MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 2757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017293	GCC	2	6	73795	73800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191109
1502	NC_017293	CTC	2	6	73860	73865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191109
1503	NC_017293	AGC	2	6	73990	73995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1504	NC_017293	AGC	2	6	74003	74008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1505	NC_017293	GC	3	6	74041	74046	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
1506	NC_017293	AGC	2	6	74053	74058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1507	NC_017293	GCA	2	6	74092	74097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1508	NC_017293	GC	4	8	74146	74153	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
1509	NC_017293	GC	3	6	74164	74169	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
1510	NC_017293	GTA	2	6	74173	74178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191109
1511	NC_017293	ATG	2	6	74218	74223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191109
1512	NC_017293	CAC	2	6	74247	74252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191109
1513	NC_017293	CTG	2	6	74282	74287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1514	NC_017293	CAG	2	6	74293	74298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191109
1515	NC_017293	GCT	2	6	74362	74367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191110
1516	NC_017293	GC	3	6	74376	74381	0 %	0 %	50 %	50 %	409191110
1517	NC_017293	AGCA	2	8	74383	74390	50 %	0 %	25 %	25 %	409191110
1518	NC_017293	CGG	2	6	74415	74420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191110
1519	NC_017293	CCA	2	6	74441	74446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191110
1520	NC_017293	CCT	2	6	74450	74455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191110
1521	NC_017293	CAC	2	6	74565	74570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191110
1522	NC_017293	GC	4	8	74582	74589	0 %	0 %	50 %	50 %	409191110
1523	NC_017293	TGC	2	6	74619	74624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191110
1524	NC_017293	CCATG	2	10	74644	74653	20 %	20 %	20 %	40 %	409191110
1525	NC_017293	CAA	2	6	74685	74690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191110
1526	NC_017293	TTG	2	6	74709	74714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191110
1527	NC_017293	GCA	2	6	74724	74729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191110
1528	NC_017293	CAT	2	6	74785	74790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191110
1529	NC_017293	CGC	3	9	74817	74825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191110
1530	NC_017293	CAT	2	6	74875	74880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191110
1531	NC_017293	CGC	2	6	74934	74939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191110
1532	NC_017293	CCCA	2	8	74971	74978	25 %	0 %	0 %	75 %	409191110
1533	NC_017293	ACC	2	6	75011	75016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191110
1534	NC_017293	TGT	2	6	75018	75023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191110
1535	NC_017293	C	6	6	75112	75117	0 %	0 %	0 %	100 %	409191111
1536	NC_017293	GCTGC	2	10	75122	75131	0 %	20 %	40 %	40 %	409191111
1537	NC_017293	CTC	2	6	75184	75189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191111
1538	NC_017293	CAC	2	6	75204	75209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191111
1539	NC_017293	ATG	2	6	75257	75262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191111
1540	NC_017293	TG	3	6	75301	75306	0 %	50 %	50 %	0 %	409191111
1541	NC_017293	CCA	2	6	75314	75319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191111
1542	NC_017293	GC	3	6	75338	75343	0 %	0 %	50 %	50 %	409191111
1543	NC_017293	AGG	2	6	75446	75451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191111
1544	NC_017293	GCA	2	6	75462	75467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191111
1545	NC_017293	ACG	2	6	75485	75490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191111
1546	NC_017293	CCG	2	6	75542	75547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191111
1547	NC_017293	CAG	2	6	75589	75594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191111
1548	NC_017293	GC	4	8	75655	75662	0 %	0 %	50 %	50 %	409191111
1549	NC_017293	AGC	2	6	75734	75739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191111
1550	NC_017293	CGC	2	6	75755	75760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191111
1551	NC_017293	GCCAT	2	10	75820	75829	20 %	20 %	20 %	40 %	409191112
1552	NC_017293	CTC	2	6	75838	75843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191112
1553	NC_017293	CCA	2	6	75904	75909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191112
1554	NC_017293	GCG	2	6	76049	76054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191112
1555	NC_017293	CCAT	2	8	76087	76094	25 %	25 %	0 %	50 %	409191112
1556	NC_017293	CAT	2	6	76137	76142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191112
1557	NC_017293	TGC	2	6	76247	76252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191112
1558	NC_017293	ACT	2	6	76264	76269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191112
1559	NC_017293	CCG	2	6	76277	76282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191112
1560	NC_017293	CG	3	6	76281	76286	0 %	0 %	50 %	50 %	409191112
1561	NC_017293	GCC	2	6	76320	76325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191112
1562	NC_017293	GGC	2	6	76432	76437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191113
1563	NC_017293	TTG	2	6	76455	76460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191113
1564	NC_017293	TTG	2	6	76462	76467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191113
