	312326	312331	0 %	0 %	50 %	50 %	384505992
6051	NC_017301	GAA	2	6	312450	312455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505992
6052	NC_017301	TTC	2	6	312470	312475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505992
6053	NC_017301	GATG	2	8	312591	312598	25 %	25 %	50 %	0 %	384505992
6054	NC_017301	GAT	2	6	312645	312650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505992
6055	NC_017301	AAT	2	6	312692	312697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505992
6056	NC_017301	TGGT	2	8	312716	312723	0 %	50 %	50 %	0 %	384505992
6057	NC_017301	GCC	2	6	312744	312749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505992
6058	NC_017301	AGC	2	6	312778	312783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505992
6059	NC_017301	GTTT	2	8	312838	312845	0 %	75 %	25 %	0 %	384505992
6060	NC_017301	GCAGA	2	10	312874	312883	40 %	0 %	40 %	20 %	384505992
6061	NC_017301	C	6	6	312940	312945	0 %	0 %	0 %	100 %	384505992
6062	NC_017301	AGG	2	6	312947	312952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505992
6063	NC_017301	TTG	2	6	312963	312968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505992
6064	NC_017301	TGCG	2	8	312985	312992	0 %	25 %	50 %	25 %	384505992
6065	NC_017301	GCA	2	6	313056	313061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505992
6066	NC_017301	AC	3	6	313079	313084	50 %	0 %	0 %	50 %	384505992
6067	NC_017301	TGA	3	9	313085	313093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505992
6068	NC_017301	CGGCAG	2	12	313111	313122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384505992
6069	NC_017301	GGCT	2	8	313123	313130	0 %	25 %	50 %	25 %	384505992
6070	NC_017301	GGA	2	6	313148	313153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505992
6071	NC_017301	CAC	2	6	313162	313167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505992
6072	NC_017301	TCG	2	6	313174	313179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505992
6073	NC_017301	GCTG	2	8	313187	313194	0 %	25 %	50 %	25 %	384505992
6074	NC_017301	CGC	2	6	313251	313256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505992
6075	NC_017301	AGG	2	6	313279	313284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505992
6076	NC_017301	TGCC	2	8	313322	313329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_017301	AGCGG	2	10	313341	313350	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6078	NC_017301	GCT	2	6	313404	313409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505993
6079	NC_017301	GCT	2	6	313478	313483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505993
6080	NC_017301	GAT	2	6	313491	313496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505993
6081	NC_017301	CGA	2	6	313517	313522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505993
6082	NC_017301	GCGCA	2	10	313523	313532	20 %	0 %	40 %	40 %	384505993
6083	NC_017301	GGGC	2	8	313554	313561	0 %	0 %	75 %	25 %	384505993
6084	NC_017301	GTT	2	6	313581	313586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505993
6085	NC_017301	CTGC	2	8	313613	313620	0 %	25 %	25 %	50 %	384505993
6086	NC_017301	TGG	2	6	313627	313632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505993
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6088	NC_017301	ACGGG	2	10	313693	313702	20 %	0 %	60 %	20 %	384505993
6089	NC_017301	AGA	2	6	313847	313852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505993
6090	NC_017301	ACT	2	6	313869	313874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505993
6091	NC_017301	A	6	6	313884	313889	100 %	0 %	0 %	0 %	384505993
6092	NC_017301	TGA	2	6	313967	313972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505993
6093	NC_017301	TGG	2	6	314134	314139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505993
6094	NC_017301	GC	3	6	314242	314247	0 %	0 %	50 %	50 %	384505993
6095	NC_017301	GCC	2	6	314313	314318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505993
6096	NC_017301	GCA	2	6	314391	314396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505993
6097	NC_017301	CCT	2	6	314461	314466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505993
6098	NC_017301	AC	3	6	314500	314505	50 %	0 %	0 %	50 %	384505993
6099	NC_017301	GAA	2	6	314583	314588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505993
6100	NC_017301	GCT	2	6	314595	314600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505993
6101	NC_017301	CGG	3	9	314714	314722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505993
6102	NC_017301	GATA	2	8	314798	314805	50 %	25 %	25 %	0 %	384505993
6103	NC_017301	GCC	2	6	314817	314822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505993
6104	NC_017301	CG	3	6	314929	314934	0 %	0 %	50 %	50 %	384505993
6105	NC_017301	CCG	2	6	314939	314944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505993
6106	NC_017301	AAG	2	6	314967	314972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505993
6107	NC_017301	CCG	2	6	315002	315007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505994
6108	NC_017301	AGG	2	6	315017	315022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505994
6109	NC_017301	CGGT	2	8	315063	315070	0 %	25 %	50 %	25 %	384505994
6110	NC_017301	GCTT	2	8	315222	315229	0 %	50 %	25 %	25 %	384505994
6111	NC_017301	AGGGG	2	10	315306	315315	20 %	0 %	80 %	0 %	384505994
6112	NC_017301	GTG	2	6	315353	315358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505994
6113	NC_017301	TGG	2	6	315383	315388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505994
6114	NC_017301	TGC	2	6	315475	315480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505995
6115	NC_017301	GAA	3	9	315549	315557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505995
6116	NC_017301	TCA	2	6	315613	315618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505995
6117	NC_017301	TCCC	2	8	315621	315628	0 %	25 %	0 %	75 %	384505995
6118	NC_017301	TTG	2	6	315727	315732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505995
6119	NC_017301	CAGA	2	8	315768	315775	50 %	0 %	25 %	25 %	384505995
6120	NC_017301	ACC	2	6	315799	315804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505995
6121	NC_017301	TACCCT	3	18	315860	315877	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384505995
6122	NC_017301	TCGG	2	8	315887	315894	0 %	25 %	50 %	25 %	384505995
6123	NC_017301	CGG	3	9	315892	315900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505995
6124	NC_017301	GTT	2	6	315962	315967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505995
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6126	NC_017301	TGG	2	6	316027	316032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505995
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6245	NC_017301	CGG	2	6	322368	322373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_017301	CGA	2	6	322445	322450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506001
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6251	NC_017301	GCA	2	6	322587	322592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506001
6252	NC_017301	GAA	2	6	322661	322666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506001
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6255	NC_017301	TTGAGG	2	12	322753	322764	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384506001
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6263	NC_017301	AGC	2	6	323453	323458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6265	NC_017301	AGT	2	6	323505	323510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6367	NC_017301	AGGA	2	8	329089	329096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6373	NC_017301	AAG	2	6	329290	329295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506006
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6375	NC_017301	TCTCC	2	10	329318	329327	0 %	40 %	0 %	60 %	384506006
6376	NC_017301	TTA	2	6	329347	329352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384506006
6377	NC_017301	GAA	2	6	329384	329389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506006
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6379	NC_017301	ATGG	2	8	329433	329440	25 %	25 %	50 %	0 %	384506006
6380	NC_017301	GCGCT	2	10	329590	329599	0 %	20 %	40 %	40 %	384506006
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6388	NC_017301	GTT	2	6	329883	329888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506007
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6394	NC_017301	T	7	7	330163	330169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6395	NC_017301	AGG	2	6	330290	330295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6396	NC_017301	A	6	6	330389	330394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6498	NC_017301	CGC	2	6	335762	335767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506012
6499	NC_017301	AAC	2	6	335810	335815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384506013
6500	NC_017301	ACT	2	6	335821	335826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506013

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