MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017290	CTC	2	6	210891	210896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452278
4502	NC_017290	CTAA	2	8	210915	210922	50 %	25 %	0 %	25 %	384452278
4503	NC_017290	GTC	2	6	211079	211084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017290	T	6	6	211168	211173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017290	AAT	2	6	211265	211270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452279
4506	NC_017290	AAGC	2	8	211280	211287	50 %	0 %	25 %	25 %	384452279
4507	NC_017290	ATT	2	6	211325	211330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452279
4508	NC_017290	AAG	2	6	211351	211356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452279
4509	NC_017290	GTT	2	6	211373	211378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452279
4510	NC_017290	GTA	2	6	211431	211436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452279
4511	NC_017290	GA	3	6	211465	211470	50 %	0 %	50 %	0 %	384452279
4512	NC_017290	GTAG	2	8	211752	211759	25 %	25 %	50 %	0 %	384452280
4513	NC_017290	TGA	2	6	211766	211771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452280
4514	NC_017290	TTG	2	6	211798	211803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452280
4515	NC_017290	AT	3	6	211826	211831	50 %	50 %	0 %	0 %	384452280
4516	NC_017290	TTC	2	6	211837	211842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452280
4517	NC_017290	GTTT	2	8	211877	211884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017290	T	6	6	211896	211901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017290	GGT	2	6	212078	212083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452281
4520	NC_017290	GAA	2	6	212203	212208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452281
4521	NC_017290	GTT	2	6	212309	212314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452281
4522	NC_017290	AGG	2	6	212329	212334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452281
4523	NC_017290	ATT	2	6	212485	212490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452281
4524	NC_017290	ATT	2	6	212689	212694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452281
4525	NC_017290	GTT	2	6	212695	212700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452281
4526	NC_017290	TCC	2	6	212729	212734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452281
4527	NC_017290	AGA	3	9	212737	212745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452281
4528	NC_017290	TGA	2	6	212827	212832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452281
4529	NC_017290	TTG	2	6	212997	213002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452282
4530	NC_017290	ATC	2	6	213077	213082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4531	NC_017290	TGC	2	6	213193	213198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452282
4532	NC_017290	GAAG	2	8	213210	213217	50 %	0 %	50 %	0 %	384452282
4533	NC_017290	CAT	2	6	213247	213252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4534	NC_017290	AT	3	6	213251	213256	50 %	50 %	0 %	0 %	384452282
4535	NC_017290	AAAG	2	8	213272	213279	75 %	0 %	25 %	0 %	384452282
4536	NC_017290	TAC	2	6	213298	213303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4537	NC_017290	GGT	2	6	213352	213357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452282
4538	NC_017290	ATA	2	6	213428	213433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452282
4539	NC_017290	TCT	2	6	213476	213481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452282
4540	NC_017290	CATA	2	8	213549	213556	50 %	25 %	0 %	25 %	384452282
4541	NC_017290	CCT	2	6	213608	213613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452282
4542	NC_017290	ATGT	2	8	213665	213672	25 %	50 %	25 %	0 %	384452282
4543	NC_017290	ACA	2	6	213677	213682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452282
4544	NC_017290	GCC	2	6	213707	213712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384452282
4545	NC_017290	AAG	2	6	213717	213722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452282
4546	NC_017290	A	7	7	213751	213757	100 %	0 %	0 %	0 %	384452282
4547	NC_017290	T	7	7	213775	213781	0 %	100 %	0 %	0 %	384452283
4548	NC_017290	TTG	2	6	213812	213817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4549	NC_017290	GTT	2	6	213832	213837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4550	NC_017290	ATG	2	6	213882	213887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452283
4551	NC_017290	GTT	2	6	213953	213958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4552	NC_017290	AGAT	2	8	214059	214066	50 %	25 %	25 %	0 %	384452283
4553	NC_017290	AGAA	2	8	214182	214189	75 %	0 %	25 %	0 %	384452283
4554	NC_017290	GAAAA	2	10	214211	214220	80 %	0 %	20 %	0 %	384452283
4555	NC_017290	TGC	2	6	214234	214239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452283
4556	NC_017290	T	7	7	214266	214272	0 %	100 %	0 %	0 %	384452283
4557	NC_017290	GTA	2	6	214303	214308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452283
4558	NC_017290	AAC	2	6	214324	214329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452283
4559	NC_017290	GTT	2	6	214342	214347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4560	NC_017290	C	6	6	214350	214355	0 %	0 %	0 %	100 %	384452283
4561	NC_017290	CAA	2	6	214376	214381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452283
4562	NC_017290	GTT	2	6	214494	214499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452284
4563	NC_017290	ATT	2	6	214514	214519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452284
