MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 24909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017292	AGT	2	6	70646	70651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454092
1502	NC_017292	ATA	2	6	70708	70713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454092
1503	NC_017292	AGG	2	6	70831	70836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454092
1504	NC_017292	GAA	3	9	70878	70886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454092
1505	NC_017292	T	7	7	70910	70916	0 %	100 %	0 %	0 %	384454092
1506	NC_017292	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384454092
1507	NC_017292	TTC	2	6	71021	71026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454092
1508	NC_017292	T	7	7	71076	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017292	A	7	7	71126	71132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017292	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_017292	ATA	2	6	71242	71247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017292	AAT	2	6	71295	71300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454093
1513	NC_017292	ACA	2	6	71315	71320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454093
1514	NC_017292	TCG	2	6	71343	71348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454093
1515	NC_017292	TGT	2	6	71418	71423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454093
1516	NC_017292	TAT	2	6	71455	71460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454093
1517	NC_017292	TGT	2	6	71523	71528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454093
1518	NC_017292	TCA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454093
1519	NC_017292	A	6	6	71686	71691	100 %	0 %	0 %	0 %	384454093
1520	NC_017292	T	6	6	71720	71725	0 %	100 %	0 %	0 %	384454093
1521	NC_017292	A	6	6	71744	71749	100 %	0 %	0 %	0 %	384454093
1522	NC_017292	GA	3	6	71762	71767	50 %	0 %	50 %	0 %	384454093
1523	NC_017292	ATC	2	6	71839	71844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454093
1524	NC_017292	AAG	2	6	71876	71881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454093
1525	NC_017292	TGT	2	6	71891	71896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454093
1526	NC_017292	AAC	2	6	71910	71915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454093
1527	NC_017292	GT	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	384454093
1528	NC_017292	GAA	2	6	72061	72066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454093
1529	NC_017292	AGA	2	6	72081	72086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454093
1530	NC_017292	GAA	2	6	72096	72101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454093
1531	NC_017292	T	6	6	72127	72132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017292	ATGT	2	8	72159	72166	25 %	50 %	25 %	0 %	384454094
1533	NC_017292	TGTT	2	8	72178	72185	0 %	75 %	25 %	0 %	384454094
1534	NC_017292	T	6	6	72210	72215	0 %	100 %	0 %	0 %	384454094
1535	NC_017292	AGA	2	6	72237	72242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454094
1536	NC_017292	T	7	7	72275	72281	0 %	100 %	0 %	0 %	384454094
1537	NC_017292	TGC	2	6	72306	72311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454094
1538	NC_017292	CAG	2	6	72343	72348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454094
1539	NC_017292	CAA	2	6	72405	72410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454094
1540	NC_017292	ATG	2	6	72425	72430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454094
1541	NC_017292	ACA	2	6	72455	72460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454094
1542	NC_017292	TCA	2	6	72569	72574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454094
1543	NC_017292	CCT	2	6	72635	72640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454094
1544	NC_017292	ATA	3	9	72655	72663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454094
1545	NC_017292	CAG	2	6	72672	72677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454094
1546	NC_017292	GAT	2	6	72741	72746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454094
1547	NC_017292	T	7	7	72841	72847	0 %	100 %	0 %	0 %	384454094
1548	NC_017292	ATAA	2	8	72891	72898	75 %	25 %	0 %	0 %	384454094
1549	NC_017292	AGC	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454094
1550	NC_017292	TAGGGC	2	12	72925	72936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384454094
1551	NC_017292	CCTGAT	2	12	72950	72961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384454094
1552	NC_017292	T	8	8	73035	73042	0 %	100 %	0 %	0 %	384454094
1553	NC_017292	T	7	7	73072	73078	0 %	100 %	0 %	0 %	384454094
1554	NC_017292	TCAT	2	8	73103	73110	25 %	50 %	0 %	25 %	384454094
