MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 24909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017292	TC	3	6	190221	190226	0 %	50 %	0 %	50 %	384454213
4002	NC_017292	CAG	2	6	190241	190246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454213
4003	NC_017292	GCCTTG	2	12	190272	190283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454213
4004	NC_017292	TTA	2	6	190309	190314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454213
4005	NC_017292	CGG	2	6	190321	190326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384454213
4006	NC_017292	TCT	2	6	190357	190362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4007	NC_017292	CAC	2	6	190395	190400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454213
4008	NC_017292	AAG	2	6	190535	190540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454213
4009	NC_017292	CTT	2	6	190592	190597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4010	NC_017292	TTAT	2	8	190676	190683	25 %	75 %	0 %	0 %	384454213
4011	NC_017292	TTC	3	9	190691	190699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4012	NC_017292	ATG	2	6	190739	190744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454213
4013	NC_017292	GAT	2	6	190798	190803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454213
4014	NC_017292	GT	3	6	190828	190833	0 %	50 %	50 %	0 %	384454213
4015	NC_017292	GGT	2	6	190883	190888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454213
4016	NC_017292	GCA	2	6	190944	190949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454213
4017	NC_017292	TTC	2	6	191014	191019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4018	NC_017292	GATAA	2	10	191021	191030	60 %	20 %	20 %	0 %	384454213
4019	NC_017292	ATTT	2	8	191033	191040	25 %	75 %	0 %	0 %	384454213
4020	NC_017292	CTAT	2	8	191108	191115	25 %	50 %	0 %	25 %	384454213
4021	NC_017292	TGA	2	6	191118	191123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454213
4022	NC_017292	TCT	2	6	191153	191158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4023	NC_017292	TAA	2	6	191212	191217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454213
4024	NC_017292	ACA	2	6	191224	191229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454213
4025	NC_017292	TTA	2	6	191255	191260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454213
4026	NC_017292	TCT	2	6	191335	191340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4027	NC_017292	CTT	3	9	191371	191379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4028	NC_017292	A	6	6	191382	191387	100 %	0 %	0 %	0 %	384454213
4029	NC_017292	ATA	2	6	191445	191450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454213
4030	NC_017292	TCA	2	6	191454	191459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454213
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4032	NC_017292	TTAA	2	8	191516	191523	50 %	50 %	0 %	0 %	384454213
4033	NC_017292	A	6	6	191535	191540	100 %	0 %	0 %	0 %	384454213
4034	NC_017292	GAA	2	6	191547	191552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454213
4035	NC_017292	CAA	2	6	191568	191573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454213
4036	NC_017292	ATT	3	9	191593	191601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454213
4037	NC_017292	TGG	2	6	191605	191610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454213
4038	NC_017292	TCA	2	6	191634	191639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454213
4039	NC_017292	ATC	2	6	191668	191673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454213
4040	NC_017292	CTT	2	6	191693	191698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454213
4041	NC_017292	GAAA	2	8	191720	191727	75 %	0 %	25 %	0 %	384454213
4042	NC_017292	ACA	2	6	191728	191733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454213
4043	NC_017292	TTG	2	6	191748	191753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017292	AGAT	2	8	191791	191798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017292	ACG	2	6	191814	191819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017292	TTC	2	6	191846	191851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454214
4047	NC_017292	AT	3	6	191871	191876	50 %	50 %	0 %	0 %	384454214
4048	NC_017292	TCT	2	6	191901	191906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454214
4049	NC_017292	TGC	2	6	191936	191941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454214
4050	NC_017292	GTG	2	6	192082	192087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454214
4051	NC_017292	CTT	2	6	192141	192146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454214
4052	NC_017292	T	6	6	192188	192193	0 %	100 %	0 %	0 %	384454214
4053	NC_017292	GAAG	2	8	192245	192252	50 %	0 %	50 %	0 %	384454214
4054	NC_017292	AAG	2	6	192301	192306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454214
4055	NC_017292	ATC	2	6	192349	192354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454214
4056	NC_017292	GTG	2	6	192469	192474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454214
4057	NC_017292	TTA	2	6	192528	192533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454214
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4059	NC_017292	T	6	6	192658	192663	0 %	100 %	0 %	0 %	384454214
4060	NC_017292	TTG	2	6	192768	192773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454214
4061	NC_017292	TGA	2	6	192797	192802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454214
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4063	NC_017292	ATG	2	6	192865	192870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454214
4064	NC_017292	A	6	6	192874	192879	100 %	0 %	0 %	0 %	384454214
4065	NC_017292	A	6	6	192884	192889	100 %	0 %	0 %	0 %	384454214
4066	NC_017292	AGC	2	6	192911	192916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454214
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4070	NC_017292	AGGG	2	8	193018	193025	25 %	0 %	75 %	0 %	384454214
4071	NC_017292	GGA	2	6	193110	193115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454214