4564	NC_017290	TTC	2	6	214529	214534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452284
4565	NC_017290	TAGCA	2	10	214577	214586	40 %	20 %	20 %	20 %	384452284
4566	NC_017290	AGC	2	6	214652	214657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4567	NC_017290	ACA	2	6	214662	214667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452284
4568	NC_017290	ACG	2	6	214704	214709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
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4570	NC_017290	AGC	2	6	214781	214786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4571	NC_017290	AG	3	6	214888	214893	50 %	0 %	50 %	0 %	384452284
4572	NC_017290	T	6	6	215007	215012	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4573	NC_017290	T	7	7	215040	215046	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4574	NC_017290	T	6	6	215101	215106	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4575	NC_017290	TTC	2	6	215240	215245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452284
4576	NC_017290	AAGAA	2	10	215275	215284	80 %	0 %	20 %	0 %	384452284
4577	NC_017290	AAG	2	6	215291	215296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452284
4578	NC_017290	TGA	2	6	215328	215333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017290	TAA	2	6	215365	215370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017290	T	6	6	215398	215403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017290	AT	3	6	215443	215448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017290	GA	3	6	215503	215508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017290	GT	3	6	215543	215548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017290	CT	3	6	215580	215585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_017290	T	6	6	215608	215613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017290	T	6	6	215671	215676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017290	T	6	6	215717	215722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017290	A	6	6	215768	215773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017290	AG	3	6	215807	215812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017290	TC	3	6	215866	215871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_017290	GAA	2	6	215909	215914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452285
4592	NC_017290	TCA	2	6	215934	215939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452285
4593	NC_017290	AG	3	6	216044	216049	50 %	0 %	50 %	0 %	384452285
4594	NC_017290	GT	3	6	216128	216133	0 %	50 %	50 %	0 %	384452285
4595	NC_017290	GACA	2	8	216165	216172	50 %	0 %	25 %	25 %	384452285
4596	NC_017290	AG	3	6	216194	216199	50 %	0 %	50 %	0 %	384452285
4597	NC_017290	CTC	2	6	216251	216256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452285
4598	NC_017290	ATT	2	6	216279	216284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452285
4599	NC_017290	TTG	2	6	216387	216392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452285
4600	NC_017290	GGT	2	6	216398	216403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452285
4601	NC_017290	AGC	2	6	216454	216459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452285
4602	NC_017290	TTG	2	6	216519	216524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452285
4603	NC_017290	AAG	2	6	216554	216559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452286
4604	NC_017290	GAAAG	2	10	216575	216584	60 %	0 %	40 %	0 %	384452286
4605	NC_017290	TAT	2	6	216663	216668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452286
4606	NC_017290	AGA	2	6	216690	216695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452286
4607	NC_017290	ATTT	2	8	216746	216753	25 %	75 %	0 %	0 %	384452286
4608	NC_017290	TCA	2	6	216858	216863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452286
4609	NC_017290	GTG	2	6	216941	216946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452286
4610	NC_017290	ACTC	2	8	216955	216962	25 %	25 %	0 %	50 %	384452286
4611	NC_017290	TTA	2	6	217049	217054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452286
4612	NC_017290	TGT	2	6	217107	217112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452286
4613	NC_017290	TG	3	6	217211	217216	0 %	50 %	50 %	0 %	384452286
4614	NC_017290	TAG	2	6	217296	217301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452286
4615	NC_017290	TAC	2	6	217312	217317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452286
4616	NC_017290	AT	3	6	217547	217552	50 %	50 %	0 %	0 %	384452287
4617	NC_017290	AGAA	2	8	217852	217859	75 %	0 %	25 %	0 %	384452287
4618	NC_017290	TTG	2	6	217864	217869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452287
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4620	NC_017290	TTC	2	6	218258	218263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452287
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4624	NC_017290	GA	3	6	218381	218386	50 %	0 %	50 %	0 %	384452287
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4626	NC_017290	GCG	2	6	218447	218452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384452287
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4879	NC_017290	ATTT	2	8	230344	230351	25 %	75 %	0 %	0 %	384452295
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4883	NC_017290	AT	3	6	230545	230550	50 %	50 %	0 %	0 %	384452296
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4999	NC_017290	GTCC	2	8	236266	236273	0 %	25 %	25 %	50 %	384452301
5000	NC_017290	GTCT	2	8	236284	236291	0 %	50 %	25 %	25 %	384452301

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