MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017301	TCG	2	6	233006	233011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4502	NC_017301	CGA	2	6	233018	233023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4503	NC_017301	CTTA	2	8	233042	233049	25 %	50 %	0 %	25 %	384505920
4504	NC_017301	CGA	2	6	233052	233057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4505	NC_017301	AAG	3	9	233206	233214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505920
4506	NC_017301	CGA	2	6	233250	233255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4507	NC_017301	CTTG	2	8	233307	233314	0 %	50 %	25 %	25 %	384505920
4508	NC_017301	GCT	2	6	233383	233388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4509	NC_017301	TCG	2	6	233439	233444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4510	NC_017301	CTGTG	2	10	233480	233489	0 %	40 %	40 %	20 %	384505920
4511	NC_017301	GAA	2	6	233490	233495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505920
4512	NC_017301	CTG	2	6	233513	233518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4513	NC_017301	GAGCGT	2	12	233560	233571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384505920
4514	NC_017301	CCG	2	6	233585	233590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505920
4515	NC_017301	GGT	2	6	233742	233747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505920
4516	NC_017301	AGA	2	6	233817	233822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505920
4517	NC_017301	TCG	2	6	233835	233840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4518	NC_017301	GCA	2	6	233871	233876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4519	NC_017301	ACG	2	6	233977	233982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4520	NC_017301	CGT	2	6	234061	234066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4521	NC_017301	AGG	2	6	234092	234097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505920
4522	NC_017301	TCCG	2	8	234110	234117	0 %	25 %	25 %	50 %	384505920
4523	NC_017301	GC	3	6	234318	234323	0 %	0 %	50 %	50 %	384505920
4524	NC_017301	CGA	2	6	234435	234440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4525	NC_017301	CCA	2	6	234446	234451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505920
4526	NC_017301	GC	3	6	234460	234465	0 %	0 %	50 %	50 %	384505920
4527	NC_017301	CGT	2	6	234476	234481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4528	NC_017301	A	7	7	234487	234493	100 %	0 %	0 %	0 %	384505920
4529	NC_017301	GGA	2	6	234495	234500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505920
4530	NC_017301	ATC	2	6	234535	234540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505920
4531	NC_017301	AGA	2	6	234629	234634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505920
4532	NC_017301	TCG	2	6	234667	234672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4533	NC_017301	GAT	2	6	234688	234693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505920
4534	NC_017301	CGC	2	6	234696	234701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505920
4535	NC_017301	CGG	2	6	234792	234797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505920
4536	NC_017301	CG	3	6	234837	234842	0 %	0 %	50 %	50 %	384505920
4537	NC_017301	GCCGT	2	10	234881	234890	0 %	20 %	40 %	40 %	384505920
4538	NC_017301	GC	3	6	234969	234974	0 %	0 %	50 %	50 %	384505920
4539	NC_017301	TC	3	6	234978	234983	0 %	50 %	0 %	50 %	384505920
4540	NC_017301	ACC	3	9	234988	234996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505920
4541	NC_017301	AAGG	2	8	235099	235106	50 %	0 %	50 %	0 %	384505920
4542	NC_017301	GAT	2	6	235141	235146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505920
4543	NC_017301	TCG	2	6	235181	235186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4544	NC_017301	AGC	2	6	235211	235216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4545	NC_017301	TGC	2	6	235218	235223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4546	NC_017301	AGAA	2	8	235271	235278	75 %	0 %	25 %	0 %	384505920
4547	NC_017301	TCG	2	6	235295	235300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4548	NC_017301	AGCC	2	8	235346	235353	25 %	0 %	25 %	50 %	384505920
4549	NC_017301	CGCT	2	8	235486	235493	0 %	25 %	25 %	50 %	384505920
4550	NC_017301	CCG	2	6	235536	235541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505920
4551	NC_017301	ACG	2	6	235560	235565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4552	NC_017301	CGTG	2	8	235638	235645	0 %	25 %	50 %	25 %	384505920
4553	NC_017301	CTT	2	6	235688	235693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505920
4554	NC_017301	CGA	2	6	235696	235701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4555	NC_017301	CGA	2	6	235704	235709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505920
4556	NC_017301	AGG	2	6	235766	235771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505920
4557	NC_017301	AGAAA	2	10	235788	235797	80 %	0 %	20 %	0 %	384505920
4558	NC_017301	A	6	6	235804	235809	100 %	0 %	0 %	0 %	384505920
4559	NC_017301	GAA	2	6	235815	235820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505920
4560	NC_017301	CCA	2	6	235823	235828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505920
4561	NC_017301	A	6	6	235843	235848	100 %	0 %	0 %	0 %	384505920
4562	NC_017301	A	6	6	235855	235860	100 %	0 %	0 %	0 %	384505920
4563	NC_017301	TTCA	2	8	236017	236024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_017301	TGC	2	6	236057	236062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4565	NC_017301	GAAC	2	8	236093	236100	50 %	0 %	25 %	25 %	384505921
4566	NC_017301	ATG	2	6	236104	236109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4567	NC_017301	TCC	2	6	236172	236177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505921
4568	NC_017301	ATG	2	6	236326	236331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4569	NC_017301	ATGCCC	2	12	236356	236367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384505921
4570	NC_017301	GA	3	6	236371	236376	50 %	0 %	50 %	0 %	384505921
4571	NC_017301	TCG	2	6	236413	236418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4572	NC_017301	ATG	3	9	236419	236427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4573	NC_017301	AGT	2	6	236509	236514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
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4575	NC_017301	GAG	2	6	236522	236527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505921
4576	NC_017301	CAAAGC	2	12	236564	236575	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384505921
4577	NC_017301	GGGA	2	8	236598	236605	25 %	0 %	75 %	0 %	384505921
