MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 4105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017295	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	384456719
3	NC_017295	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	384456719
4	NC_017295	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	384456720
5	NC_017295	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	384456722
6	NC_017295	TGAAA	2	10	6824	6833	60 %	20 %	20 %	0 %	384456725
7	NC_017295	ATATT	2	10	6921	6930	40 %	60 %	0 %	0 %	384456725
8	NC_017295	TCGTG	2	10	10747	10756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017295	AGATT	2	10	14181	14190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017295	CATAA	2	10	14194	14203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017295	CTTAA	2	10	14972	14981	40 %	40 %	0 %	20 %	384456726
12	NC_017295	GACAA	2	10	15380	15389	60 %	0 %	20 %	20 %	384456727
13	NC_017295	GGTAA	2	10	15889	15898	40 %	20 %	40 %	0 %	384456728
14	NC_017295	ATTTA	2	10	16506	16515	40 %	60 %	0 %	0 %	384456728
15	NC_017295	TGAAT	2	10	18531	18540	40 %	40 %	20 %	0 %	384456728
16	NC_017295	AAAAG	2	10	18985	18994	80 %	0 %	20 %	0 %	384456729
17	NC_017295	GTATG	2	10	19300	19309	20 %	40 %	40 %	0 %	384456729
18	NC_017295	TAATT	2	10	20208	20217	40 %	60 %	0 %	0 %	384456730
19	NC_017295	TACAG	2	10	23889	23898	40 %	20 %	20 %	20 %	384456734
20	NC_017295	GAAAA	2	10	25322	25331	80 %	0 %	20 %	0 %	384456735
21	NC_017295	TGATT	2	10	25413	25422	20 %	60 %	20 %	0 %	384456735
22	NC_017295	AGAGG	2	10	26534	26543	40 %	0 %	60 %	0 %	384456736
23	NC_017295	AAAGA	2	10	28933	28942	80 %	0 %	20 %	0 %	384456738
24	NC_017295	AAGAA	2	10	29109	29118	80 %	0 %	20 %	0 %	384456738
25	NC_017295	TATAT	2	10	31983	31992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017295	AGAGG	2	10	32389	32398	40 %	0 %	60 %	0 %	384456740
27	NC_017295	TATAA	2	10	33844	33853	60 %	40 %	0 %	0 %	384456741
28	NC_017295	ATTTT	2	10	34191	34200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017295	TTAAT	2	10	34342	34351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017295	CATTT	2	10	35480	35489	20 %	60 %	0 %	20 %	384456742
31	NC_017295	GATTT	2	10	35934	35943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017295	GTTTA	2	10	38452	38461	20 %	60 %	20 %	0 %	384456746
33	NC_017295	AATTT	2	10	38669	38678	40 %	60 %	0 %	0 %	384456746
34	NC_017295	ATTGA	2	10	39351	39360	40 %	40 %	20 %	0 %	384456746
35	NC_017295	AATTA	2	10	40063	40072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017295	ATGGA	2	10	40684	40693	40 %	20 %	40 %	0 %	384456747
37	NC_017295	ATATA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	384456748
38	NC_017295	TACAT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017295	CTTTA	2	10	42181	42190	20 %	60 %	0 %	20 %	384456749
40	NC_017295	AGGAG	2	10	42685	42694	40 %	0 %	60 %	0 %	384456749
41	NC_017295	TAATT	2	10	42789	42798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017295	AGGAA	2	10	43141	43150	60 %	0 %	40 %	0 %	384456750
43	NC_017295	ATTTT	2	10	44301	44310	20 %	80 %	0 %	0 %	384456751
44	NC_017295	TATAT	2	10	45728	45737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017295	TTTTG	2	10	46847	46856	0 %	80 %	20 %	0 %	384456753
46	NC_017295	ACAAA	2	10	49445	49454	80 %	0 %	0 %	20 %	384456755
47	NC_017295	TAAAT	2	10	49893	49902	60 %	40 %	0 %	0 %	384456756
48	NC_017295	AATAA	2	10	50107	50116	80 %	20 %	0 %	0 %	384456757
