MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017290	AGT	2	6	70646	70651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452139
1502	NC_017290	ATA	2	6	70708	70713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452139
1503	NC_017290	AGG	2	6	70831	70836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452139
1504	NC_017290	GAA	3	9	70878	70886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452139
1505	NC_017290	T	7	7	70910	70916	0 %	100 %	0 %	0 %	384452139
1506	NC_017290	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384452139
1507	NC_017290	TTC	2	6	71021	71026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452139
1508	NC_017290	T	7	7	71076	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017290	A	7	7	71126	71132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017290	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_017290	ATA	2	6	71242	71247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017290	AAT	2	6	71295	71300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452140
1513	NC_017290	ACA	2	6	71315	71320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452140
1514	NC_017290	TCG	2	6	71343	71348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452140
1515	NC_017290	TGT	2	6	71418	71423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452140
1516	NC_017290	TAT	2	6	71455	71460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452140
1517	NC_017290	TGT	2	6	71523	71528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452140
1518	NC_017290	TCA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452140
1519	NC_017290	A	6	6	71686	71691	100 %	0 %	0 %	0 %	384452140
1520	NC_017290	T	6	6	71720	71725	0 %	100 %	0 %	0 %	384452140
1521	NC_017290	A	6	6	71744	71749	100 %	0 %	0 %	0 %	384452140
1522	NC_017290	GA	3	6	71762	71767	50 %	0 %	50 %	0 %	384452140
1523	NC_017290	ATC	2	6	71839	71844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452140
1524	NC_017290	AAG	2	6	71876	71881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452140
1525	NC_017290	TGT	2	6	71891	71896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452140
1526	NC_017290	AAC	2	6	71910	71915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452140
1527	NC_017290	GT	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	384452140
1528	NC_017290	GAA	2	6	72061	72066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452140
1529	NC_017290	AGA	2	6	72081	72086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452140
1530	NC_017290	GAA	2	6	72096	72101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452140
1531	NC_017290	T	6	6	72127	72132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017290	ATGT	2	8	72159	72166	25 %	50 %	25 %	0 %	384452141
1533	NC_017290	TGTT	2	8	72178	72185	0 %	75 %	25 %	0 %	384452141
1534	NC_017290	T	6	6	72210	72215	0 %	100 %	0 %	0 %	384452141
1535	NC_017290	AGA	2	6	72237	72242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452141
1536	NC_017290	T	7	7	72275	72281	0 %	100 %	0 %	0 %	384452141
1537	NC_017290	TGC	2	6	72306	72311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452141
1538	NC_017290	CAG	2	6	72343	72348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452141
1539	NC_017290	CAA	2	6	72405	72410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452141
1540	NC_017290	ATG	2	6	72425	72430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452141
1541	NC_017290	ACA	2	6	72455	72460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452141
1542	NC_017290	TCA	2	6	72569	72574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452141
1543	NC_017290	CCT	2	6	72635	72640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452141
1544	NC_017290	ATA	3	9	72655	72663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452141
1545	NC_017290	CAG	2	6	72672	72677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452141
1546	NC_017290	GAT	2	6	72741	72746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452141
1547	NC_017290	T	7	7	72841	72847	0 %	100 %	0 %	0 %	384452141
1548	NC_017290	ATAA	2	8	72891	72898	75 %	25 %	0 %	0 %	384452141
1549	NC_017290	AGC	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452141
1550	NC_017290	TAGGGC	2	12	72925	72936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384452141
1551	NC_017290	CCTGAT	2	12	72950	72961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384452141
1552	NC_017290	T	8	8	73035	73042	0 %	100 %	0 %	0 %	384452141
1553	NC_017290	T	7	7	73072	73078	0 %	100 %	0 %	0 %	384452141
1554	NC_017290	TCAT	2	8	73103	73110	25 %	50 %	0 %	25 %	384452141
1555	NC_017290	GTA	2	6	73202	73207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452142
1556	NC_017290	GCA	2	6	73208	73213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452142
1557	NC_017290	CTGC	2	8	73365	73372	0 %	25 %	25 %	50 %	384452142
1558	NC_017290	ACG	2	6	73407	73412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452142
1559	NC_017290	TGT	2	6	73511	73516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452142
1560	NC_017290	GTAA	2	8	73548	73555	50 %	25 %	25 %	0 %	384452142
1561	NC_017290	AAT	2	6	73661	73666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452142
1562	NC_017290	T	6	6	73671	73676	0 %	100 %	0 %	0 %	384452142
