MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017290	T	6	6	236291	236296	0 %	100 %	0 %	0 %	384452301
5002	NC_017290	GAA	2	6	236437	236442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452301
5003	NC_017290	ACA	2	6	236467	236472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452301
5004	NC_017290	CAA	2	6	236474	236479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452301
5005	NC_017290	ACT	2	6	236487	236492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452301
5006	NC_017290	TCT	2	6	236502	236507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452301
5007	NC_017290	TTA	2	6	236518	236523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452301
5008	NC_017290	GTA	2	6	236525	236530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452301
5009	NC_017290	TC	4	8	236537	236544	0 %	50 %	0 %	50 %	384452301
5010	NC_017290	ATC	2	6	236561	236566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452301
5011	NC_017290	TCT	2	6	236683	236688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452301
5012	NC_017290	TG	4	8	236701	236708	0 %	50 %	50 %	0 %	384452301
5013	NC_017290	TC	4	8	236793	236800	0 %	50 %	0 %	50 %	384452301
5014	NC_017290	CTT	2	6	236860	236865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452301
5015	NC_017290	ATG	2	6	236875	236880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452301
5016	NC_017290	TGT	2	6	236910	236915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452301
5017	NC_017290	TGG	2	6	236939	236944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452301
5018	NC_017290	AG	3	6	237006	237011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017290	AT	3	6	237076	237081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017290	CTA	2	6	237185	237190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017290	CGA	2	6	237423	237428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5022	NC_017290	TGC	2	6	237434	237439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5023	NC_017290	T	6	6	237518	237523	0 %	100 %	0 %	0 %	384452302
5024	NC_017290	AAC	3	9	237593	237601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452302
5025	NC_017290	T	6	6	237608	237613	0 %	100 %	0 %	0 %	384452302
5026	NC_017290	GTT	2	6	237614	237619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452302
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5028	NC_017290	TGC	2	6	237681	237686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5029	NC_017290	CTT	2	6	237700	237705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452302
5030	NC_017290	ACT	2	6	237752	237757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452302
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5032	NC_017290	TGC	2	6	237869	237874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5033	NC_017290	CATC	2	8	237904	237911	25 %	25 %	0 %	50 %	384452302
5034	NC_017290	GCT	2	6	237921	237926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5035	NC_017290	CTT	2	6	237982	237987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452302
5036	NC_017290	CGA	2	6	238038	238043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452302
5037	NC_017290	CATG	2	8	238162	238169	25 %	25 %	25 %	25 %	384452302
5038	NC_017290	CTTG	2	8	238180	238187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_017290	GAAT	2	8	238231	238238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017290	GAA	3	9	238245	238253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017290	T	6	6	238268	238273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017290	AAG	2	6	238277	238282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017290	T	7	7	238292	238298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017290	AAG	2	6	238331	238336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017290	ACC	2	6	238350	238355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_017290	AATT	2	8	238370	238377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017290	GAT	2	6	238411	238416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017290	TTTC	2	8	238470	238477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017290	GTT	2	6	238498	238503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017290	A	8	8	238538	238545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017290	AGA	2	6	238580	238585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017290	GAG	2	6	238666	238671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452303
5053	NC_017290	T	6	6	238726	238731	0 %	100 %	0 %	0 %	384452303
5054	NC_017290	GTT	2	6	238782	238787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452303
5055	NC_017290	CT	3	6	238789	238794	0 %	50 %	0 %	50 %	384452303
5056	NC_017290	AGC	2	6	238842	238847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452303
5057	NC_017290	TTG	2	6	238850	238855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452303
5058	NC_017290	CTC	2	6	238939	238944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452303
5059	NC_017290	CTTT	2	8	238985	238992	0 %	75 %	0 %	25 %	384452303
5060	NC_017290	T	6	6	238990	238995	0 %	100 %	0 %	0 %	384452303
5061	NC_017290	AGA	2	6	239142	239147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452303
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5063	NC_017290	GCA	2	6	239186	239191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452303
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5065	NC_017290	TTG	2	6	239449	239454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452303
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5069	NC_017290	T	7	7	239626	239632	0 %	100 %	0 %	0 %	384452303
5070	NC_017290	ATTATA	2	12	239712	239723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017290	A	6	6	239747	239752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017290	CTT	2	6	239784	239789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017290	TAT	2	6	239811	239816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017290	ATAA	2	8	239852	239859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017290	GA	3	6	239894	239899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017290	A	6	6	239929	239934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017290	GCA	2	6	239947	239952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017290	GCA	2	6	239957	239962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017290	CAA	2	6	240015	240020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017290	GCTT	2	8	240030	240037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_017290	TTC	2	6	240073	240078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017290	TAAAA	2	10	240129	240138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017290	T	6	6	240173	240178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017290	TCA	2	6	240180	240185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452304
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5088	NC_017290	TAG	2	6	240545	240550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452304
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5090	NC_017290	AAAT	2	8	240668	240675	75 %	25 %	0 %	0 %	384452304
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5094	NC_017290	GTTT	2	8	240901	240908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017290	TAG	2	6	240969	240974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017290	A	7	7	241061	241067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017290	AG	3	6	241103	241108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017290	TAT	2	6	241119	241124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017290	TCAT	2	8	241131	241138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_017290	ATA	2	6	241146	241151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017290	CGT	2	6	241167	241172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452305
5102	NC_017290	GAA	2	6	241204	241209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452305
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5107	NC_017290	TTCAG	2	10	241357	241366	20 %	40 %	20 %	20 %	384452305
5108	NC_017290	TTG	2	6	241432	241437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452305
5109	NC_017290	CAT	2	6	241549	241554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452305
5110	NC_017290	ATT	2	6	241559	241564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
5111	NC_017290	GTTT	2	8	241670	241677	0 %	75 %	25 %	0 %	384452305
5112	NC_017290	AGG	2	6	241696	241701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452305
5113	NC_017290	TG	3	6	241754	241759	0 %	50 %	50 %	0 %	384452305
5114	NC_017290	ATT	2	6	241794	241799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
5115	NC_017290	TTC	2	6	241855	241860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452305
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5120	NC_017290	TTG	2	6	241971	241976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452305
5121	NC_017290	ATT	2	6	242006	242011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452305
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5127	NC_017290	TCA	2	6	242194	242199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452305
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5129	NC_017290	AT	3	6	242334	242339	50 %	50 %	0 %	0 %	384452305
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5133	NC_017290	TGA	2	6	242527	242532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452305
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5241	NC_017290	AAT	2	6	247815	247820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452312
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5245	NC_017290	TAC	2	6	248047	248052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_017290	TATT	2	8	248293	248300	25 %	75 %	0 %	0 %	384452313
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5498	NC_017290	ATC	2	6	260039	260044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452325
5499	NC_017290	T	6	6	260086	260091	0 %	100 %	0 %	0 %	384452325
5500	NC_017290	CAG	2	6	260092	260097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452325

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