49	NC_017295	TGGTT	2	10	52044	52053	0 %	60 %	40 %	0 %	384456757
50	NC_017295	TTAGT	2	10	53480	53489	20 %	60 %	20 %	0 %	384456757
51	NC_017295	AGATA	2	10	55011	55020	60 %	20 %	20 %	0 %	384456758
52	NC_017295	CATTT	2	10	57553	57562	20 %	60 %	0 %	20 %	384456762
53	NC_017295	GAAAA	2	10	59205	59214	80 %	0 %	20 %	0 %	384456763
54	NC_017295	AGTGC	2	10	59479	59488	20 %	20 %	40 %	20 %	384456764
55	NC_017295	AGAAT	2	10	60599	60608	60 %	20 %	20 %	0 %	384456767
56	NC_017295	AATCA	2	10	60983	60992	60 %	20 %	0 %	20 %	384456767
57	NC_017295	TAAAT	2	10	61173	61182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017295	TAAAT	2	10	62510	62519	60 %	40 %	0 %	0 %	384456770
59	NC_017295	TAATA	2	10	63336	63345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017295	TTTTA	2	10	64589	64598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017295	AGAAA	2	10	67393	67402	80 %	0 %	20 %	0 %	384456777
62	NC_017295	GTTGT	2	10	75334	75343	0 %	60 %	40 %	0 %	384456780
63	NC_017295	AAGGC	2	10	77541	77550	40 %	0 %	40 %	20 %	384456784
64	NC_017295	TAAAA	2	10	79356	79365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017295	AAGTT	2	10	80333	80342	40 %	40 %	20 %	0 %	384456787
66	NC_017295	TTAAA	2	10	80393	80402	60 %	40 %	0 %	0 %	384456787
67	NC_017295	AATTA	2	10	80424	80433	60 %	40 %	0 %	0 %	384456787
68	NC_017295	ATAGT	2	10	81877	81886	40 %	40 %	20 %	0 %	384456789
69	NC_017295	TTAAA	2	10	86221	86230	60 %	40 %	0 %	0 %	384456795
70	NC_017295	TAAAA	2	10	86357	86366	80 %	20 %	0 %	0 %	384456795
71	NC_017295	AATTA	2	10	86706	86715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017295	ATTTT	2	10	86872	86881	20 %	80 %	0 %	0 %	384456796
73	NC_017295	ATGTT	2	10	88870	88879	20 %	60 %	20 %	0 %	384456799
74	NC_017295	CATTA	2	10	89686	89695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017295	AAATA	2	10	89958	89967	80 %	20 %	0 %	0 %	384456801
76	NC_017295	TAAGT	2	10	91911	91920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017295	AAAAT	2	10	93485	93494	80 %	20 %	0 %	0 %	384456803
78	NC_017295	GTGAT	2	10	97036	97045	20 %	40 %	40 %	0 %	384456808
79	NC_017295	AAAAG	2	10	97519	97528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017295	TACAT	2	10	98767	98776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017295	GATGG	2	10	104077	104086	20 %	20 %	60 %	0 %	384456814
82	NC_017295	TCTTA	2	10	104173	104182	20 %	60 %	0 %	20 %	384456814
83	NC_017295	TCCTT	2	10	104517	104526	0 %	60 %	0 %	40 %	384456814
84	NC_017295	AAGAA	2	10	105613	105622	80 %	0 %	20 %	0 %	384456815
85	NC_017295	CAGCT	2	10	106066	106075	20 %	20 %	20 %	40 %	384456816
86	NC_017295	AAATG	2	10	106768	106777	60 %	20 %	20 %	0 %	384456817
87	NC_017295	ATGGA	2	10	107112	107121	40 %	20 %	40 %	0 %	384456817
88	NC_017295	AAAGA	2	10	107593	107602	80 %	0 %	20 %	0 %	384456817
89	NC_017295	AGATA	2	10	108410	108419	60 %	20 %	20 %	0 %	384456818
90	NC_017295	TAAAG	2	10	111041	111050	60 %	20 %	20 %	0 %	384456820
91	NC_017295	AGTAA	2	10	112436	112445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017295	TAAAA	2	10	113785	113794	80 %	20 %	0 %	0 %	384456822
93	NC_017295	GTAAA	2	10	115978	115987	60 %	20 %	20 %	0 %	384456823
94	NC_017295	GAAGT	2	10	116352	116361	40 %	20 %	40 %	0 %	384456825
95	NC_017295	TAAAA	2	10	116548	116557	80 %	20 %	0 %	0 %	384456825
96	NC_017295	AAGAA	2	10	117046	117055	80 %	0 %	20 %	0 %	384456825
97	NC_017295	AAAAG	2	10	117466	117475	80 %	0 %	20 %	0 %	384456826
98	NC_017295	CCTTC	2	10	118303	118312	0 %	40 %	0 %	60 %	384456827
