MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017291	TCCT	2	8	143317	143324	0 %	50 %	0 %	50 %	384453192
3003	NC_017291	GTT	2	6	143338	143343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453192
3004	NC_017291	AGAAA	2	10	143348	143357	80 %	0 %	20 %	0 %	384453192
3005	NC_017291	ATT	2	6	143360	143365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453192
3006	NC_017291	TAC	2	6	143378	143383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453192
3007	NC_017291	TGA	2	6	143522	143527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453192
3008	NC_017291	TAC	2	6	143557	143562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453192
3009	NC_017291	CAG	2	6	143566	143571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453192
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3011	NC_017291	TA	3	6	143689	143694	50 %	50 %	0 %	0 %	384453192
3012	NC_017291	ATG	2	6	143797	143802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453192
3013	NC_017291	TAT	2	6	143816	143821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453192
3014	NC_017291	ATT	2	6	143868	143873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453192
3015	NC_017291	TAG	2	6	143905	143910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453192
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3019	NC_017291	TTG	2	6	143934	143939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453192
3020	NC_017291	TTA	2	6	144033	144038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453193
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3022	NC_017291	GAG	2	6	144099	144104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453193
3023	NC_017291	TCTA	2	8	144142	144149	25 %	50 %	0 %	25 %	384453193
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3033	NC_017291	T	6	6	144826	144831	0 %	100 %	0 %	0 %	384453193
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3041	NC_017291	TAA	2	6	144998	145003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017291	AAT	2	6	145084	145089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453194
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3051	NC_017291	TTG	2	6	145400	145405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453194
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3063	NC_017291	AAAGA	2	10	146013	146022	80 %	0 %	20 %	0 %	384453194
3064	NC_017291	AAG	2	6	146029	146034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453194
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3067	NC_017291	TTAT	2	8	146130	146137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017291	GTAA	2	8	146151	146158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_017291	T	6	6	146817	146822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017291	TCA	2	6	146867	146872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453197
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3088	NC_017291	TCT	2	6	147116	147121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017291	CTC	2	6	147159	147164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_017291	GAG	2	6	147194	147199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017291	T	6	6	147203	147208	0 %	100 %	0 %	0 %	384453198
3092	NC_017291	AT	3	6	147214	147219	50 %	50 %	0 %	0 %	384453198
3093	NC_017291	A	6	6	147239	147244	100 %	0 %	0 %	0 %	384453198
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3097	NC_017291	TTTA	2	8	147425	147432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017291	AATA	2	8	147480	147487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017291	AGT	2	6	147497	147502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_017291	T	6	6	147594	147599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017291	ATT	2	6	147608	147613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017291	T	6	6	147618	147623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017291	T	7	7	147702	147708	0 %	100 %	0 %	0 %	384453199
3105	NC_017291	ACA	2	6	147718	147723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453199
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3107	NC_017291	CTT	2	6	147757	147762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453199
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3109	NC_017291	TGA	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453199
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3112	NC_017291	CAT	3	9	147883	147891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453199
3113	NC_017291	TGA	2	6	147910	147915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017291	G	6	6	147920	147925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017291	C	6	6	147926	147931	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3116	NC_017291	CAT	2	6	147948	147953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017291	TTCCGT	2	12	148028	148039	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017291	T	6	6	148081	148086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017291	TTTTA	2	10	148192	148201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017291	T	6	6	148204	148209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017291	ATT	2	6	148265	148270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017291	TAA	2	6	148275	148280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017291	AGA	2	6	148281	148286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017291	T	6	6	148353	148358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017291	GAA	2	6	148415	148420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_017291	CAA	2	6	148565	148570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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