1563	NC_017290	TAG	2	6	73684	73689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452142
1564	NC_017290	GT	3	6	73700	73705	0 %	50 %	50 %	0 %	384452142
1565	NC_017290	TTG	2	6	73724	73729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452142
1566	NC_017290	TAA	2	6	73886	73891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452142
1567	NC_017290	AAT	2	6	73940	73945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452142
1568	NC_017290	CAA	2	6	73987	73992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452142
1569	NC_017290	TTA	3	9	74094	74102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017290	ACAA	2	8	74253	74260	75 %	0 %	0 %	25 %	384452143
1571	NC_017290	A	6	6	74304	74309	100 %	0 %	0 %	0 %	384452143
1572	NC_017290	TTAT	2	8	74338	74345	25 %	75 %	0 %	0 %	384452143
1573	NC_017290	ATT	2	6	74374	74379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452143
1574	NC_017290	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384452143
1575	NC_017290	T	6	6	74473	74478	0 %	100 %	0 %	0 %	384452143
1576	NC_017290	GGA	2	6	74563	74568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452143
1577	NC_017290	GA	3	6	74642	74647	50 %	0 %	50 %	0 %	384452143
1578	NC_017290	TTTA	2	8	74696	74703	25 %	75 %	0 %	0 %	384452143
1579	NC_017290	GAA	2	6	74782	74787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452143
1580	NC_017290	TGTTTC	2	12	75006	75017	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384452144
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1582	NC_017290	TAGT	2	8	75215	75222	25 %	50 %	25 %	0 %	384452144
1583	NC_017290	TC	3	6	75230	75235	0 %	50 %	0 %	50 %	384452144
1584	NC_017290	G	6	6	75243	75248	0 %	0 %	100 %	0 %	384452144
1585	NC_017290	TCT	2	6	75266	75271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452144
1586	NC_017290	TGC	2	6	75342	75347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452144
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1588	NC_017290	ATT	3	9	75370	75378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452144
1589	NC_017290	GGA	2	6	75553	75558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452144
1590	NC_017290	AGAA	2	8	75585	75592	75 %	0 %	25 %	0 %	384452144
1591	NC_017290	CTTA	2	8	75599	75606	25 %	50 %	0 %	25 %	384452144
1592	NC_017290	ATT	2	6	75610	75615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452144
1593	NC_017290	TTC	2	6	75714	75719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452144
1594	NC_017290	TGG	2	6	75747	75752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452144
1595	NC_017290	CTG	2	6	75863	75868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452144
1596	NC_017290	CAA	2	6	75908	75913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452144
1597	NC_017290	ATT	2	6	75982	75987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452144
1598	NC_017290	CAG	2	6	76022	76027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452144
1599	NC_017290	TC	3	6	76035	76040	0 %	50 %	0 %	50 %	384452144
1600	NC_017290	ATC	2	6	76091	76096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017290	AGA	2	6	76150	76155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452145
1602	NC_017290	A	7	7	76155	76161	100 %	0 %	0 %	0 %	384452145
1603	NC_017290	TGA	2	6	76213	76218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452145
1604	NC_017290	AATT	2	8	76246	76253	50 %	50 %	0 %	0 %	384452145
1605	NC_017290	GC	3	6	76267	76272	0 %	0 %	50 %	50 %	384452145
1606	NC_017290	GAA	2	6	76322	76327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452145
1607	NC_017290	TC	3	6	76334	76339	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
1608	NC_017290	TGT	2	6	76345	76350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452145
1609	NC_017290	CAT	2	6	76376	76381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452145
1610	NC_017290	TC	3	6	76437	76442	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
1611	NC_017290	GTT	2	6	76453	76458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452145
1612	NC_017290	TCCA	2	8	76476	76483	25 %	25 %	0 %	50 %	384452145
1613	NC_017290	GAA	2	6	76487	76492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452145
1614	NC_017290	TGC	2	6	76516	76521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452145
1615	NC_017290	TCC	2	6	76529	76534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452145
1616	NC_017290	ATG	2	6	76554	76559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452145
1617	NC_017290	CA	3	6	76572	76577	50 %	0 %	0 %	50 %	384452145
1618	NC_017290	CGG	2	6	76626	76631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384452145
1619	NC_017290	TCT	2	6	76636	76641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452145
1620	NC_017290	GGT	2	6	76715	76720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452145
1621	NC_017290	CT	3	6	76760	76765	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
1622	NC_017290	AGG	2	6	76789	76794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452145
1623	NC_017290	GAA	2	6	76850	76855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452145
1624	NC_017290	CG	3	6	76870	76875	0 %	0 %	50 %	50 %	384452145
1625	NC_017290	AGC	2	6	76896	76901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452145
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