MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 24909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017292	AGAAA	2	10	143348	143357	80 %	0 %	20 %	0 %	384454170
3003	NC_017292	ATT	2	6	143360	143365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454170
3004	NC_017292	TAC	2	6	143378	143383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454170
3005	NC_017292	TGA	2	6	143522	143527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454170
3006	NC_017292	TAC	2	6	143557	143562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454170
3007	NC_017292	CAG	2	6	143566	143571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454170
3008	NC_017292	TTG	3	9	143626	143634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454170
3009	NC_017292	TA	3	6	143689	143694	50 %	50 %	0 %	0 %	384454170
3010	NC_017292	ATG	2	6	143797	143802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454170
3011	NC_017292	TAT	2	6	143816	143821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454170
3012	NC_017292	ATT	2	6	143868	143873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454170
3013	NC_017292	TAG	2	6	143905	143910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454170
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3015	NC_017292	GTG	2	6	143917	143922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454170
3016	NC_017292	AGA	2	6	143923	143928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454170
3017	NC_017292	TTG	2	6	143934	143939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454170
3018	NC_017292	TTA	2	6	144033	144038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454171
3019	NC_017292	AAT	2	6	144070	144075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454171
3020	NC_017292	GAG	2	6	144099	144104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454171
3021	NC_017292	TCTA	2	8	144142	144149	25 %	50 %	0 %	25 %	384454171
3022	NC_017292	T	6	6	144235	144240	0 %	100 %	0 %	0 %	384454171
3023	NC_017292	TTG	2	6	144270	144275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454171
3024	NC_017292	ATA	2	6	144435	144440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454171
3025	NC_017292	CAG	2	6	144443	144448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454171
3026	NC_017292	TAG	2	6	144453	144458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454171
3027	NC_017292	ATCA	2	8	144493	144500	50 %	25 %	0 %	25 %	384454171
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3029	NC_017292	TGT	2	6	144665	144670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454171
3030	NC_017292	AT	3	6	144769	144774	50 %	50 %	0 %	0 %	384454171
3031	NC_017292	T	6	6	144826	144831	0 %	100 %	0 %	0 %	384454171
3032	NC_017292	AAT	2	6	144845	144850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454171
3033	NC_017292	TGAA	2	8	144857	144864	50 %	25 %	25 %	0 %	384454171
3034	NC_017292	GGAA	3	12	144865	144876	50 %	0 %	50 %	0 %	384454171
3035	NC_017292	TCC	2	6	144877	144882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454171
3036	NC_017292	AGTA	2	8	144898	144905	50 %	25 %	25 %	0 %	384454171
3037	NC_017292	A	7	7	144914	144920	100 %	0 %	0 %	0 %	384454171
3038	NC_017292	TAT	2	6	144991	144996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017292	TAA	2	6	144998	145003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017292	AAT	2	6	145084	145089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454172
3041	NC_017292	A	7	7	145117	145123	100 %	0 %	0 %	0 %	384454172
3042	NC_017292	TAT	2	6	145181	145186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454172
3043	NC_017292	T	7	7	145218	145224	0 %	100 %	0 %	0 %	384454172
3044	NC_017292	T	7	7	145269	145275	0 %	100 %	0 %	0 %	384454172
3045	NC_017292	TGTC	2	8	145287	145294	0 %	50 %	25 %	25 %	384454172
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3048	NC_017292	TTTA	2	8	145377	145384	25 %	75 %	0 %	0 %	384454172
3049	NC_017292	TTG	2	6	145400	145405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454172
3050	NC_017292	AC	3	6	145469	145474	50 %	0 %	0 %	50 %	384454172
3051	NC_017292	TTC	2	6	145496	145501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454172
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3053	NC_017292	ACT	2	6	145550	145555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454172
3054	NC_017292	TTA	2	6	145573	145578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454172
3055	NC_017292	CT	4	8	145667	145674	0 %	50 %	0 %	50 %	384454172
3056	NC_017292	TCC	2	6	145728	145733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454172
3057	NC_017292	T	6	6	145765	145770	0 %	100 %	0 %	0 %	384454172
3058	NC_017292	AGA	2	6	145791	145796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454172
3059	NC_017292	GAT	2	6	145905	145910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454172
3060	NC_017292	TA	3	6	145998	146003	50 %	50 %	0 %	0 %	384454172
3061	NC_017292	AAAGA	2	10	146013	146022	80 %	0 %	20 %	0 %	384454172
3062	NC_017292	AAG	2	6	146029	146034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454172
3063	NC_017292	ATA	2	6	146069	146074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454172
