MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017291	CAA	2	6	166101	166106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453213
3503	NC_017291	ATG	2	6	166123	166128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453213
3504	NC_017291	AAC	2	6	166148	166153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453213
3505	NC_017291	TGT	2	6	166232	166237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453213
3506	NC_017291	CGAG	2	8	166241	166248	25 %	0 %	50 %	25 %	384453213
3507	NC_017291	GAA	2	6	166260	166265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453213
3508	NC_017291	GAT	2	6	166328	166333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453213
3509	NC_017291	GTG	2	6	166384	166389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453213
3510	NC_017291	GAG	2	6	166404	166409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453213
3511	NC_017291	AAATG	2	10	166439	166448	60 %	20 %	20 %	0 %	384453213
3512	NC_017291	CTT	2	6	166599	166604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453213
3513	NC_017291	AAGAGA	2	12	166639	166650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453213
3514	NC_017291	GAA	2	6	166713	166718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453213
3515	NC_017291	AAT	2	6	166740	166745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453213
3516	NC_017291	TCT	2	6	166757	166762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453213
3517	NC_017291	AGC	2	6	166852	166857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453213
3518	NC_017291	G	6	6	166937	166942	0 %	0 %	100 %	0 %	384453213
3519	NC_017291	TGA	2	6	167009	167014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453213
3520	NC_017291	AAC	2	6	167035	167040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453213
3521	NC_017291	TTGC	2	8	167042	167049	0 %	50 %	25 %	25 %	384453213
3522	NC_017291	TTC	2	6	167058	167063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453213
3523	NC_017291	AC	3	6	167278	167283	50 %	0 %	0 %	50 %	384453213
3524	NC_017291	TC	3	6	167302	167307	0 %	50 %	0 %	50 %	384453213
3525	NC_017291	GGA	2	6	167334	167339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453213
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3533	NC_017291	TGT	2	6	167829	167834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453214
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3538	NC_017291	TAC	2	6	167973	167978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453214
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3542	NC_017291	A	8	8	168083	168090	100 %	0 %	0 %	0 %	384453214
3543	NC_017291	TGA	2	6	168205	168210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453214
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3545	NC_017291	TTC	2	6	168225	168230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453214
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3549	NC_017291	GAAG	2	8	168478	168485	50 %	0 %	50 %	0 %	384453214
3550	NC_017291	AAAG	2	8	168516	168523	75 %	0 %	25 %	0 %	384453214
3551	NC_017291	A	6	6	168532	168537	100 %	0 %	0 %	0 %	384453214
3552	NC_017291	TG	3	6	168691	168696	0 %	50 %	50 %	0 %	384453214
3553	NC_017291	GAA	2	6	168730	168735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017291	GTT	2	6	168750	168755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453215
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3556	NC_017291	TGA	2	6	168822	168827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453215
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3558	NC_017291	T	7	7	168939	168945	0 %	100 %	0 %	0 %	384453215
3559	NC_017291	CTG	2	6	168946	168951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453215
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3561	NC_017291	T	9	9	169031	169039	0 %	100 %	0 %	0 %	384453215
3562	NC_017291	A	8	8	169102	169109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017291	TTA	2	6	169122	169127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017291	A	6	6	169136	169141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017291	A	6	6	169147	169152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017291	TTTTC	2	10	169263	169272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3567	NC_017291	TAA	2	6	169273	169278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_017291	AG	3	6	169732	169737	50 %	0 %	50 %	0 %	384453216
3579	NC_017291	CTGTT	2	10	169742	169751	0 %	60 %	20 %	20 %	384453216
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3608	NC_017291	GAT	2	6	171157	171162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453218
3609	NC_017291	ATA	2	6	171170	171175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453218
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3611	NC_017291	T	8	8	171328	171335	0 %	100 %	0 %	0 %	384453218
3612	NC_017291	AGA	2	6	171425	171430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453218
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3999	NC_017291	TGT	2	6	190054	190059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453235
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