MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017301	TGC	2	6	258855	258860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505938
5002	NC_017301	GAT	2	6	258910	258915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505938
5003	NC_017301	AGA	2	6	259071	259076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505938
5004	NC_017301	ATC	2	6	259193	259198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505938
5005	NC_017301	TC	3	6	259197	259202	0 %	50 %	0 %	50 %	384505938
5006	NC_017301	GAC	2	6	259225	259230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505938
5007	NC_017301	TGA	2	6	259325	259330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505938
5008	NC_017301	GCT	2	6	259451	259456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505939
5009	NC_017301	GAG	2	6	259482	259487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505939
5010	NC_017301	CAG	2	6	259599	259604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505939
5011	NC_017301	CTG	2	6	259657	259662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505939
5012	NC_017301	TCAA	2	8	259737	259744	50 %	25 %	0 %	25 %	384505939
5013	NC_017301	TGC	2	6	259814	259819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505939
5014	NC_017301	TGAT	2	8	259951	259958	25 %	50 %	25 %	0 %	384505939
5015	NC_017301	GGCA	2	8	260018	260025	25 %	0 %	50 %	25 %	384505939
5016	NC_017301	CCG	2	6	260035	260040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505939
5017	NC_017301	CAA	2	6	260051	260056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505939
5018	NC_017301	TTC	2	6	260073	260078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505939
5019	NC_017301	GAC	2	6	260088	260093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505939
5020	NC_017301	ACTC	2	8	260121	260128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_017301	TCG	2	6	260266	260271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505940
5022	NC_017301	GTGG	2	8	260289	260296	0 %	25 %	75 %	0 %	384505940
5023	NC_017301	GC	3	6	260333	260338	0 %	0 %	50 %	50 %	384505940
5024	NC_017301	TGC	2	6	260355	260360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505940
5025	NC_017301	CTAC	2	8	260387	260394	25 %	25 %	0 %	50 %	384505940
5026	NC_017301	TTA	2	6	260396	260401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505940
5027	NC_017301	TGCTC	2	10	260421	260430	0 %	40 %	20 %	40 %	384505940
5028	NC_017301	TGG	2	6	260433	260438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505940
5029	NC_017301	CCA	2	6	260451	260456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505940
5030	NC_017301	CGC	2	6	260461	260466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505940
5031	NC_017301	ATGA	2	8	260593	260600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017301	ATTA	2	8	260656	260663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017301	CCT	2	6	260812	260817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505941
5034	NC_017301	TGC	2	6	260886	260891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505941
5035	NC_017301	T	7	7	260897	260903	0 %	100 %	0 %	0 %	384505941
5036	NC_017301	TGGG	2	8	260947	260954	0 %	25 %	75 %	0 %	384505941
5037	NC_017301	GGC	2	6	260964	260969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505941
5038	NC_017301	GAA	2	6	261075	261080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505941
5039	NC_017301	CG	3	6	261224	261229	0 %	0 %	50 %	50 %	384505941
5040	NC_017301	TTA	2	6	261290	261295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505941
5041	NC_017301	ACC	2	6	261336	261341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505941
5042	NC_017301	CAG	2	6	261358	261363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505941
5043	NC_017301	GGC	2	6	261373	261378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505941
5044	NC_017301	AAG	2	6	261421	261426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505941
5045	NC_017301	GC	4	8	261468	261475	0 %	0 %	50 %	50 %	384505941
5046	NC_017301	CTT	2	6	261476	261481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505941
5047	NC_017301	TGG	2	6	261506	261511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505941
5048	NC_017301	GGCA	2	8	261581	261588	25 %	0 %	50 %	25 %	384505941
5049	NC_017301	TGA	2	6	261615	261620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505941
5050	NC_017301	TGC	2	6	261699	261704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505941
5051	NC_017301	CTG	2	6	261766	261771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505941
5052	NC_017301	GAT	2	6	261823	261828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505941
5053	NC_017301	GC	4	8	261848	261855	0 %	0 %	50 %	50 %	384505941
5054	NC_017301	ATT	2	6	261910	261915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505941
5055	NC_017301	TGG	2	6	261971	261976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505941
5056	NC_017301	CTG	2	6	262098	262103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017301	CTT	2	6	262166	262171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505942
5058	NC_017301	GGC	2	6	262174	262179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505942
5059	NC_017301	GCT	2	6	262196	262201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505942
5060	NC_017301	AGC	2	6	262222	262227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505942
5061	NC_017301	TGGG	2	8	262280	262287	0 %	25 %	75 %	0 %	384505942
5062	NC_017301	GCT	2	6	262288	262293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505942
5063	NC_017301	TTGGA	2	10	262339	262348	20 %	40 %	40 %	0 %	384505942
5064	NC_017301	GGT	3	9	262451	262459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505943
5065	NC_017301	TGA	2	6	262487	262492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505943
5066	NC_017301	GCA	2	6	262572	262577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505943
5067	NC_017301	CAT	2	6	262635	262640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505943
5068	NC_017301	GGCTC	2	10	262661	262670	0 %	20 %	40 %	40 %	384505943
5069	NC_017301	CAC	2	6	262730	262735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505943
5070	NC_017301	GA	3	6	262753	262758	50 %	0 %	50 %	0 %	384505943
