MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017291	CAG	2	6	70617	70622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453113
1502	NC_017291	AGT	2	6	70646	70651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453113
1503	NC_017291	ATA	2	6	70708	70713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453113
1504	NC_017291	AGG	2	6	70831	70836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453113
1505	NC_017291	GAA	3	9	70878	70886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453113
1506	NC_017291	T	7	7	70910	70916	0 %	100 %	0 %	0 %	384453113
1507	NC_017291	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384453113
1508	NC_017291	TTC	2	6	71021	71026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453113
1509	NC_017291	T	7	7	71076	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017291	A	7	7	71126	71132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017291	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_017291	ATA	2	6	71242	71247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017291	AAT	2	6	71295	71300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453114
1514	NC_017291	ACA	2	6	71315	71320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453114
1515	NC_017291	TCG	2	6	71343	71348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453114
1516	NC_017291	TGT	2	6	71418	71423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453114
1517	NC_017291	TAT	2	6	71455	71460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453114
1518	NC_017291	TGT	2	6	71523	71528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453114
1519	NC_017291	TCA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453114
1520	NC_017291	A	6	6	71686	71691	100 %	0 %	0 %	0 %	384453114
1521	NC_017291	T	6	6	71720	71725	0 %	100 %	0 %	0 %	384453114
1522	NC_017291	A	6	6	71744	71749	100 %	0 %	0 %	0 %	384453114
1523	NC_017291	GA	3	6	71762	71767	50 %	0 %	50 %	0 %	384453114
1524	NC_017291	ATC	2	6	71839	71844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453114
1525	NC_017291	AAG	2	6	71876	71881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453114
1526	NC_017291	TGT	2	6	71891	71896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453114
1527	NC_017291	AAC	2	6	71910	71915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453114
1528	NC_017291	GT	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	384453114
1529	NC_017291	GAA	2	6	72061	72066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453114
1530	NC_017291	AGA	2	6	72081	72086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453114
1531	NC_017291	GAA	2	6	72096	72101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453114
1532	NC_017291	T	6	6	72127	72132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017291	ATGT	2	8	72159	72166	25 %	50 %	25 %	0 %	384453115
1534	NC_017291	TGTT	2	8	72178	72185	0 %	75 %	25 %	0 %	384453115
1535	NC_017291	T	6	6	72210	72215	0 %	100 %	0 %	0 %	384453115
1536	NC_017291	AGA	2	6	72237	72242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453115
1537	NC_017291	T	7	7	72275	72281	0 %	100 %	0 %	0 %	384453115
1538	NC_017291	TGC	2	6	72306	72311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453115
1539	NC_017291	CAG	2	6	72343	72348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453115
1540	NC_017291	CAA	2	6	72405	72410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453115
1541	NC_017291	ATG	2	6	72425	72430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453115
1542	NC_017291	ACA	2	6	72455	72460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453115
1543	NC_017291	TCA	2	6	72569	72574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453115
1544	NC_017291	CCT	2	6	72635	72640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453115
1545	NC_017291	ATA	3	9	72655	72663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453115
1546	NC_017291	CAG	2	6	72672	72677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453115
1547	NC_017291	GAT	2	6	72741	72746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453115
1548	NC_017291	T	7	7	72841	72847	0 %	100 %	0 %	0 %	384453115
1549	NC_017291	ATAA	2	8	72891	72898	75 %	25 %	0 %	0 %	384453115
1550	NC_017291	AGC	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453115
1551	NC_017291	TAGGGC	2	12	72925	72936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384453115
1552	NC_017291	CCTGAT	2	12	72950	72961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453115
1553	NC_017291	T	8	8	73035	73042	0 %	100 %	0 %	0 %	384453115
1554	NC_017291	T	7	7	73072	73078	0 %	100 %	0 %	0 %	384453115
1555	NC_017291	TCAT	2	8	73103	73110	25 %	50 %	0 %	25 %	384453115
1556	NC_017291	GTA	2	6	73202	73207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453116
1557	NC_017291	GCA	2	6	73208	73213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453116
1558	NC_017291	CTGC	2	8	73365	73372	0 %	25 %	25 %	50 %	384453116
1559	NC_017291	ACG	2	6	73407	73412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453116
1560	NC_017291	TGT	2	6	73511	73516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453116
1561	NC_017291	GTAA	2	8	73548	73555	50 %	25 %	25 %	0 %	384453116
1562	NC_017291	AAT	2	6	73661	73666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453116
1563	NC_017291	T	6	6	73671	73676	0 %	100 %	0 %	0 %	384453116
1564	NC_017291	TAG	2	6	73684	73689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453116
1565	NC_017291	GT	3	6	73700	73705	0 %	50 %	50 %	0 %	384453116
1566	NC_017291	TTG	2	6	73724	73729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453116
1567	NC_017291	TAA	2	6	73886	73891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453116
1568	NC_017291	AAT	2	6	73940	73945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453116
1569	NC_017291	CAA	2	6	73987	73992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453116
1570	NC_017291	TTA	3	9	74094	74102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_017291	A	6	6	74304	74309	100 %	0 %	0 %	0 %	384453117
1573	NC_017291	TTAT	2	8	74338	74345	25 %	75 %	0 %	0 %	384453117
1574	NC_017291	ATT	2	6	74374	74379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453117
1575	NC_017291	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384453117
1576	NC_017291	T	6	6	74473	74478	0 %	100 %	0 %	0 %	384453117
1577	NC_017291	GGA	2	6	74563	74568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453117
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1579	NC_017291	TTTA	2	8	74696	74703	25 %	75 %	0 %	0 %	384453117
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1585	NC_017291	G	6	6	75243	75248	0 %	0 %	100 %	0 %	384453118
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1592	NC_017291	CTTA	2	8	75599	75606	25 %	50 %	0 %	25 %	384453118
1593	NC_017291	ATT	2	6	75610	75615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453118
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1596	NC_017291	CTG	2	6	75863	75868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453118
1597	NC_017291	CAA	2	6	75908	75913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453118
1598	NC_017291	ATT	2	6	75982	75987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453118
1599	NC_017291	CAG	2	6	76022	76027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453118
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1601	NC_017291	ATC	2	6	76091	76096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017291	AGA	2	6	76150	76155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453119
1603	NC_017291	A	7	7	76155	76161	100 %	0 %	0 %	0 %	384453119
1604	NC_017291	TGA	2	6	76213	76218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453119
1605	NC_017291	AATT	2	8	76246	76253	50 %	50 %	0 %	0 %	384453119
1606	NC_017291	GC	3	6	76267	76272	0 %	0 %	50 %	50 %	384453119
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1611	NC_017291	TC	3	6	76437	76442	0 %	50 %	0 %	50 %	384453119
1612	NC_017291	GTT	2	6	76453	76458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453119
1613	NC_017291	TCCA	2	8	76476	76483	25 %	25 %	0 %	50 %	384453119
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1618	NC_017291	CA	3	6	76572	76577	50 %	0 %	0 %	50 %	384453119
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1622	NC_017291	CT	3	6	76760	76765	0 %	50 %	0 %	50 %	384453119
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