MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017291	AGCG	2	8	190114	190121	25 %	0 %	50 %	25 %	384453235
4002	NC_017291	GAA	2	6	190211	190216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453235
4003	NC_017291	TC	3	6	190221	190226	0 %	50 %	0 %	50 %	384453235
4004	NC_017291	CAG	2	6	190241	190246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453235
4005	NC_017291	GCCTTG	2	12	190272	190283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453235
4006	NC_017291	TTA	2	6	190309	190314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453235
4007	NC_017291	CGG	2	6	190321	190326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384453235
4008	NC_017291	TCT	2	6	190357	190362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4009	NC_017291	CAC	2	6	190395	190400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453235
4010	NC_017291	AAG	2	6	190535	190540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453235
4011	NC_017291	CTT	2	6	190592	190597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4012	NC_017291	TTAT	2	8	190676	190683	25 %	75 %	0 %	0 %	384453235
4013	NC_017291	TTC	3	9	190691	190699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4014	NC_017291	ATG	2	6	190739	190744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453235
4015	NC_017291	GAT	2	6	190798	190803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453235
4016	NC_017291	GT	3	6	190828	190833	0 %	50 %	50 %	0 %	384453235
4017	NC_017291	GGT	2	6	190883	190888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453235
4018	NC_017291	GCA	2	6	190944	190949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453235
4019	NC_017291	TTC	2	6	191014	191019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4020	NC_017291	GATAA	2	10	191021	191030	60 %	20 %	20 %	0 %	384453235
4021	NC_017291	ATTT	2	8	191033	191040	25 %	75 %	0 %	0 %	384453235
4022	NC_017291	CTAT	2	8	191108	191115	25 %	50 %	0 %	25 %	384453235
4023	NC_017291	TGA	2	6	191118	191123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453235
4024	NC_017291	TCT	2	6	191153	191158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4025	NC_017291	TAA	2	6	191212	191217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453235
4026	NC_017291	ACA	2	6	191224	191229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453235
4027	NC_017291	TTA	2	6	191255	191260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453235
4028	NC_017291	TCT	2	6	191335	191340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4029	NC_017291	CTT	3	9	191371	191379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4030	NC_017291	A	6	6	191382	191387	100 %	0 %	0 %	0 %	384453235
4031	NC_017291	ATA	2	6	191445	191450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453235
4032	NC_017291	TCA	2	6	191454	191459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453235
4033	NC_017291	ATT	2	6	191494	191499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453235
4034	NC_017291	TTAA	2	8	191516	191523	50 %	50 %	0 %	0 %	384453235
4035	NC_017291	A	6	6	191535	191540	100 %	0 %	0 %	0 %	384453235
4036	NC_017291	GAA	2	6	191547	191552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453235
4037	NC_017291	CAA	2	6	191568	191573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453235
4038	NC_017291	ATT	3	9	191593	191601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453235
4039	NC_017291	TGG	2	6	191605	191610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453235
4040	NC_017291	TCA	2	6	191634	191639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453235
4041	NC_017291	ATC	2	6	191668	191673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453235
4042	NC_017291	CTT	2	6	191693	191698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453235
4043	NC_017291	GAAA	2	8	191720	191727	75 %	0 %	25 %	0 %	384453235
4044	NC_017291	ACA	2	6	191728	191733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453235
4045	NC_017291	TTG	2	6	191748	191753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017291	AGAT	2	8	191791	191798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017291	ACG	2	6	191814	191819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017291	TTC	2	6	191846	191851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453236
4049	NC_017291	AT	3	6	191871	191876	50 %	50 %	0 %	0 %	384453236
4050	NC_017291	TCT	2	6	191901	191906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453236
4051	NC_017291	TGC	2	6	191936	191941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453236
4052	NC_017291	GTG	2	6	192082	192087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453236
4053	NC_017291	CTT	2	6	192141	192146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453236
4054	NC_017291	T	6	6	192188	192193	0 %	100 %	0 %	0 %	384453236
4055	NC_017291	GAAG	2	8	192245	192252	50 %	0 %	50 %	0 %	384453236
4056	NC_017291	AAG	2	6	192301	192306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453236
4057	NC_017291	ATC	2	6	192349	192354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453236
4058	NC_017291	GTG	2	6	192469	192474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453236
4059	NC_017291	TTA	2	6	192528	192533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453236
4060	NC_017291	GA	3	6	192580	192585	50 %	0 %	50 %	0 %	384453236
4061	NC_017291	T	6	6	192658	192663	0 %	100 %	0 %	0 %	384453236
4062	NC_017291	TTG	2	6	192768	192773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453236
4063	NC_017291	TGA	2	6	192797	192802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453236
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4065	NC_017291	ATG	2	6	192865	192870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453236
4066	NC_017291	A	6	6	192874	192879	100 %	0 %	0 %	0 %	384453236
4067	NC_017291	A	6	6	192884	192889	100 %	0 %	0 %	0 %	384453236