1555	NC_017292	GTA	2	6	73202	73207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454095
1556	NC_017292	GCA	2	6	73208	73213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454095
1557	NC_017292	CTGC	2	8	73365	73372	0 %	25 %	25 %	50 %	384454095
1558	NC_017292	ACG	2	6	73407	73412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454095
1559	NC_017292	TGT	2	6	73511	73516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454095
1560	NC_017292	GTAA	2	8	73548	73555	50 %	25 %	25 %	0 %	384454095
1561	NC_017292	AAT	2	6	73661	73666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454095
1562	NC_017292	T	6	6	73671	73676	0 %	100 %	0 %	0 %	384454095
1563	NC_017292	TAG	2	6	73684	73689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454095
1564	NC_017292	GT	3	6	73700	73705	0 %	50 %	50 %	0 %	384454095
1565	NC_017292	TTG	2	6	73724	73729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454095
1566	NC_017292	TAA	2	6	73886	73891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454095
1567	NC_017292	AAT	2	6	73940	73945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454095
1568	NC_017292	CAA	2	6	73987	73992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454095
1569	NC_017292	TTA	3	9	74094	74102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017292	ACAA	2	8	74253	74260	75 %	0 %	0 %	25 %	384454096
1571	NC_017292	A	6	6	74304	74309	100 %	0 %	0 %	0 %	384454096
1572	NC_017292	TTAT	2	8	74338	74345	25 %	75 %	0 %	0 %	384454096
1573	NC_017292	ATT	2	6	74374	74379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454096
1574	NC_017292	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384454096
1575	NC_017292	T	6	6	74473	74478	0 %	100 %	0 %	0 %	384454096
1576	NC_017292	GGA	2	6	74563	74568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454096
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1578	NC_017292	TTTA	2	8	74696	74703	25 %	75 %	0 %	0 %	384454096
1579	NC_017292	GAA	2	6	74782	74787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454096
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1583	NC_017292	TC	3	6	75230	75235	0 %	50 %	0 %	50 %	384454097
1584	NC_017292	G	6	6	75243	75248	0 %	0 %	100 %	0 %	384454097
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1591	NC_017292	CTTA	2	8	75599	75606	25 %	50 %	0 %	25 %	384454097
1592	NC_017292	ATT	2	6	75610	75615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454097
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1596	NC_017292	CAA	2	6	75908	75913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454097
1597	NC_017292	ATT	2	6	75982	75987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454097
1598	NC_017292	CAG	2	6	76022	76027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454097
1599	NC_017292	TC	3	6	76035	76040	0 %	50 %	0 %	50 %	384454097
1600	NC_017292	ATC	2	6	76091	76096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_017292	A	7	7	76155	76161	100 %	0 %	0 %	0 %	384454098
1603	NC_017292	TGA	2	6	76213	76218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454098
1604	NC_017292	AATT	2	8	76246	76253	50 %	50 %	0 %	0 %	384454098
1605	NC_017292	GC	3	6	76267	76272	0 %	0 %	50 %	50 %	384454098
1606	NC_017292	GAA	2	6	76322	76327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454098
1607	NC_017292	TC	3	6	76334	76339	0 %	50 %	0 %	50 %	384454098
1608	NC_017292	TGT	2	6	76345	76350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454098
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1610	NC_017292	TC	3	6	76437	76442	0 %	50 %	0 %	50 %	384454098
1611	NC_017292	GTT	2	6	76453	76458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454098
1612	NC_017292	TCCA	2	8	76476	76483	25 %	25 %	0 %	50 %	384454098
1613	NC_017292	GAA	2	6	76487	76492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454098
1614	NC_017292	TGC	2	6	76516	76521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454098
1615	NC_017292	TCC	2	6	76529	76534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454098
1616	NC_017292	ATG	2	6	76554	76559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454098
1617	NC_017292	CA	3	6	76572	76577	50 %	0 %	0 %	50 %	384454098
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1619	NC_017292	TCT	2	6	76636	76641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454098
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1621	NC_017292	CT	3	6	76760	76765	0 %	50 %	0 %	50 %	384454098
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1624	NC_017292	CG	3	6	76870	76875	0 %	0 %	50 %	50 %	384454098
1625	NC_017292	AGC	2	6	76896	76901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454098
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