MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017291	TGC	2	6	118942	118947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453169
2502	NC_017291	GT	3	6	119009	119014	0 %	50 %	50 %	0 %	384453169
2503	NC_017291	GTT	2	6	119075	119080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453169
2504	NC_017291	GAG	2	6	119158	119163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_017291	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	384453170
2506	NC_017291	AGTC	2	8	119219	119226	25 %	25 %	25 %	25 %	384453170
2507	NC_017291	ATG	2	6	119230	119235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453170
2508	NC_017291	AG	4	8	119295	119302	50 %	0 %	50 %	0 %	384453170
2509	NC_017291	ATT	2	6	119368	119373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453170
2510	NC_017291	AGA	2	6	119427	119432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2511	NC_017291	ATC	2	6	119443	119448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453170
2512	NC_017291	TTA	2	6	119467	119472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453170
2513	NC_017291	ATT	2	6	119517	119522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453170
2514	NC_017291	TGG	2	6	119565	119570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453170
2515	NC_017291	AAG	2	6	119603	119608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2516	NC_017291	TAC	2	6	119706	119711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453170
2517	NC_017291	CGT	2	6	119778	119783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453170
2518	NC_017291	AGA	2	6	119802	119807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2519	NC_017291	AAG	2	6	119882	119887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2520	NC_017291	A	6	6	119936	119941	100 %	0 %	0 %	0 %	384453170
2521	NC_017291	GAA	2	6	119949	119954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2522	NC_017291	GAA	2	6	119965	119970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453170
2523	NC_017291	TTC	2	6	120005	120010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453170
2524	NC_017291	AGTT	2	8	120014	120021	25 %	50 %	25 %	0 %	384453170
2525	NC_017291	TTA	2	6	120104	120109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453170
2526	NC_017291	A	6	6	120248	120253	100 %	0 %	0 %	0 %	384453170
2527	NC_017291	AGAA	2	8	120321	120328	75 %	0 %	25 %	0 %	384453171
2528	NC_017291	CCA	2	6	120395	120400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453171
2529	NC_017291	AGAA	2	8	120401	120408	75 %	0 %	25 %	0 %	384453171
2530	NC_017291	ACT	2	6	120414	120419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453171
2531	NC_017291	CGT	2	6	120441	120446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453171
2532	NC_017291	GAT	2	6	120458	120463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453171
2533	NC_017291	AAG	2	6	120547	120552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453171
2534	NC_017291	GGT	2	6	120567	120572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453171
2535	NC_017291	TGG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453171
2536	NC_017291	TAT	2	6	120713	120718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453171
2537	NC_017291	T	8	8	120742	120749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_017291	ACT	2	6	120759	120764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_017291	TTC	2	6	120844	120849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453172
2540	NC_017291	CAG	2	6	120936	120941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453172
2541	NC_017291	TTG	2	6	120966	120971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453172
2542	NC_017291	A	6	6	121076	121081	100 %	0 %	0 %	0 %	384453172
2543	NC_017291	TAC	2	6	121228	121233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453172
2544	NC_017291	AGA	2	6	121282	121287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453172
2545	NC_017291	ACC	2	6	121298	121303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453172
2546	NC_017291	CGC	2	6	121309	121314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384453172
2547	NC_017291	CA	3	6	121321	121326	50 %	0 %	0 %	50 %	384453172
2548	NC_017291	A	7	7	121348	121354	100 %	0 %	0 %	0 %	384453172
2549	NC_017291	GAA	2	6	121538	121543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453172
2550	NC_017291	GTT	2	6	121553	121558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453172
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2552	NC_017291	AAG	2	6	121608	121613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453172
2553	NC_017291	TCT	2	6	121619	121624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453172
2554	NC_017291	TTC	2	6	121645	121650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453172
2555	NC_017291	TTA	2	6	121751	121756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453172
2556	NC_017291	TAAA	2	8	121777	121784	75 %	25 %	0 %	0 %	384453172
2557	NC_017291	AGC	2	6	121875	121880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453173
2558	NC_017291	TGT	2	6	121897	121902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453173
2559	NC_017291	T	6	6	121939	121944	0 %	100 %	0 %	0 %	384453173
2560	NC_017291	CTG	2	6	121980	121985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453173
