MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 24909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017292	AAC	2	6	23108	23113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454050
502	NC_017292	GGT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454050
503	NC_017292	AGC	2	6	23176	23181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454050
504	NC_017292	ATG	2	6	23266	23271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454050
505	NC_017292	AGC	2	6	23283	23288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454050
506	NC_017292	GCT	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454050
507	NC_017292	CTG	2	6	23380	23385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454050
508	NC_017292	ATG	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454050
509	NC_017292	TTA	2	6	23599	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454050
510	NC_017292	AAG	2	6	23656	23661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454050
511	NC_017292	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	384454050
512	NC_017292	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017292	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017292	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017292	TTG	2	6	24012	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
516	NC_017292	TGT	2	6	24049	24054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
517	NC_017292	AGT	2	6	24066	24071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454051
518	NC_017292	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
519	NC_017292	TCC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454051
520	NC_017292	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384454051
521	NC_017292	TTG	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
522	NC_017292	GAA	2	6	24364	24369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454051
523	NC_017292	T	6	6	24381	24386	0 %	100 %	0 %	0 %	384454051
524	NC_017292	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384454051
525	NC_017292	CTT	2	6	24518	24523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454051
526	NC_017292	AGG	2	6	24539	24544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454051
527	NC_017292	GTA	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454051
528	NC_017292	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454051
529	NC_017292	TTA	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
530	NC_017292	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384454051
531	NC_017292	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384454051
532	NC_017292	T	8	8	24798	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	384454051
533	NC_017292	TGT	2	6	24820	24825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
534	NC_017292	GCT	2	6	24850	24855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454051
535	NC_017292	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384454051
536	NC_017292	ATC	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454051
537	NC_017292	ACC	2	6	24966	24971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454051
538	NC_017292	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384454051
539	NC_017292	TTG	2	6	25010	25015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
540	NC_017292	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
541	NC_017292	ATT	2	6	25113	25118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
542	NC_017292	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454051
543	NC_017292	TTG	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
544	NC_017292	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384454051
545	NC_017292	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454051
546	NC_017292	TA	3	6	25504	25509	50 %	50 %	0 %	0 %	384454051
547	NC_017292	GCA	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454051
548	NC_017292	GTT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
549	NC_017292	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	384454051
550	NC_017292	TAA	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454051
551	NC_017292	CTT	3	9	25649	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454051
552	NC_017292	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
553	NC_017292	TTA	2	6	25753	25758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
554	NC_017292	TAT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
555	NC_017292	TCA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454051
556	NC_017292	CCA	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454051
557	NC_017292	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454051
558	NC_017292	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	384454051
559	NC_017292	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384454051
560	NC_017292	TTC	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454051
561	NC_017292	TCT	2	6	25918	25923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454051
562	NC_017292	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	384454051
563	NC_017292	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384454051
564	NC_017292	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454051
565	NC_017292	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	384454051
566	NC_017292	AAT	2	6	26118	26123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454051
567	NC_017292	TGT	2	6	26211	26216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454051
568	NC_017292	AGG	2	6	26295	26300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454051
569	NC_017292	AAC	2	6	26329	26334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454051
570	NC_017292	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	384454051
571	NC_017292	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	384454051
572	NC_017292	AGA	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454051
573	NC_017292	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017292	T	7	7	26579	26585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017292	TTC	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017292	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017292	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017292	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454052
579	NC_017292	A	6	6	26773	26778	100 %	0 %	0 %	0 %	384454052
580	NC_017292	CCA	2	6	26817	26822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454052
581	NC_017292	TTA	2	6	26824	26829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454052
582	NC_017292	CAA	2	6	26902	26907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
583	NC_017292	TGA	2	6	26910	26915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454052
584	NC_017292	AGA	2	6	26958	26963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
585	NC_017292	TAA	2	6	26973	26978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454052
586	NC_017292	CTG	2	6	27056	27061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454052
587	NC_017292	GTA	2	6	27065	27070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454052
588	NC_017292	ACA	2	6	27114	27119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
589	NC_017292	TTA	2	6	27133	27138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454052
590	NC_017292	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	384454052
591	NC_017292	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384454052
592	NC_017292	AAG	2	6	27275	27280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
593	NC_017292	AGC	2	6	27291	27296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
594	NC_017292	TA	3	6	27374	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	384454052
595	NC_017292	TCT	2	6	27415	27420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454052
596	NC_017292	GGT	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454052
597	NC_017292	TC	3	6	27459	27464	0 %	50 %	0 %	50 %	384454052
598	NC_017292	AGA	3	9	27564	27572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
599	NC_017292	ACA	2	6	27594	27599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
600	NC_017292	GCT	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454052
601	NC_017292	GTT	2	6	27793	27798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454052
602	NC_017292	CAG	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
603	NC_017292	CGC	2	6	27924	27929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384454052
604	NC_017292	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	384454052
605	NC_017292	TGA	2	6	27975	27980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454052
606	NC_017292	AAC	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
607	NC_017292	TAA	2	6	28008	28013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454052
608	NC_017292	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	384454052
609	NC_017292	TTG	2	6	28076	28081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454052
610	NC_017292	CTA	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454052
611	NC_017292	ACA	2	6	28105	28110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
612	NC_017292	AAG	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
613	NC_017292	GAC	2	6	28197	28202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
614	NC_017292	AAG	2	6	28262	28267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
615	NC_017292	CAA	2	6	28288	28293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454052
616	NC_017292	GCA	2	6	28369	28374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
617	NC_017292	T	6	6	28617	28622	0 %	100 %	0 %	0 %	384454052
618	NC_017292	TGC	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454052
619	NC_017292	CAG	2	6	28747	28752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
620	NC_017292	CTG	2	6	28754	28759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454052
621	NC_017292	AAAT	2	8	28809	28816	75 %	25 %	0 %	0 %	384454052
622	NC_017292	AGC	2	6	28836	28841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454052
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625	NC_017292	TAAGTG	2	12	29027	29038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454052
626	NC_017292	GAA	2	6	29077	29082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454052
627	NC_017292	GGCA	2	8	29087	29094	25 %	0 %	50 %	25 %	384454052
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762	NC_017292	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	384454061
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