99	NC_017295	GAAAA	2	10	118959	118968	80 %	0 %	20 %	0 %	384456827
100	NC_017295	AAAGA	2	10	120039	120048	80 %	0 %	20 %	0 %	384456829
101	NC_017295	CAATC	2	10	122036	122045	40 %	20 %	0 %	40 %	384456830
102	NC_017295	GATAC	2	10	124106	124115	40 %	20 %	20 %	20 %	384456832
103	NC_017295	AATAA	2	10	124285	124294	80 %	20 %	0 %	0 %	384456832
104	NC_017295	ATTTT	2	10	124728	124737	20 %	80 %	0 %	0 %	384456832
105	NC_017295	GTATT	2	10	128917	128926	20 %	60 %	20 %	0 %	384456837
106	NC_017295	CAATA	2	10	129047	129056	60 %	20 %	0 %	20 %	384456837
107	NC_017295	GGAGA	2	10	130479	130488	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017295	AGATG	2	10	131001	131010	40 %	20 %	40 %	0 %	384456838
109	NC_017295	CAAGC	2	10	132498	132507	40 %	0 %	20 %	40 %	384456839
110	NC_017295	ATGGA	2	10	132579	132588	40 %	20 %	40 %	0 %	384456839
111	NC_017295	GAACT	2	10	133962	133971	40 %	20 %	20 %	20 %	384456841
112	NC_017295	AAGCT	2	10	134238	134247	40 %	20 %	20 %	20 %	384456842
113	NC_017295	ATATT	2	10	135610	135619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017295	AATAG	2	10	136518	136527	60 %	20 %	20 %	0 %	384456844
115	NC_017295	GATTT	2	10	136930	136939	20 %	60 %	20 %	0 %	384456844
116	NC_017295	GCGGT	2	10	138279	138288	0 %	20 %	60 %	20 %	384456845
117	NC_017295	CTGTT	2	10	138744	138753	0 %	60 %	20 %	20 %	384456846
118	NC_017295	AAAAG	2	10	140287	140296	80 %	0 %	20 %	0 %	384456849
119	NC_017295	TATTT	2	10	141885	141894	20 %	80 %	0 %	0 %	384456851
120	NC_017295	TAAAA	2	10	142377	142386	80 %	20 %	0 %	0 %	384456852
121	NC_017295	TACCT	2	10	142960	142969	20 %	40 %	0 %	40 %	384456853
122	NC_017295	TTATA	2	10	144441	144450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017295	TTCTT	2	10	145982	145991	0 %	80 %	0 %	20 %	384456857
124	NC_017295	ATAAG	2	10	148899	148908	60 %	20 %	20 %	0 %	384456860
125	NC_017295	TATAA	2	10	149435	149444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017295	ATAGT	2	10	150847	150856	40 %	40 %	20 %	0 %	384456864
127	NC_017295	CTTAA	2	10	151944	151953	40 %	40 %	0 %	20 %	384456864
128	NC_017295	AAAAT	2	10	154466	154475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017295	ATAAA	2	10	154822	154831	80 %	20 %	0 %	0 %	384456868
130	NC_017295	ACTTT	2	10	156088	156097	20 %	60 %	0 %	20 %	384456870
131	NC_017295	ATATT	2	10	157437	157446	40 %	60 %	0 %	0 %	384456871
132	NC_017295	ATAGA	2	10	157748	157757	60 %	20 %	20 %	0 %	384456871
133	NC_017295	TCGTG	2	10	159374	159383	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017295	AGATT	2	10	162808	162817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017295	CATAA	2	10	162821	162830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017295	TGATA	2	10	163228	163237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017295	TCGTG	2	10	164512	164521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017295	AGATT	2	10	167946	167955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017295	CATAA	2	10	167959	167968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017295	TGATA	2	10	168366	168375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017295	TCGTG	2	10	169650	169659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017295	AGATT	2	10	173084	173093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017295	CATAA	2	10	173097	173106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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