5071	NC_017301	GCA	2	6	262764	262769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505943
5072	NC_017301	CGA	2	6	262811	262816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505943
5073	NC_017301	GGT	2	6	262883	262888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505943
5074	NC_017301	TC	3	6	263068	263073	0 %	50 %	0 %	50 %	384505944
5075	NC_017301	CTA	2	6	263101	263106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505944
5076	NC_017301	TGG	2	6	263221	263226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505944
5077	NC_017301	GCCG	2	8	263239	263246	0 %	0 %	50 %	50 %	384505944
5078	NC_017301	GCT	2	6	263277	263282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505944
5079	NC_017301	GGA	2	6	263356	263361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505944
5080	NC_017301	TCCTT	2	10	263391	263400	0 %	60 %	0 %	40 %	384505944
5081	NC_017301	T	6	6	263440	263445	0 %	100 %	0 %	0 %	384505944
5082	NC_017301	AGG	2	6	263457	263462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505944
5083	NC_017301	GTC	2	6	263465	263470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505944
5084	NC_017301	TAA	2	6	263545	263550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505944
5085	NC_017301	GCC	2	6	263591	263596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505944
5086	NC_017301	A	6	6	263665	263670	100 %	0 %	0 %	0 %	384505944
5087	NC_017301	CTT	2	6	263701	263706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505944
5088	NC_017301	GTT	2	6	263740	263745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505944
5089	NC_017301	CAG	3	9	263777	263785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505944
5090	NC_017301	GAT	2	6	263804	263809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505944
5091	NC_017301	GGAAG	2	10	264077	264086	40 %	0 %	60 %	0 %	384505945
5092	NC_017301	GTTG	2	8	264238	264245	0 %	50 %	50 %	0 %	384505945
5093	NC_017301	TCG	2	6	264280	264285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505945
5094	NC_017301	TGG	2	6	264371	264376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505945
5095	NC_017301	CGT	2	6	264389	264394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505945
5096	NC_017301	CTT	2	6	264398	264403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505945
5097	NC_017301	CGC	2	6	264443	264448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505945
5098	NC_017301	CCG	3	9	264463	264471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505945
5099	NC_017301	TCT	2	6	264503	264508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505945
5100	NC_017301	ATG	2	6	264511	264516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505945
5101	NC_017301	CGG	2	6	264635	264640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505945
5102	NC_017301	CTCAAG	2	12	264717	264728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384505945
5103	NC_017301	GGT	2	6	264876	264881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017301	ACA	2	6	264909	264914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017301	GC	3	6	264987	264992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017301	GTG	2	6	265008	265013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505946
5107	NC_017301	GA	3	6	265024	265029	50 %	0 %	50 %	0 %	384505946
5108	NC_017301	GCT	3	9	265037	265045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505946
5109	NC_017301	TCT	2	6	265139	265144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505946
5110	NC_017301	TGCATT	2	12	265179	265190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384505946
5111	NC_017301	GAAT	2	8	265273	265280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017301	TCA	2	6	265360	265365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505947
5113	NC_017301	CCATG	2	10	265466	265475	20 %	20 %	20 %	40 %	384505947
5114	NC_017301	TTGCC	2	10	265553	265562	0 %	40 %	20 %	40 %	384505947
5115	NC_017301	TG	3	6	265650	265655	0 %	50 %	50 %	0 %	384505947
5116	NC_017301	GTC	2	6	265674	265679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505947
5117	NC_017301	GTC	3	9	265686	265694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505947
5118	NC_017301	CGA	2	6	265802	265807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505947
5119	NC_017301	GAT	2	6	265908	265913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505947
5120	NC_017301	TTGC	2	8	266037	266044	0 %	50 %	25 %	25 %	384505947
5121	NC_017301	TCA	2	6	266053	266058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505947
5122	NC_017301	GCC	2	6	266061	266066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505947
5123	NC_017301	TTGC	2	8	266124	266131	0 %	50 %	25 %	25 %	384505947
5124	NC_017301	AC	3	6	266147	266152	50 %	0 %	0 %	50 %	384505947
5125	NC_017301	GGC	2	6	266163	266168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505947
5126	NC_017301	GAG	2	6	266218	266223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505947
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5151	NC_017301	TTG	2	6	267381	267386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505947
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5154	NC_017301	GTA	2	6	267557	267562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5156	NC_017301	ATG	2	6	267727	267732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5159	NC_017301	TATT	2	8	267825	267832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_017301	GGT	2	6	267937	267942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_017301	CGA	2	6	268007	268012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505948
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5178	NC_017301	GAATG	2	10	268895	268904	40 %	20 %	40 %	0 %	384505949
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5225	NC_017301	CGG	2	6	271294	271299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505951
5226	NC_017301	TTCT	2	8	271352	271359	0 %	75 %	0 %	25 %	384505951
5227	NC_017301	ATG	2	6	271371	271376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505951
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5229	NC_017301	GAG	2	6	271481	271486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505951
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5232	NC_017301	GCATC	2	10	271789	271798	20 %	20 %	20 %	40 %	384505951
