MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 24846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017291	CTC	2	6	210889	210894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453252
4502	NC_017291	CTAA	2	8	210913	210920	50 %	25 %	0 %	25 %	384453252
4503	NC_017291	GTC	2	6	211077	211082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017291	T	6	6	211166	211171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017291	AAT	2	6	211263	211268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453253
4506	NC_017291	AAGC	2	8	211278	211285	50 %	0 %	25 %	25 %	384453253
4507	NC_017291	ATT	2	6	211323	211328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453253
4508	NC_017291	AAG	2	6	211349	211354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453253
4509	NC_017291	GTT	2	6	211371	211376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453253
4510	NC_017291	GTA	2	6	211429	211434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453253
4511	NC_017291	GA	3	6	211463	211468	50 %	0 %	50 %	0 %	384453253
4512	NC_017291	GTAG	2	8	211750	211757	25 %	25 %	50 %	0 %	384453254
4513	NC_017291	TGA	2	6	211764	211769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453254
4514	NC_017291	TTG	2	6	211796	211801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453254
4515	NC_017291	AT	3	6	211824	211829	50 %	50 %	0 %	0 %	384453254
4516	NC_017291	TTC	2	6	211835	211840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453254
4517	NC_017291	GTTT	2	8	211875	211882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017291	T	6	6	211894	211899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017291	GGT	2	6	212076	212081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453255
4520	NC_017291	GAA	2	6	212201	212206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453255
4521	NC_017291	GTT	2	6	212307	212312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453255
4522	NC_017291	AGG	2	6	212327	212332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453255
4523	NC_017291	ATT	2	6	212483	212488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453255
4524	NC_017291	ATT	2	6	212687	212692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453255
4525	NC_017291	GTT	2	6	212693	212698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453255
4526	NC_017291	TCC	2	6	212727	212732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453255
4527	NC_017291	AGA	3	9	212735	212743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453255
4528	NC_017291	TGA	2	6	212825	212830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453255
4529	NC_017291	TTG	2	6	212995	213000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453256
4530	NC_017291	ATC	2	6	213075	213080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453256
4531	NC_017291	TGC	2	6	213191	213196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453256
4532	NC_017291	GAAG	2	8	213208	213215	50 %	0 %	50 %	0 %	384453256
4533	NC_017291	CAT	2	6	213245	213250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453256
4534	NC_017291	AT	3	6	213249	213254	50 %	50 %	0 %	0 %	384453256
4535	NC_017291	AAAG	2	8	213270	213277	75 %	0 %	25 %	0 %	384453256
4536	NC_017291	TAC	2	6	213296	213301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453256
4537	NC_017291	GGT	2	6	213350	213355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453256
4538	NC_017291	ATA	2	6	213426	213431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453256
4539	NC_017291	TCT	2	6	213474	213479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453256
4540	NC_017291	CATA	2	8	213547	213554	50 %	25 %	0 %	25 %	384453256
4541	NC_017291	CCT	2	6	213606	213611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453256
4542	NC_017291	ATGT	2	8	213663	213670	25 %	50 %	25 %	0 %	384453256
4543	NC_017291	ACA	2	6	213675	213680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453256
4544	NC_017291	GCC	2	6	213705	213710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384453256
4545	NC_017291	AAG	2	6	213715	213720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453256
4546	NC_017291	A	7	7	213749	213755	100 %	0 %	0 %	0 %	384453256
4547	NC_017291	T	7	7	213773	213779	0 %	100 %	0 %	0 %	384453257
4548	NC_017291	TTG	2	6	213810	213815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453257
4549	NC_017291	GTT	2	6	213830	213835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453257
4550	NC_017291	ATG	2	6	213880	213885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453257
4551	NC_017291	GTT	2	6	213951	213956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453257
4552	NC_017291	AGAT	2	8	214057	214064	50 %	25 %	25 %	0 %	384453257
4553	NC_017291	AGAA	2	8	214180	214187	75 %	0 %	25 %	0 %	384453257
4554	NC_017291	GAAAA	2	10	214209	214218	80 %	0 %	20 %	0 %	384453257
4555	NC_017291	TGC	2	6	214232	214237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453257
4556	NC_017291	T	7	7	214264	214270	0 %	100 %	0 %	0 %	384453257
4557	NC_017291	GTA	2	6	214301	214306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453257
4558	NC_017291	AAC	2	6	214322	214327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453257
4559	NC_017291	GTT	2	6	214340	214345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453257
4560	NC_017291	C	6	6	214348	214353	0 %	0 %	0 %	100 %	384453257