4578	NC_017301	TGA	2	6	236606	236611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4579	NC_017301	GAT	2	6	236631	236636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4580	NC_017301	CTG	2	6	236646	236651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505921
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4582	NC_017301	ACC	2	6	236800	236805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505921
4583	NC_017301	AAC	2	6	236829	236834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505921
4584	NC_017301	GAT	2	6	236835	236840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4585	NC_017301	TG	3	6	236961	236966	0 %	50 %	50 %	0 %	384505921
4586	NC_017301	TGAA	2	8	236986	236993	50 %	25 %	25 %	0 %	384505921
4587	NC_017301	GCA	2	6	237017	237022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4588	NC_017301	CAA	2	6	237041	237046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505921
4589	NC_017301	CCT	2	6	237088	237093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505921
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4591	NC_017301	GCACCG	2	12	237190	237201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384505921
4592	NC_017301	CGA	2	6	237218	237223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4593	NC_017301	CGC	2	6	237251	237256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505921
4594	NC_017301	AGC	2	6	237270	237275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
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4596	NC_017301	CCA	2	6	237403	237408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505921
4597	NC_017301	AGT	2	6	237423	237428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4598	NC_017301	CAG	2	6	237462	237467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4599	NC_017301	AG	3	6	237466	237471	50 %	0 %	50 %	0 %	384505921
4600	NC_017301	T	6	6	237516	237521	0 %	100 %	0 %	0 %	384505921
4601	NC_017301	TTC	2	6	237534	237539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505921
4602	NC_017301	CGT	2	6	237551	237556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4603	NC_017301	CGC	2	6	237662	237667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505921
4604	NC_017301	CCA	2	6	237711	237716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505921
4605	NC_017301	ATG	2	6	237724	237729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4606	NC_017301	GGA	2	6	237737	237742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505921
4607	NC_017301	ACG	2	6	237790	237795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4608	NC_017301	ACG	2	6	237825	237830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4609	NC_017301	CAG	2	6	237851	237856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505921
4610	NC_017301	GGC	2	6	237909	237914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505921
4611	NC_017301	GCC	2	6	237936	237941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505921
4612	NC_017301	GAT	2	6	237942	237947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505921
4613	NC_017301	GC	3	6	237952	237957	0 %	0 %	50 %	50 %	384505921
4614	NC_017301	AAGT	2	8	237959	237966	50 %	25 %	25 %	0 %	384505921
4615	NC_017301	TCCT	2	8	238023	238030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_017301	GATA	2	8	238138	238145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017301	GTAG	2	8	238152	238159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017301	CCTA	2	8	238181	238188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_017301	TCA	2	6	238271	238276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505922
4620	NC_017301	TGC	2	6	238277	238282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505922
4621	NC_017301	GC	3	6	238317	238322	0 %	0 %	50 %	50 %	384505922
4622	NC_017301	CTT	2	6	238341	238346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505922
4623	NC_017301	CCG	2	6	238459	238464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505922
4624	NC_017301	CAA	2	6	238475	238480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505922
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4626	NC_017301	GCG	2	6	238612	238617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505922
4627	NC_017301	TGC	2	6	238637	238642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505922
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4828	NC_017301	CATGC	2	10	249698	249707	20 %	20 %	20 %	40 %	384505931
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4843	NC_017301	GT	3	6	250426	250431	0 %	50 %	50 %	0 %	384505931
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4845	NC_017301	A	6	6	250530	250535	100 %	0 %	0 %	0 %	384505931
4846	NC_017301	GC	3	6	250808	250813	0 %	0 %	50 %	50 %	384505931
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4853	NC_017301	CGCC	2	8	251219	251226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4854	NC_017301	TTA	2	6	251278	251283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505932
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4862	NC_017301	AGAA	2	8	251729	251736	75 %	0 %	25 %	0 %	384505932
4863	NC_017301	CGT	2	6	251744	251749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505932
4864	NC_017301	AGC	3	9	251773	251781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505932
4865	NC_017301	TGG	2	6	251786	251791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505932
4866	NC_017301	GACATG	2	12	251794	251805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384505932
4867	NC_017301	GAT	2	6	251808	251813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505932
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4869	NC_017301	TTG	2	6	251821	251826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505932
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4882	NC_017301	CTG	2	6	252438	252443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4884	NC_017301	GTA	2	6	252502	252507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4886	NC_017301	GTT	2	6	252636	252641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4887	NC_017301	TTC	2	6	252712	252717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4893	NC_017301	GGGA	2	8	253051	253058	25 %	0 %	75 %	0 %	384505934
4894	NC_017301	T	6	6	253089	253094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4895	NC_017301	TGG	2	6	253101	253106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4991	NC_017301	ACG	2	6	258290	258295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505938
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