MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017290	TCCT	2	8	143318	143325	0 %	50 %	0 %	50 %	384452218
3002	NC_017290	GTT	2	6	143339	143344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452218
3003	NC_017290	AGAAA	2	10	143349	143358	80 %	0 %	20 %	0 %	384452218
3004	NC_017290	ATT	2	6	143361	143366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452218
3005	NC_017290	TAC	2	6	143379	143384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452218
3006	NC_017290	TGA	2	6	143523	143528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452218
3007	NC_017290	TAC	2	6	143558	143563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452218
3008	NC_017290	CAG	2	6	143567	143572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452218
3009	NC_017290	TTG	3	9	143627	143635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452218
3010	NC_017290	TA	3	6	143690	143695	50 %	50 %	0 %	0 %	384452218
3011	NC_017290	ATG	2	6	143798	143803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452218
3012	NC_017290	TAT	2	6	143817	143822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452218
3013	NC_017290	ATT	2	6	143869	143874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452218
3014	NC_017290	TAG	2	6	143906	143911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452218
3015	NC_017290	TTC	2	6	143912	143917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452218
3016	NC_017290	GTG	2	6	143918	143923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452218
3017	NC_017290	AGA	2	6	143924	143929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452218
3018	NC_017290	TTG	2	6	143935	143940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452218
3019	NC_017290	TTA	2	6	144034	144039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452219
3020	NC_017290	AAT	2	6	144071	144076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452219
3021	NC_017290	GAG	2	6	144100	144105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452219
3022	NC_017290	TCTA	2	8	144143	144150	25 %	50 %	0 %	25 %	384452219
3023	NC_017290	T	6	6	144236	144241	0 %	100 %	0 %	0 %	384452219
3024	NC_017290	TTG	2	6	144271	144276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452219
3025	NC_017290	ATA	2	6	144436	144441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452219
3026	NC_017290	CAG	2	6	144444	144449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452219
3027	NC_017290	TAG	2	6	144454	144459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452219
3028	NC_017290	ATCA	2	8	144494	144501	50 %	25 %	0 %	25 %	384452219
3029	NC_017290	CAA	2	6	144634	144639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452219
3030	NC_017290	TGT	2	6	144666	144671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452219
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3032	NC_017290	T	6	6	144827	144832	0 %	100 %	0 %	0 %	384452219
3033	NC_017290	AAT	2	6	144846	144851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452219
3034	NC_017290	TGAA	2	8	144858	144865	50 %	25 %	25 %	0 %	384452219
3035	NC_017290	GGAA	3	12	144866	144877	50 %	0 %	50 %	0 %	384452219
3036	NC_017290	TCC	2	6	144878	144883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452219
3037	NC_017290	AGTA	2	8	144899	144906	50 %	25 %	25 %	0 %	384452219
3038	NC_017290	A	7	7	144915	144921	100 %	0 %	0 %	0 %	384452219
3039	NC_017290	TAT	2	6	144992	144997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017290	TAA	2	6	144999	145004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017290	AAT	2	6	145085	145090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452220
3042	NC_017290	A	7	7	145118	145124	100 %	0 %	0 %	0 %	384452220
3043	NC_017290	TAT	2	6	145182	145187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452220
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3045	NC_017290	T	7	7	145270	145276	0 %	100 %	0 %	0 %	384452220
3046	NC_017290	TGTC	2	8	145288	145295	0 %	50 %	25 %	25 %	384452220
3047	NC_017290	TTG	2	6	145296	145301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452220
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3049	NC_017290	TTTA	2	8	145378	145385	25 %	75 %	0 %	0 %	384452220
3050	NC_017290	TTG	2	6	145401	145406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452220
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3052	NC_017290	TTC	2	6	145497	145502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452220
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3054	NC_017290	ACT	2	6	145551	145556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452220
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3056	NC_017290	CT	4	8	145668	145675	0 %	50 %	0 %	50 %	384452220
3057	NC_017290	TCC	2	6	145729	145734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452220
3058	NC_017290	T	6	6	145766	145771	0 %	100 %	0 %	0 %	384452220
3059	NC_017290	AGA	2	6	145792	145797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452220
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3061	NC_017290	TA	3	6	145999	146004	50 %	50 %	0 %	0 %	384452220
3062	NC_017290	AAAGA	2	10	146014	146023	80 %	0 %	20 %	0 %	384452220
3063	NC_017290	AAG	2	6	146030	146035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452220
3064	NC_017290	ATA	2	6	146070	146075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452220
3065	NC_017290	TTAT	2	8	146096	146103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017290	TTAT	2	8	146131	146138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017290	GTAA	2	8	146152	146159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_017290	TATT	2	8	146336	146343	25 %	75 %	0 %	0 %	384452221
3070	NC_017290	CTTT	2	8	146389	146396	0 %	75 %	0 %	25 %	384452221
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3079	NC_017290	TCT	2	6	146783	146788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017290	AAG	2	6	146808	146813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017290	T	6	6	146818	146823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017290	TCA	2	6	146868	146873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452223
3083	NC_017290	ATAGGC	2	12	146934	146945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384452223
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3088	NC_017290	CTC	2	6	147160	147165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_017290	GAG	2	6	147195	147200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017290	T	6	6	147204	147209	0 %	100 %	0 %	0 %	384452224
3091	NC_017290	AT	3	6	147215	147220	50 %	50 %	0 %	0 %	384452224
3092	NC_017290	A	6	6	147240	147245	100 %	0 %	0 %	0 %	384452224
3093	NC_017290	TTG	2	6	147261	147266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452224
3094	NC_017290	TGA	2	6	147302	147307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452224
3095	NC_017290	TAC	2	6	147384	147389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452224
3096	NC_017290	TTTA	2	8	147426	147433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017290	AATA	2	8	147481	147488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017290	AGT	2	6	147498	147503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017290	ATTT	3	12	147539	147550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017290	T	6	6	147595	147600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017290	ATT	2	6	147609	147614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017290	T	6	6	147619	147624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017290	T	7	7	147703	147709	0 %	100 %	0 %	0 %	384452225
3104	NC_017290	ACA	2	6	147719	147724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452225
3105	NC_017290	A	6	6	147740	147745	100 %	0 %	0 %	0 %	384452225
3106	NC_017290	CTT	2	6	147758	147763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452225
3107	NC_017290	CTT	2	6	147768	147773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452225
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3109	NC_017290	AAGTAA	2	12	147816	147827	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384452225
3110	NC_017290	AAG	2	6	147861	147866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452225
3111	NC_017290	CAT	3	9	147884	147892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452225
3112	NC_017290	TGA	2	6	147911	147916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017290	G	6	6	147921	147926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017290	C	6	6	147927	147932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3115	NC_017290	CAT	2	6	147949	147954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017290	TTCCGT	2	12	148029	148040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017290	T	6	6	148082	148087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017290	TTTTA	2	10	148193	148202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017290	T	6	6	148205	148210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017290	ATT	2	6	148266	148271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017290	TAA	2	6	148276	148281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017290	AGA	2	6	148282	148287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017290	T	6	6	148354	148359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017290	GAA	2	6	148416	148421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017290	CAC	2	6	148475	148480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3127	NC_017290	TAAG	2	8	148606	148613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3369	NC_017290	GGT	2	6	160373	160378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3370	NC_017290	TTTC	2	8	160512	160519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3371	NC_017290	AAG	2	6	160674	160679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452234
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3373	NC_017290	CTC	2	6	160808	160813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452234
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3375	NC_017290	GA	3	6	160848	160853	50 %	0 %	50 %	0 %	384452234
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