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4073	NC_017292	TTCA	2	8	193176	193183	25 %	50 %	0 %	25 %	384454214
4074	NC_017292	A	6	6	193202	193207	100 %	0 %	0 %	0 %	384454214
4075	NC_017292	CCCTT	2	10	193225	193234	0 %	40 %	0 %	60 %	384454214
4076	NC_017292	TGA	2	6	193253	193258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454214
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4083	NC_017292	TCAT	2	8	193531	193538	25 %	50 %	0 %	25 %	384454214
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4087	NC_017292	CT	3	6	193716	193721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017292	GTTT	2	8	193724	193731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017292	TTA	2	6	193794	193799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017292	GTT	2	6	193876	193881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017292	TTTTA	2	10	193926	193935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017292	TTC	2	6	193942	193947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017292	T	8	8	194009	194016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_017292	TTATT	2	10	194236	194245	20 %	80 %	0 %	0 %	384454215
4097	NC_017292	CTG	2	6	194302	194307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454215
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4102	NC_017292	ATTT	2	8	194440	194447	25 %	75 %	0 %	0 %	384454215
4103	NC_017292	TGA	3	9	194552	194560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454215
4104	NC_017292	ACAATC	2	12	194582	194593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384454215
4105	NC_017292	TAG	2	6	194630	194635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454215
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4107	NC_017292	ATT	2	6	194727	194732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454215
4108	NC_017292	GA	3	6	194798	194803	50 %	0 %	50 %	0 %	384454215
4109	NC_017292	TGT	2	6	194819	194824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454215
4110	NC_017292	TCA	2	6	194850	194855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454215
4111	NC_017292	GTT	2	6	194900	194905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454215
4112	NC_017292	ATT	2	6	194957	194962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454215
4113	NC_017292	AC	3	6	194964	194969	50 %	0 %	0 %	50 %	384454215
4114	NC_017292	AAT	2	6	195018	195023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454215
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4120	NC_017292	ACA	2	6	195193	195198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454215
4121	NC_017292	TGT	2	6	195283	195288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017292	CCCTA	2	10	195289	195298	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4124	NC_017292	ATT	2	6	195414	195419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_017292	CAA	2	6	200371	200376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454219
4254	NC_017292	GCT	2	6	200385	200390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454219
4255	NC_017292	CTG	2	6	200402	200407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454219
4256	NC_017292	GA	3	6	200446	200451	50 %	0 %	50 %	0 %	384454219
4257	NC_017292	GTT	2	6	200508	200513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454219
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4265	NC_017292	AGT	2	6	200774	200779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454219
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4271	NC_017292	CCT	2	6	201044	201049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4272	NC_017292	ATTAA	2	10	201065	201074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_017292	TAAT	2	8	201081	201088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_017292	ATC	2	6	201278	201283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454220
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4277	NC_017292	A	6	6	201406	201411	100 %	0 %	0 %	0 %	384454220
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4279	NC_017292	GT	3	6	201470	201475	0 %	50 %	50 %	0 %	384454220
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4284	NC_017292	CCT	2	6	201679	201684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454221
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4289	NC_017292	TCT	2	6	201895	201900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454221
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4291	NC_017292	TCAT	2	8	201970	201977	25 %	50 %	0 %	25 %	384454221
4292	NC_017292	A	6	6	202134	202139	100 %	0 %	0 %	0 %	384454221
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4338	NC_017292	TTG	2	6	204115	204120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4360	NC_017292	TAATG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	384454223
4361	NC_017292	TCT	2	6	205090	205095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_017292	AAT	2	6	205157	205162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_017292	T	7	7	205162	205168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_017292	GAT	2	6	205177	205182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017292	TCT	2	6	205196	205201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_017292	CAAA	2	8	205217	205224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4367	NC_017292	TAG	2	6	205254	205259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_017292	AGAA	2	8	205334	205341	75 %	0 %	25 %	0 %	384454224
4369	NC_017292	ACG	2	6	205369	205374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454224
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4372	NC_017292	TGG	2	6	205483	205488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454224
4373	NC_017292	GCT	2	6	205595	205600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454224
4374	NC_017292	TTTA	2	8	205663	205670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_017292	GAC	2	6	205705	205710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454225
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