MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 24909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017292	ACA	2	6	236465	236470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454253
5002	NC_017292	CAA	2	6	236472	236477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454253
5003	NC_017292	ACT	2	6	236485	236490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454253
5004	NC_017292	TCT	2	6	236500	236505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454253
5005	NC_017292	TTA	2	6	236516	236521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454253
5006	NC_017292	GTA	2	6	236523	236528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454253
5007	NC_017292	TC	4	8	236535	236542	0 %	50 %	0 %	50 %	384454253
5008	NC_017292	ATC	2	6	236559	236564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454253
5009	NC_017292	TCT	2	6	236681	236686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454253
5010	NC_017292	TG	4	8	236699	236706	0 %	50 %	50 %	0 %	384454253
5011	NC_017292	TC	4	8	236791	236798	0 %	50 %	0 %	50 %	384454253
5012	NC_017292	CTT	2	6	236858	236863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454253
5013	NC_017292	ATG	2	6	236873	236878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454253
5014	NC_017292	TGT	2	6	236908	236913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454253
5015	NC_017292	TGG	2	6	236937	236942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454253
5016	NC_017292	AG	3	6	237004	237009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017292	AT	3	6	237074	237079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017292	CTA	2	6	237183	237188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017292	CGA	2	6	237421	237426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5020	NC_017292	TGC	2	6	237432	237437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5021	NC_017292	T	6	6	237516	237521	0 %	100 %	0 %	0 %	384454254
5022	NC_017292	AAC	3	9	237591	237599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454254
5023	NC_017292	T	6	6	237606	237611	0 %	100 %	0 %	0 %	384454254
5024	NC_017292	GTT	2	6	237612	237617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454254
5025	NC_017292	TAA	2	6	237618	237623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454254
5026	NC_017292	TGC	2	6	237679	237684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5027	NC_017292	CTT	2	6	237698	237703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454254
5028	NC_017292	ACT	2	6	237750	237755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454254
5029	NC_017292	CTTT	2	8	237775	237782	0 %	75 %	0 %	25 %	384454254
5030	NC_017292	TGC	2	6	237867	237872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5031	NC_017292	CATC	2	8	237902	237909	25 %	25 %	0 %	50 %	384454254
5032	NC_017292	GCT	2	6	237919	237924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5033	NC_017292	CTT	2	6	237980	237985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454254
5034	NC_017292	CGA	2	6	238036	238041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454254
5035	NC_017292	CATG	2	8	238160	238167	25 %	25 %	25 %	25 %	384454254
5036	NC_017292	CTTG	2	8	238178	238185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_017292	GAAT	2	8	238229	238236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017292	GAA	3	9	238243	238251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017292	T	6	6	238266	238271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017292	AAG	2	6	238275	238280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017292	T	7	7	238290	238296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017292	AAG	2	6	238329	238334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017292	ACC	2	6	238348	238353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_017292	AATT	2	8	238368	238375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017292	GAT	2	6	238409	238414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017292	TTTC	2	8	238468	238475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_017292	GTT	2	6	238496	238501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017292	A	8	8	238536	238543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017292	AGA	2	6	238578	238583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017292	GAG	2	6	238664	238669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454255
5051	NC_017292	T	6	6	238724	238729	0 %	100 %	0 %	0 %	384454255
5052	NC_017292	GTT	2	6	238780	238785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454255
5053	NC_017292	CT	3	6	238787	238792	0 %	50 %	0 %	50 %	384454255
5054	NC_017292	AGC	2	6	238840	238845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454255
5055	NC_017292	TTG	2	6	238848	238853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454255
5056	NC_017292	CTC	2	6	238937	238942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454255
5057	NC_017292	CTTT	2	8	238983	238990	0 %	75 %	0 %	25 %	384454255
5058	NC_017292	T	6	6	238988	238993	0 %	100 %	0 %	0 %	384454255
5059	NC_017292	AGA	2	6	239140	239145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454255
5060	NC_017292	GATT	2	8	239151	239158	25 %	50 %	25 %	0 %	384454255
5061	NC_017292	GCA	2	6	239184	239189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454255
5062	NC_017292	ACTA	2	8	239360	239367	50 %	25 %	0 %	25 %	384454255
5063	NC_017292	TTG	2	6	239447	239452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454255
5064	NC_017292	GGA	2	6	239495	239500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454255
5065	NC_017292	AGGC	2	8	239518	239525	25 %	0 %	50 %	25 %	384454255
5066	NC_017292	AAG	2	6	239596	239601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454255
5067	NC_017292	T	7	7	239624	239630	0 %	100 %	0 %	0 %	384454255
5068	NC_017292	ATTATA	2	12	239710	239721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017292	A	6	6	239745	239750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017292	CTT	2	6	239782	239787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017292	TAT	2	6	239809	239814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017292	ATAA	2	8	239850	239857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017292	GA	3	6	239892	239897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017292	A	6	6	239927	239932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017292	GCA	2	6	239945	239950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017292	GCA	2	6	239955	239960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017292	CAA	2	6	240013	240018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017292	GCTT	2	8	240028	240035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_017292	TTC	2	6	240071	240076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017292	TAAAA	2	10	240127	240136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017292	T	6	6	240171	240176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017292	TCA	2	6	240178	240183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454256