3064	NC_017292	TTAT	2	8	146095	146102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017292	TTAT	2	8	146130	146137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017292	GTAA	2	8	146151	146158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017292	CCT	2	6	146314	146319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454173
3068	NC_017292	TATT	2	8	146335	146342	25 %	75 %	0 %	0 %	384454173
3069	NC_017292	CTTT	2	8	146388	146395	0 %	75 %	0 %	25 %	384454173
3070	NC_017292	CTT	2	6	146415	146420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454173
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3079	NC_017292	AAG	2	6	146807	146812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017292	T	6	6	146817	146822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017292	TCA	2	6	146867	146872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454175
3082	NC_017292	ATAGGC	2	12	146933	146944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384454175
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3084	NC_017292	CTG	2	6	147070	147075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3086	NC_017292	TCT	2	6	147116	147121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017292	CTC	2	6	147159	147164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_017292	GAG	2	6	147194	147199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017292	T	6	6	147203	147208	0 %	100 %	0 %	0 %	384454176
3090	NC_017292	AT	3	6	147214	147219	50 %	50 %	0 %	0 %	384454176
3091	NC_017292	A	6	6	147239	147244	100 %	0 %	0 %	0 %	384454176
3092	NC_017292	TTG	2	6	147260	147265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454176
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3094	NC_017292	TAC	2	6	147383	147388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454176
3095	NC_017292	TTTA	2	8	147425	147432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017292	AATA	2	8	147480	147487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017292	AGT	2	6	147497	147502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017292	ATTT	3	12	147538	147549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017292	T	6	6	147594	147599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017292	ATT	2	6	147608	147613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017292	T	6	6	147618	147623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017292	T	7	7	147702	147708	0 %	100 %	0 %	0 %	384454177
3103	NC_017292	ACA	2	6	147718	147723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454177
3104	NC_017292	A	6	6	147739	147744	100 %	0 %	0 %	0 %	384454177
3105	NC_017292	CTT	2	6	147757	147762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454177
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3107	NC_017292	TGA	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454177
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3109	NC_017292	AAG	2	6	147860	147865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454177
3110	NC_017292	CAT	3	9	147883	147891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454177
3111	NC_017292	TGA	2	6	147910	147915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017292	G	6	6	147920	147925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017292	C	6	6	147926	147931	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3114	NC_017292	CAT	2	6	147948	147953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017292	TTCCGT	2	12	148028	148039	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017292	T	6	6	148081	148086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017292	TTTTA	2	10	148192	148201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017292	T	6	6	148204	148209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017292	ATT	2	6	148265	148270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017292	TAA	2	6	148275	148280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017292	AGA	2	6	148281	148286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017292	T	6	6	148353	148358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017292	GAA	2	6	148415	148420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017292	CAC	2	6	148474	148479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017292	CAA	2	6	148565	148570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_017292	TAAG	2	8	148605	148612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_017292	T	7	7	148650	148656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3365	NC_017292	GTT	3	9	160235	160243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3366	NC_017292	T	8	8	160287	160294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_017292	T	6	6	160329	160334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_017292	GGT	2	6	160371	160376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_017292	TTTC	2	8	160510	160517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3372	NC_017292	CTC	2	6	160806	160811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454186
3373	NC_017292	TGGATT	2	12	160820	160831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384454186
3374	NC_017292	GA	3	6	160846	160851	50 %	0 %	50 %	0 %	384454186
3375	NC_017292	CGA	2	6	160856	160861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454186
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