MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017290	GT	3	6	119009	119014	0 %	50 %	50 %	0 %	384452195
2502	NC_017290	GTT	2	6	119075	119080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452195
2503	NC_017290	GAG	2	6	119158	119163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017290	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	384452196
2505	NC_017290	AGTC	2	8	119219	119226	25 %	25 %	25 %	25 %	384452196
2506	NC_017290	ATG	2	6	119230	119235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452196
2507	NC_017290	AG	4	8	119295	119302	50 %	0 %	50 %	0 %	384452196
2508	NC_017290	ATT	2	6	119368	119373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452196
2509	NC_017290	AGA	2	6	119427	119432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452196
2510	NC_017290	ATC	2	6	119443	119448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452196
2511	NC_017290	TTA	2	6	119467	119472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452196
2512	NC_017290	ATT	2	6	119517	119522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452196
2513	NC_017290	TGG	2	6	119565	119570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452196
2514	NC_017290	AAG	2	6	119603	119608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452196
2515	NC_017290	TAC	2	6	119706	119711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452196
2516	NC_017290	CGT	2	6	119778	119783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452196
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2518	NC_017290	AAG	2	6	119882	119887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452196
2519	NC_017290	A	6	6	119936	119941	100 %	0 %	0 %	0 %	384452196
2520	NC_017290	GAA	2	6	119949	119954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452196
2521	NC_017290	GAA	2	6	119965	119970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452196
2522	NC_017290	TTC	2	6	120005	120010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452196
2523	NC_017290	AGTT	2	8	120014	120021	25 %	50 %	25 %	0 %	384452196
2524	NC_017290	TTA	2	6	120104	120109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452196
2525	NC_017290	A	6	6	120248	120253	100 %	0 %	0 %	0 %	384452196
2526	NC_017290	AGAA	2	8	120321	120328	75 %	0 %	25 %	0 %	384452197
2527	NC_017290	CCA	2	6	120395	120400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452197
2528	NC_017290	AGAA	2	8	120401	120408	75 %	0 %	25 %	0 %	384452197
2529	NC_017290	ACT	2	6	120414	120419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452197
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2532	NC_017290	AAG	2	6	120547	120552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452197
2533	NC_017290	GGT	2	6	120567	120572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452197
2534	NC_017290	TGG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452197
2535	NC_017290	TAT	2	6	120713	120718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452197
2536	NC_017290	T	8	8	120742	120749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_017290	ACT	2	6	120759	120764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_017290	TTC	2	6	120844	120849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452198
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2540	NC_017290	TTG	2	6	120966	120971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452198
2541	NC_017290	A	6	6	121076	121081	100 %	0 %	0 %	0 %	384452198
2542	NC_017290	TAC	2	6	121228	121233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452198
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2544	NC_017290	ACC	2	6	121298	121303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452198
2545	NC_017290	CGC	2	6	121309	121314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384452198
2546	NC_017290	CA	3	6	121321	121326	50 %	0 %	0 %	50 %	384452198
2547	NC_017290	A	7	7	121348	121354	100 %	0 %	0 %	0 %	384452198
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2552	NC_017290	TCT	2	6	121619	121624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452198
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2557	NC_017290	TGT	2	6	121897	121902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452199
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2559	NC_017290	CTG	2	6	121980	121985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452199
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2561	NC_017290	AGC	2	6	122098	122103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452199
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2584	NC_017290	AGT	2	6	122674	122679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2586	NC_017290	ATTT	2	8	122759	122766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017290	AAT	2	6	122771	122776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017290	ATT	2	6	122791	122796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017290	TGG	2	6	122804	122809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017290	CTTTT	2	10	122881	122890	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2591	NC_017290	AAAG	2	8	122934	122941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_017290	T	6	6	122950	122955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_017290	T	6	6	122968	122973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_017290	T	6	6	123021	123026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_017290	TTTCTT	2	12	123039	123050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2596	NC_017290	TAAT	2	8	123103	123110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_017290	TCCT	2	8	123362	123369	0 %	50 %	0 %	50 %	384452200
2603	NC_017290	AGAA	2	8	123419	123426	75 %	0 %	25 %	0 %	384452200
2604	NC_017290	GAGAT	2	10	123437	123446	40 %	20 %	40 %	0 %	384452200
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2608	NC_017290	CAA	2	6	123580	123585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452200
2609	NC_017290	AAG	2	6	123746	123751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452200
2610	NC_017290	TAC	2	6	123781	123786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452200
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2613	NC_017290	TA	4	8	124060	124067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017290	TTG	2	6	124198	124203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452201
2615	NC_017290	AGC	2	6	124204	124209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452201
2616	NC_017290	AGC	2	6	124282	124287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452201
2617	NC_017290	GAG	2	6	124399	124404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452201
2618	NC_017290	GCT	3	9	124416	124424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452201
2619	NC_017290	AG	3	6	124468	124473	50 %	0 %	50 %	0 %	384452201
2620	NC_017290	TGT	2	6	124475	124480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452201
2621	NC_017290	TGCATT	2	12	124580	124591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384452201
2622	NC_017290	GTG	2	6	124659	124664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452202
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2998	NC_017290	T	6	6	143140	143145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_017290	ATG	2	6	143227	143232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_017290	TG	3	6	143310	143315	0 %	50 %	50 %	0 %	384452218

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