MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017291	AAG	2	6	23077	23082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453071
502	NC_017291	AAC	2	6	23108	23113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453071
503	NC_017291	GGT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453071
504	NC_017291	AGC	2	6	23176	23181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453071
505	NC_017291	ATG	2	6	23266	23271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453071
506	NC_017291	AGC	2	6	23283	23288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453071
507	NC_017291	GCT	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453071
508	NC_017291	CTG	2	6	23380	23385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453071
509	NC_017291	ATG	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453071
510	NC_017291	TTA	2	6	23599	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453071
511	NC_017291	AAG	2	6	23656	23661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453071
512	NC_017291	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	384453071
513	NC_017291	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017291	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017291	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017291	TTG	2	6	24012	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
517	NC_017291	TGT	2	6	24049	24054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
518	NC_017291	AGT	2	6	24066	24071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453072
519	NC_017291	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
520	NC_017291	TCC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453072
521	NC_017291	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384453072
522	NC_017291	TTG	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
523	NC_017291	GAA	2	6	24364	24369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453072
524	NC_017291	T	6	6	24381	24386	0 %	100 %	0 %	0 %	384453072
525	NC_017291	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384453072
526	NC_017291	CTT	2	6	24518	24523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453072
527	NC_017291	AGG	2	6	24539	24544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453072
528	NC_017291	GTA	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453072
529	NC_017291	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453072
530	NC_017291	TTA	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
531	NC_017291	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384453072
532	NC_017291	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384453072
533	NC_017291	T	8	8	24798	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	384453072
534	NC_017291	TGT	2	6	24820	24825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
535	NC_017291	GCT	2	6	24850	24855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453072
536	NC_017291	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384453072
537	NC_017291	ATC	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453072
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539	NC_017291	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384453072
540	NC_017291	TTG	2	6	25010	25015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
541	NC_017291	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
542	NC_017291	ATT	2	6	25113	25118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
543	NC_017291	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453072
544	NC_017291	TTG	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
545	NC_017291	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384453072
546	NC_017291	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453072
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548	NC_017291	GCA	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453072
549	NC_017291	GTT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453072
550	NC_017291	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	384453072
551	NC_017291	TAA	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453072
552	NC_017291	CTT	3	9	25649	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453072
553	NC_017291	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
554	NC_017291	TTA	2	6	25753	25758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
555	NC_017291	TAT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
556	NC_017291	TCA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453072
557	NC_017291	CCA	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453072
558	NC_017291	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453072
559	NC_017291	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	384453072
560	NC_017291	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384453072
561	NC_017291	TTC	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453072
562	NC_017291	TCT	2	6	25918	25923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453072
563	NC_017291	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	384453072
564	NC_017291	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384453072
565	NC_017291	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453072
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572	NC_017291	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	384453072
573	NC_017291	AGA	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453072
574	NC_017291	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017291	T	7	7	26579	26585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017291	TTC	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017291	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017291	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017291	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453073
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583	NC_017291	CAA	2	6	26902	26907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453073
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591	NC_017291	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	384453073
592	NC_017291	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384453073
593	NC_017291	AAG	2	6	27275	27280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453073
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598	NC_017291	TC	3	6	27459	27464	0 %	50 %	0 %	50 %	384453073
599	NC_017291	AGA	3	9	27564	27572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453073
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601	NC_017291	GCT	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453073
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609	NC_017291	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	384453073
610	NC_017291	TTG	2	6	28076	28081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453073
611	NC_017291	CTA	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453073
612	NC_017291	ACA	2	6	28105	28110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453073
613	NC_017291	AAG	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453073
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618	NC_017291	T	6	6	28617	28622	0 %	100 %	0 %	0 %	384453073
619	NC_017291	TGC	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453073
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