4068	NC_017291	AGC	2	6	192911	192916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453236
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4070	NC_017291	TAA	2	6	192989	192994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453236
4071	NC_017291	ATT	2	6	193005	193010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453236
4072	NC_017291	AGGG	2	8	193018	193025	25 %	0 %	75 %	0 %	384453236
4073	NC_017291	GGA	2	6	193110	193115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453236
4074	NC_017291	GCA	2	6	193125	193130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453236
4075	NC_017291	TTCA	2	8	193176	193183	25 %	50 %	0 %	25 %	384453236
4076	NC_017291	A	6	6	193202	193207	100 %	0 %	0 %	0 %	384453236
4077	NC_017291	CCCTT	2	10	193225	193234	0 %	40 %	0 %	60 %	384453236
4078	NC_017291	TGA	2	6	193253	193258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453236
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4082	NC_017291	GAAA	2	8	193407	193414	75 %	0 %	25 %	0 %	384453236
4083	NC_017291	CAC	2	6	193498	193503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453236
4084	NC_017291	GGA	2	6	193524	193529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453236
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4086	NC_017291	TTC	2	6	193561	193566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453236
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4089	NC_017291	CT	3	6	193716	193721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_017291	GTTT	2	8	193724	193731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017291	TTA	2	6	193794	193799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017291	GTT	2	6	193876	193881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017291	TTTTA	2	10	193926	193935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017291	TTC	2	6	193942	193947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017291	T	8	8	194009	194016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017291	TTC	2	6	194132	194137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453237
4097	NC_017291	AGTTA	2	10	194216	194225	40 %	40 %	20 %	0 %	384453237
4098	NC_017291	TTATT	2	10	194236	194245	20 %	80 %	0 %	0 %	384453237
4099	NC_017291	CTG	2	6	194302	194307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453237
4100	NC_017291	TTA	2	6	194349	194354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453237
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4103	NC_017291	ATG	2	6	194434	194439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453237
4104	NC_017291	ATTT	2	8	194440	194447	25 %	75 %	0 %	0 %	384453237
4105	NC_017291	TGA	3	9	194552	194560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453237
4106	NC_017291	ACAATC	2	12	194582	194593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384453237
4107	NC_017291	TAG	2	6	194630	194635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453237
4108	NC_017291	CAAAGG	2	12	194713	194724	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453237
4109	NC_017291	ATT	2	6	194727	194732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453237
4110	NC_017291	GA	3	6	194798	194803	50 %	0 %	50 %	0 %	384453237
4111	NC_017291	TGT	2	6	194819	194824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453237
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4113	NC_017291	GTT	2	6	194900	194905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453237
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4115	NC_017291	AC	3	6	194964	194969	50 %	0 %	0 %	50 %	384453237
4116	NC_017291	AAT	2	6	195018	195023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453237
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4118	NC_017291	TCT	2	6	195095	195100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453237
4119	NC_017291	CAT	2	6	195102	195107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453237
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4121	NC_017291	TTG	2	6	195142	195147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453237
4122	NC_017291	ACA	2	6	195193	195198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453237
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4124	NC_017291	CCCTA	2	10	195289	195298	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4253	NC_017291	TATG	2	8	200274	200281	25 %	50 %	25 %	0 %	384453241
4254	NC_017291	AGA	2	6	200348	200353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453241
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4257	NC_017291	CTG	2	6	200402	200407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453241
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4362	NC_017291	TAATG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	384453245
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4364	NC_017291	AAT	2	6	205157	205162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017291	T	7	7	205162	205168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_017291	GAT	2	6	205177	205182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4368	NC_017291	CAAA	2	8	205217	205224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4369	NC_017291	TAG	2	6	205254	205259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_017291	AGAA	2	8	205334	205341	75 %	0 %	25 %	0 %	384453246
4371	NC_017291	ACG	2	6	205369	205374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453246
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4373	NC_017291	AAG	2	6	205464	205469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453246
4374	NC_017291	TGG	2	6	205483	205488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453246
4375	NC_017291	GCT	2	6	205595	205600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453246
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