5083	NC_017292	GAA	2	6	240207	240212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454256
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5085	NC_017292	A	6	6	240437	240442	100 %	0 %	0 %	0 %	384454256
5086	NC_017292	TAG	2	6	240543	240548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454256
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5088	NC_017292	AAAT	2	8	240666	240673	75 %	25 %	0 %	0 %	384454256
5089	NC_017292	TCT	2	6	240716	240721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454256
5090	NC_017292	GAG	2	6	240747	240752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454256
5091	NC_017292	CTT	2	6	240755	240760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454256
5092	NC_017292	GTTT	2	8	240899	240906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017292	TAG	2	6	240967	240972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017292	A	7	7	241059	241065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017292	AG	3	6	241101	241106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017292	TAT	2	6	241117	241122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017292	TCAT	2	8	241129	241136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_017292	ATA	2	6	241144	241149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017292	CGT	2	6	241165	241170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454257
5100	NC_017292	GAA	2	6	241202	241207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
5101	NC_017292	ATC	2	6	241249	241254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454257
5102	NC_017292	TAT	2	6	241286	241291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
5103	NC_017292	GAG	2	6	241301	241306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454257
5104	NC_017292	GAT	2	6	241325	241330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
5105	NC_017292	TTCAG	2	10	241355	241364	20 %	40 %	20 %	20 %	384454257
5106	NC_017292	TTG	2	6	241430	241435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454257
5107	NC_017292	CAT	2	6	241547	241552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454257
5108	NC_017292	ATT	2	6	241557	241562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
5109	NC_017292	GTTT	2	8	241668	241675	0 %	75 %	25 %	0 %	384454257
5110	NC_017292	AGG	2	6	241694	241699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454257
5111	NC_017292	TG	3	6	241752	241757	0 %	50 %	50 %	0 %	384454257
5112	NC_017292	ATT	2	6	241792	241797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
5113	NC_017292	TTC	2	6	241853	241858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454257
5114	NC_017292	AGA	2	6	241866	241871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
5115	NC_017292	TGA	2	6	241901	241906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
5116	NC_017292	TTG	2	6	241951	241956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454257
5117	NC_017292	CGG	2	6	241958	241963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384454257
5118	NC_017292	TTG	2	6	241969	241974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454257
5119	NC_017292	ATT	2	6	242004	242009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
5120	NC_017292	ATG	2	6	242074	242079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
5121	NC_017292	ATG	2	6	242106	242111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
5122	NC_017292	GCA	2	6	242136	242141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454257
5123	NC_017292	AAG	2	6	242158	242163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
5124	NC_017292	A	6	6	242181	242186	100 %	0 %	0 %	0 %	384454257
5125	NC_017292	TCA	2	6	242192	242197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454257
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5127	NC_017292	AT	3	6	242332	242337	50 %	50 %	0 %	0 %	384454257
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5131	NC_017292	TGA	2	6	242525	242530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
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5133	NC_017292	TTA	2	6	242601	242606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
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5166	NC_017292	AG	3	6	244067	244072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_017292	T	7	7	244081	244087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_017292	GTA	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454263
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5236	NC_017292	ATC	2	6	247607	247612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454263
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5238	NC_017292	T	6	6	247719	247724	0 %	100 %	0 %	0 %	384454264
5239	NC_017292	AAT	2	6	247813	247818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454264
5240	NC_017292	TCA	2	6	247850	247855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454264
5241	NC_017292	AAG	2	6	247857	247862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_017292	ATA	2	6	247956	247961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454265
5243	NC_017292	TAC	2	6	248045	248050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454265
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5245	NC_017292	TTGAG	2	10	248104	248113	20 %	40 %	40 %	0 %	384454265
5246	NC_017292	GTT	2	6	248170	248175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454265
5247	NC_017292	GAT	2	6	248220	248225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454265
5248	NC_017292	GA	3	6	248274	248279	50 %	0 %	50 %	0 %	384454265
5249	NC_017292	TATT	2	8	248290	248297	25 %	75 %	0 %	0 %	384454265
5250	NC_017292	GAA	2	6	248346	248351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454265
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5497	NC_017292	T	6	6	260083	260088	0 %	100 %	0 %	0 %	384454277
5498	NC_017292	CAG	2	6	260089	260094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454277
5499	NC_017292	CTT	2	6	260095	260100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454277
5500	NC_017292	ATC	2	6	260177	260182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454277

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