1565	NC_017293	TGG	2	6	76508	76513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191113
1566	NC_017293	CGAG	2	8	76558	76565	25 %	0 %	50 %	25 %	409191113
1567	NC_017293	CG	3	6	76570	76575	0 %	0 %	50 %	50 %	409191113
1568	NC_017293	GAA	2	6	76576	76581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191113
1569	NC_017293	AC	3	6	76609	76614	50 %	0 %	0 %	50 %	409191113
1570	NC_017293	CAA	2	6	76665	76670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191113
1571	NC_017293	CG	3	6	76672	76677	0 %	0 %	50 %	50 %	409191113
1572	NC_017293	AGC	2	6	76742	76747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191113
1573	NC_017293	CGA	2	6	76785	76790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191113
1574	NC_017293	GCTT	2	8	76825	76832	0 %	50 %	25 %	25 %	409191113
1575	NC_017293	CAT	2	6	76834	76839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191113
1576	NC_017293	CTG	2	6	76861	76866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191113
1577	NC_017293	GAA	2	6	76879	76884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191113
1578	NC_017293	GCA	2	6	76995	77000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017293	CCTGG	2	10	77079	77088	0 %	20 %	40 %	40 %	409191114
1580	NC_017293	GC	3	6	77106	77111	0 %	0 %	50 %	50 %	409191114
1581	NC_017293	CCG	2	6	77195	77200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191114
1582	NC_017293	AGC	2	6	77206	77211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191114
1583	NC_017293	AAT	2	6	77326	77331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191114
1584	NC_017293	AC	3	6	77396	77401	50 %	0 %	0 %	50 %	409191114
1585	NC_017293	CAA	2	6	77432	77437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191114
1586	NC_017293	TCA	2	6	77459	77464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191114
1587	NC_017293	GCA	2	6	77489	77494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191114
1588	NC_017293	CTC	2	6	77539	77544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191114
1589	NC_017293	TAGG	2	8	77624	77631	25 %	25 %	50 %	0 %	409191114
1590	NC_017293	CGCAA	2	10	77686	77695	40 %	0 %	20 %	40 %	409191115
1591	NC_017293	AGC	2	6	77711	77716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1592	NC_017293	TTC	2	6	77741	77746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191115
1593	NC_017293	CCG	2	6	77751	77756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191115
1594	NC_017293	GCGAG	2	10	77817	77826	20 %	0 %	60 %	20 %	409191115
1595	NC_017293	GCA	2	6	77859	77864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1596	NC_017293	TG	3	6	77874	77879	0 %	50 %	50 %	0 %	409191115
1597	NC_017293	GCCT	2	8	78001	78008	0 %	25 %	25 %	50 %	409191115
1598	NC_017293	CAG	2	6	78072	78077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1599	NC_017293	GCT	2	6	78080	78085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1600	NC_017293	CGT	2	6	78096	78101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1601	NC_017293	AGAAGT	2	12	78120	78131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409191115
1602	NC_017293	AGC	2	6	78157	78162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1603	NC_017293	GCA	2	6	78200	78205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1604	NC_017293	GTG	2	6	78234	78239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191115
1605	NC_017293	GCC	2	6	78292	78297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191115
1606	NC_017293	TGA	2	6	78301	78306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191115
1607	NC_017293	CAG	2	6	78319	78324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1608	NC_017293	GTG	2	6	78326	78331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191115
1609	NC_017293	TGC	2	6	78335	78340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1610	NC_017293	C	6	6	78351	78356	0 %	0 %	0 %	100 %	409191115
1611	NC_017293	CGC	3	9	78399	78407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191115
1612	NC_017293	GCA	2	6	78447	78452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
1613	NC_017293	GTA	2	6	78459	78464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191115
1614	NC_017293	CCTT	2	8	78530	78537	0 %	50 %	0 %	50 %	409191115
1615	NC_017293	CCAGC	2	10	78603	78612	20 %	0 %	20 %	60 %	409191115
1616	NC_017293	GCTG	2	8	78635	78642	0 %	25 %	50 %	25 %	409191115
1617	NC_017293	CGA	2	6	78643	78648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191115
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1619	NC_017293	CAT	2	6	78715	78720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191115
1620	NC_017293	ATG	2	6	78779	78784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191116
1621	NC_017293	ACC	2	6	79006	79011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191116
1622	NC_017293	GTCAGT	2	12	79098	79109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409191116
1623	NC_017293	CG	3	6	79127	79132	0 %	0 %	50 %	50 %	409191116
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1625	NC_017293	TGC	2	6	79243	79248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191117
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1744	NC_017293	CG	3	6	85862	85867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1745	NC_017293	GCA	2	6	85920	85925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1746	NC_017293	CG	3	6	85944	85949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1747	NC_017293	GC	3	6	86056	86061	0 %	0 %	50 %	50 %	409191134
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1998	NC_017293	TTCG	2	8	100043	100050	0 %	50 %	25 %	25 %	409191148
1999	NC_017293	CACC	2	8	100165	100172	25 %	0 %	0 %	75 %	409191148
2000	NC_017293	TCC	2	6	100173	100178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191148

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