5233	NC_017301	G	6	6	271828	271833	0 %	0 %	100 %	0 %	384505951
5234	NC_017301	GGC	2	6	271862	271867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505951
5235	NC_017301	AG	3	6	271936	271941	50 %	0 %	50 %	0 %	384505951
5236	NC_017301	ACG	2	6	271953	271958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505951
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5238	NC_017301	CAGA	2	8	272015	272022	50 %	0 %	25 %	25 %	384505951
5239	NC_017301	GCA	2	6	272067	272072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505951
5240	NC_017301	CAA	2	6	272382	272387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_017301	GCG	2	6	272480	272485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505952
5242	NC_017301	CGT	2	6	272536	272541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505952
5243	NC_017301	AGG	2	6	272660	272665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505952
5244	NC_017301	CCCA	2	8	272671	272678	25 %	0 %	0 %	75 %	384505952
5245	NC_017301	GCA	2	6	272683	272688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505952
5246	NC_017301	CGGG	2	8	272693	272700	0 %	0 %	75 %	25 %	384505952
5247	NC_017301	ATT	2	6	272753	272758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505952
5248	NC_017301	GGTGG	2	10	272772	272781	0 %	20 %	80 %	0 %	384505952
5249	NC_017301	AGC	2	6	272900	272905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505952
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5251	NC_017301	CAT	2	6	272968	272973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505952
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5253	NC_017301	TGC	2	6	273146	273151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505952
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5260	NC_017301	GCT	2	6	273528	273533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505952
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5275	NC_017301	TACC	2	8	274494	274501	25 %	25 %	0 %	50 %	384505953
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5278	NC_017301	GGC	2	6	274549	274554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505953
5279	NC_017301	TGG	2	6	274571	274576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5280	NC_017301	GGTC	2	8	274656	274663	0 %	25 %	50 %	25 %	384505954
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5334	NC_017301	AGT	2	6	277473	277478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5363	NC_017301	CTCA	2	8	278692	278699	25 %	25 %	0 %	50 %	384505958
5364	NC_017301	GCT	2	6	278730	278735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505958
5365	NC_017301	CTA	2	6	278755	278760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505958
5366	NC_017301	TGC	2	6	278789	278794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505958
5367	NC_017301	AGA	2	6	278821	278826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505958
5368	NC_017301	GCC	2	6	278841	278846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505958
5369	NC_017301	GCT	2	6	278861	278866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505958
5370	NC_017301	TGC	2	6	278867	278872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505958
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5389	NC_017301	TGCGT	2	10	279455	279464	0 %	40 %	40 %	20 %	384505958
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5391	NC_017301	CGG	2	6	279572	279577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_017301	TGA	2	6	279618	279623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5413	NC_017301	AGG	2	6	280685	280690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5427	NC_017301	GTAC	2	8	281200	281207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5428	NC_017301	TCA	2	6	281246	281251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505963
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5433	NC_017301	CTG	2	6	281511	281516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505964
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5474	NC_017301	CAT	2	6	283306	283311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505966
5475	NC_017301	CGGAGT	2	12	283315	283326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384505966
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5477	NC_017301	TTC	2	6	283619	283624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505966
5478	NC_017301	CGG	2	6	283650	283655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505966
5479	NC_017301	TAA	2	6	283660	283665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505966
5480	NC_017301	CTG	2	6	283699	283704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505966
5481	NC_017301	AGGA	2	8	283751	283758	50 %	0 %	50 %	0 %	384505966
5482	NC_017301	T	6	6	283781	283786	0 %	100 %	0 %	0 %	384505966
5483	NC_017301	GTCTGG	2	12	283880	283891	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384505966
5484	NC_017301	GCG	3	9	283986	283994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505966
5485	NC_017301	TGC	2	6	283997	284002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505966
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5487	NC_017301	AGT	2	6	284198	284203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_017301	A	6	6	284230	284235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_017301	CGT	2	6	284428	284433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505967
5490	NC_017301	GAG	2	6	284447	284452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505967
5491	NC_017301	TGC	2	6	284485	284490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505967
5492	NC_017301	TAGT	2	8	284500	284507	25 %	50 %	25 %	0 %	384505967
5493	NC_017301	GGT	2	6	284657	284662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_017301	GTT	2	6	284681	284686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505968
5495	NC_017301	ATGA	2	8	284735	284742	50 %	25 %	25 %	0 %	384505968
5496	NC_017301	GAT	2	6	284800	284805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505968
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5500	NC_017301	ATG	2	6	284966	284971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505968

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