MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017290	AGCG	2	8	190116	190123	25 %	0 %	50 %	25 %	384452261
4002	NC_017290	GAA	2	6	190213	190218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452261
4003	NC_017290	TC	3	6	190223	190228	0 %	50 %	0 %	50 %	384452261
4004	NC_017290	CAG	2	6	190243	190248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452261
4005	NC_017290	GCCTTG	2	12	190274	190285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452261
4006	NC_017290	TTA	2	6	190311	190316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452261
4007	NC_017290	CGG	2	6	190323	190328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384452261
4008	NC_017290	TCT	2	6	190359	190364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4009	NC_017290	CAC	2	6	190397	190402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452261
4010	NC_017290	AAG	2	6	190537	190542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452261
4011	NC_017290	CTT	2	6	190594	190599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4012	NC_017290	TTAT	2	8	190678	190685	25 %	75 %	0 %	0 %	384452261
4013	NC_017290	TTC	3	9	190693	190701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4014	NC_017290	ATG	2	6	190741	190746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452261
4015	NC_017290	GAT	2	6	190800	190805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452261
4016	NC_017290	GT	3	6	190830	190835	0 %	50 %	50 %	0 %	384452261
4017	NC_017290	GGT	2	6	190885	190890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452261
4018	NC_017290	GCA	2	6	190946	190951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452261
4019	NC_017290	TTC	2	6	191016	191021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4020	NC_017290	GATAA	2	10	191023	191032	60 %	20 %	20 %	0 %	384452261
4021	NC_017290	ATTT	2	8	191035	191042	25 %	75 %	0 %	0 %	384452261
4022	NC_017290	CTAT	2	8	191110	191117	25 %	50 %	0 %	25 %	384452261
4023	NC_017290	TGA	2	6	191120	191125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452261
4024	NC_017290	TCT	2	6	191155	191160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4025	NC_017290	TAA	2	6	191214	191219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452261
4026	NC_017290	ACA	2	6	191226	191231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452261
4027	NC_017290	TTA	2	6	191257	191262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452261
4028	NC_017290	TCT	2	6	191337	191342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4029	NC_017290	CTT	3	9	191373	191381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452261
4030	NC_017290	A	6	6	191384	191389	100 %	0 %	0 %	0 %	384452261
4031	NC_017290	ATA	2	6	191447	191452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452261
4032	NC_017290	TCA	2	6	191456	191461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452261
4033	NC_017290	ATT	2	6	191496	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452261
4034	NC_017290	TTAA	2	8	191518	191525	50 %	50 %	0 %	0 %	384452261
4035	NC_017290	A	6	6	191537	191542	100 %	0 %	0 %	0 %	384452261
4036	NC_017290	GAA	2	6	191549	191554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452261
4037	NC_017290	CAA	2	6	191570	191575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452261
4038	NC_017290	ATT	3	9	191595	191603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452261
4039	NC_017290	TGG	2	6	191607	191612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452261
4040	NC_017290	TCA	2	6	191636	191641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452261
4041	NC_017290	ATC	2	6	191670	191675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452261
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4043	NC_017290	GAAA	2	8	191722	191729	75 %	0 %	25 %	0 %	384452261
4044	NC_017290	ACA	2	6	191730	191735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452261
4045	NC_017290	TTG	2	6	191750	191755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017290	AGAT	2	8	191793	191800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017290	ACG	2	6	191816	191821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017290	TTC	2	6	191848	191853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452262
4049	NC_017290	AT	3	6	191873	191878	50 %	50 %	0 %	0 %	384452262
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4053	NC_017290	CTT	2	6	192143	192148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452262
4054	NC_017290	T	6	6	192190	192195	0 %	100 %	0 %	0 %	384452262
4055	NC_017290	GAAG	2	8	192247	192254	50 %	0 %	50 %	0 %	384452262
4056	NC_017290	AAG	2	6	192303	192308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452262
4057	NC_017290	ATC	2	6	192351	192356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452262
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4059	NC_017290	TTA	2	6	192530	192535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452262
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4061	NC_017290	T	6	6	192660	192665	0 %	100 %	0 %	0 %	384452262
4062	NC_017290	TTG	2	6	192770	192775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452262
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4067	NC_017290	A	6	6	192886	192891	100 %	0 %	0 %	0 %	384452262
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4070	NC_017290	TAA	2	6	192991	192996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452262
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4073	NC_017290	GGA	2	6	193112	193117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452262
4074	NC_017290	GCA	2	6	193127	193132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452262
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4078	NC_017290	TGA	2	6	193255	193260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452262
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4089	NC_017290	CT	3	6	193718	193723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_017290	GTTT	2	8	193726	193733	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017290	TTA	2	6	193796	193801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017290	GTT	2	6	193878	193883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017290	TTTTA	2	10	193928	193937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017290	TTC	2	6	193944	193949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017290	T	8	8	194011	194018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4103	NC_017290	ATG	2	6	194436	194441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452263
4104	NC_017290	ATTT	2	8	194442	194449	25 %	75 %	0 %	0 %	384452263
4105	NC_017290	TGA	3	9	194554	194562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452263
4106	NC_017290	ACAATC	2	12	194584	194595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384452263
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4109	NC_017290	ATT	2	6	194729	194734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452263
4110	NC_017290	GA	3	6	194800	194805	50 %	0 %	50 %	0 %	384452263
4111	NC_017290	TGT	2	6	194821	194826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452263
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4113	NC_017290	GTT	2	6	194902	194907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452263
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4115	NC_017290	AC	3	6	194966	194971	50 %	0 %	0 %	50 %	384452263
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4119	NC_017290	CAT	2	6	195104	195109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452263
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4122	NC_017290	ACA	2	6	195195	195200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452263
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4253	NC_017290	TATG	2	8	200276	200283	25 %	50 %	25 %	0 %	384452267
4254	NC_017290	AGA	2	6	200350	200355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452267
4255	NC_017290	CAA	2	6	200373	200378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452267
4256	NC_017290	GCT	2	6	200387	200392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452267
4257	NC_017290	CTG	2	6	200404	200409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452267
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4273	NC_017290	CCT	2	6	201046	201051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4275	NC_017290	TAAT	2	8	201083	201090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4281	NC_017290	GT	3	6	201472	201477	0 %	50 %	50 %	0 %	384452268
4282	NC_017290	CAA	2	6	201530	201535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452268
4283	NC_017290	GAT	2	6	201550	201555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452268
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4291	NC_017290	TCT	2	6	201897	201902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452269
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4364	NC_017290	AAT	2	6	205159	205164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017290	T	7	7	205164	205170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_017290	GAT	2	6	205179	205184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4368	NC_017290	CAAA	2	8	205219	205226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4369	NC_017290	TAG	2	6	205256	205261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_017290	AGAA	2	8	205336	205343	75 %	0 %	25 %	0 %	384452272
4371	NC_017290	ACG	2	6	205371	205376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452272
4372	NC_017290	AAAGAC	2	12	205395	205406	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384452272
4373	NC_017290	AAG	2	6	205466	205471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452272
4374	NC_017290	TGG	2	6	205485	205490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452272
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