2561	NC_017291	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	384453173
2562	NC_017291	AGC	2	6	122098	122103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453173
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2565	NC_017291	CTG	2	6	122169	122174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453173
2566	NC_017291	CTC	2	6	122181	122186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453173
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2569	NC_017291	TAA	2	6	122266	122271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453173
2570	NC_017291	AGT	2	6	122284	122289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453173
2571	NC_017291	ATC	2	6	122293	122298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453173
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2573	NC_017291	GAA	2	6	122324	122329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453173
2574	NC_017291	GAA	2	6	122336	122341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453173
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2578	NC_017291	CCT	2	6	122387	122392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453173
2579	NC_017291	AATT	2	8	122400	122407	50 %	50 %	0 %	0 %	384453173
2580	NC_017291	ATT	2	6	122534	122539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453173
2581	NC_017291	GAA	3	9	122546	122554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453173
2582	NC_017291	CTT	2	6	122592	122597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453173
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2584	NC_017291	TCT	2	6	122643	122648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_017291	AGT	2	6	122674	122679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_017291	T	6	6	122710	122715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017291	ATTT	2	8	122759	122766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017291	AAT	2	6	122771	122776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017291	ATT	2	6	122791	122796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017291	TGG	2	6	122804	122809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017291	CTTTT	2	10	122881	122890	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2592	NC_017291	AAAG	2	8	122934	122941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_017291	T	6	6	122950	122955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_017291	T	6	6	122968	122973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_017291	T	6	6	123021	123026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017291	TTTCTT	2	12	123039	123050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2597	NC_017291	TAAT	2	8	123103	123110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_017291	GCG	2	6	123129	123134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384453174
2599	NC_017291	TTC	3	9	123192	123200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453174
2600	NC_017291	AT	3	6	123214	123219	50 %	50 %	0 %	0 %	384453174
2601	NC_017291	AAC	2	6	123323	123328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453174
2602	NC_017291	AGCA	2	8	123353	123360	50 %	0 %	25 %	25 %	384453174
2603	NC_017291	TCCT	2	8	123362	123369	0 %	50 %	0 %	50 %	384453174
2604	NC_017291	AGAA	2	8	123419	123426	75 %	0 %	25 %	0 %	384453174
2605	NC_017291	GAGAT	2	10	123437	123446	40 %	20 %	40 %	0 %	384453174
2606	NC_017291	ACA	2	6	123492	123497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453174
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2608	NC_017291	TGA	2	6	123546	123551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453174
2609	NC_017291	CAA	2	6	123580	123585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453174
2610	NC_017291	AAG	2	6	123746	123751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453174
2611	NC_017291	TAC	2	6	123781	123786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453174
2612	NC_017291	AGA	3	9	123851	123859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453174
2613	NC_017291	TTG	2	6	123884	123889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453174
2614	NC_017291	TA	4	8	124060	124067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_017291	TTG	2	6	124198	124203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453175
2616	NC_017291	AGC	2	6	124204	124209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453175
2617	NC_017291	AGC	2	6	124282	124287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453175
2618	NC_017291	GAG	2	6	124399	124404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453175
2619	NC_017291	GCT	3	9	124416	124424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453175
2620	NC_017291	AG	3	6	124468	124473	50 %	0 %	50 %	0 %	384453175
2621	NC_017291	TGT	2	6	124475	124480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453175
2622	NC_017291	TGCATT	2	12	124580	124591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453175
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2999	NC_017291	T	6	6	143139	143144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_017291	ATG	2	6	143226	143231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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