4561	NC_017291	CAA	2	6	214374	214379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453257
4562	NC_017291	GTT	2	6	214492	214497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453258
4563	NC_017291	ATT	2	6	214512	214517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453258
4564	NC_017291	TTC	2	6	214527	214532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453258
4565	NC_017291	TAGCA	2	10	214575	214584	40 %	20 %	20 %	20 %	384453258
4566	NC_017291	AGC	2	6	214650	214655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453258
4567	NC_017291	ACA	2	6	214660	214665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453258
4568	NC_017291	ACG	2	6	214702	214707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453258
4569	NC_017291	GCT	2	6	214772	214777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453258
4570	NC_017291	AGC	2	6	214779	214784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453258
4571	NC_017291	AG	3	6	214886	214891	50 %	0 %	50 %	0 %	384453258
4572	NC_017291	T	6	6	215005	215010	0 %	100 %	0 %	0 %	384453258
4573	NC_017291	T	7	7	215038	215044	0 %	100 %	0 %	0 %	384453258
4574	NC_017291	T	6	6	215099	215104	0 %	100 %	0 %	0 %	384453258
4575	NC_017291	TTC	2	6	215238	215243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453258
4576	NC_017291	AAGAA	2	10	215273	215282	80 %	0 %	20 %	0 %	384453258
4577	NC_017291	AAG	2	6	215289	215294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453258
4578	NC_017291	TGA	2	6	215326	215331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017291	TAA	2	6	215363	215368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017291	T	6	6	215396	215401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017291	AT	3	6	215441	215446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017291	GA	3	6	215501	215506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017291	GT	3	6	215541	215546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017291	CT	3	6	215578	215583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_017291	T	6	6	215606	215611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017291	T	6	6	215669	215674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017291	T	6	6	215715	215720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017291	A	6	6	215766	215771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017291	AG	3	6	215805	215810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017291	TC	3	6	215864	215869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_017291	GAA	2	6	215907	215912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453259
4592	NC_017291	TCA	2	6	215932	215937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453259
4593	NC_017291	AG	3	6	216042	216047	50 %	0 %	50 %	0 %	384453259
4594	NC_017291	GT	3	6	216126	216131	0 %	50 %	50 %	0 %	384453259
4595	NC_017291	GACA	2	8	216163	216170	50 %	0 %	25 %	25 %	384453259
4596	NC_017291	AG	3	6	216192	216197	50 %	0 %	50 %	0 %	384453259
4597	NC_017291	CTC	2	6	216249	216254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453259
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4599	NC_017291	TTG	2	6	216385	216390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453259
4600	NC_017291	GGT	2	6	216396	216401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453259
4601	NC_017291	AGC	2	6	216452	216457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453259
4602	NC_017291	TTG	2	6	216517	216522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453259
4603	NC_017291	AAG	2	6	216552	216557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453260
4604	NC_017291	GAAAG	2	10	216573	216582	60 %	0 %	40 %	0 %	384453260
4605	NC_017291	TAT	2	6	216661	216666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453260
4606	NC_017291	AGA	2	6	216688	216693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453260
4607	NC_017291	ATTT	2	8	216744	216751	25 %	75 %	0 %	0 %	384453260
4608	NC_017291	TCA	2	6	216856	216861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453260
4609	NC_017291	GTG	2	6	216939	216944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453260
4610	NC_017291	ACTC	2	8	216953	216960	25 %	25 %	0 %	50 %	384453260
4611	NC_017291	TTA	2	6	217047	217052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453260
4612	NC_017291	TGT	2	6	217105	217110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453260
4613	NC_017291	TG	3	6	217209	217214	0 %	50 %	50 %	0 %	384453260
4614	NC_017291	TAG	2	6	217294	217299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453260
4615	NC_017291	TAC	2	6	217310	217315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453260
4616	NC_017291	AT	3	6	217545	217550	50 %	50 %	0 %	0 %	384453261
4617	NC_017291	AGAA	2	8	217850	217857	75 %	0 %	25 %	0 %	384453261
4618	NC_017291	TTG	2	6	217862	217867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453261
4619	NC_017291	CAAC	2	8	217917	217924	50 %	0 %	0 %	50 %	384453261
4620	NC_017291	TTC	2	6	218256	218261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453261
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4624	NC_017291	GA	3	6	218379	218384	50 %	0 %	50 %	0 %	384453261
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4626	NC_017291	GCG	2	6	218445	218450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384453261
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