MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 3025

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017289	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	384451107
2	NC_017289	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	384451107
3	NC_017289	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	384451108
4	NC_017289	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	384451108
5	NC_017289	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	384451109
6	NC_017289	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	384451109
7	NC_017289	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	384451109
8	NC_017289	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	384451110
9	NC_017289	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	384451110
10	NC_017289	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	384451110
11	NC_017289	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017289	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	384451111
13	NC_017289	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017289	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017289	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	384451112
16	NC_017289	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	384451112
17	NC_017289	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	384451112
18	NC_017289	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	384451113
19	NC_017289	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	384451113
20	NC_017289	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	384451113
21	NC_017289	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	384451113
22	NC_017289	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	384451113
23	NC_017289	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	384451113
24	NC_017289	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	384451113
25	NC_017289	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	384451113
26	NC_017289	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	384451113
27	NC_017289	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	384451114
28	NC_017289	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	384451114
29	NC_017289	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	384451114
30	NC_017289	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	384451114
31	NC_017289	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	384451114
32	NC_017289	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	384451114
33	NC_017289	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	384451114
34	NC_017289	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	384451114
35	NC_017289	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	384451114
36	NC_017289	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	384451114
37	NC_017289	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	384451114
38	NC_017289	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	384451115
39	NC_017289	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	384451115
40	NC_017289	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	384451115
41	NC_017289	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	384451115
42	NC_017289	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017289	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	384451117
44	NC_017289	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	384451117
45	NC_017289	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017289	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	384451118
47	NC_017289	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	384451118
48	NC_017289	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	384451118
49	NC_017289	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	384451119
50	NC_017289	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	384451119
51	NC_017289	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	384451119
52	NC_017289	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	384451119
53	NC_017289	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	384451119
54	NC_017289	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	384451120
55	NC_017289	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	384451120
56	NC_017289	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	384451120
57	NC_017289	CAAT	2	8	22282	22289	50 %	25 %	0 %	25 %	384451121
58	NC_017289	AGAA	2	8	22699	22706	75 %	0 %	25 %	0 %	384451121
59	NC_017289	TGAT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	384451121
60	NC_017289	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384451122
61	NC_017289	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
62	NC_017289	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384451122
63	NC_017289	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
64	NC_017289	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384451122
65	NC_017289	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384451122
66	NC_017289	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384451122
67	NC_017289	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384451122
68	NC_017289	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384451122
69	NC_017289	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	384451122
70	NC_017289	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
71	NC_017289	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017289	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017289	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384451123
74	NC_017289	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	384451123
75	NC_017289	AAAT	2	8	28809	28816	75 %	25 %	0 %	0 %	384451123
76	NC_017289	GGCA	2	8	29087	29094	25 %	0 %	50 %	25 %	384451123
77	NC_017289	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	384451124
78	NC_017289	GAAT	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	384451125
79	NC_017289	AGAA	2	8	29791	29798	75 %	0 %	25 %	0 %	384451125
80	NC_017289	ACCA	2	8	30241	30248	50 %	0 %	0 %	50 %	384451125
81	NC_017289	GTTT	2	8	31412	31419	0 %	75 %	25 %	0 %	384451127
82	NC_017289	TTTC	2	8	31652	31659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017289	TCTA	2	8	32056	32063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017289	AATT	2	8	32380	32387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017289	TTAA	2	8	32420	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017289	ATTT	2	8	32435	32442	25 %	75 %	0 %	0 %	384451129
87	NC_017289	TTGT	2	8	32461	32468	0 %	75 %	25 %	0 %	384451129
88	NC_017289	TAGA	2	8	32667	32674	50 %	25 %	25 %	0 %	384451129
89	NC_017289	TTTA	2	8	33121	33128	25 %	75 %	0 %	0 %	384451129
90	NC_017289	TTAA	2	8	33516	33523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017289	AGAT	2	8	33559	33566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017289	TGAA	2	8	34018	34025	50 %	25 %	25 %	0 %	384451131
93	NC_017289	GTAC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	25 %	25 %	384451131
94	NC_017289	GATA	2	8	34132	34139	50 %	25 %	25 %	0 %	384451131
95	NC_017289	TCTT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	384451132
96	NC_017289	AGGA	2	8	35344	35351	50 %	0 %	50 %	0 %	384451132
97	NC_017289	TAAT	2	8	36132	36139	50 %	50 %	0 %	0 %	384451133
98	NC_017289	CGCT	2	8	36848	36855	0 %	25 %	25 %	50 %	384451133
99	NC_017289	TCAA	2	8	37781	37788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017289	AAAG	2	8	38203	38210	75 %	0 %	25 %	0 %	384451134
101	NC_017289	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	384451134
102	NC_017289	TCAA	2	8	38355	38362	50 %	25 %	0 %	25 %	384451134
103	NC_017289	TTTA	2	8	38688	38695	25 %	75 %	0 %	0 %	384451134
104	NC_017289	CTTT	2	8	38818	38825	0 %	75 %	0 %	25 %	384451134
105	NC_017289	AGCG	2	8	39007	39014	25 %	0 %	50 %	25 %	384451134
106	NC_017289	CCTG	2	8	40303	40310	0 %	25 %	25 %	50 %	384451137
107	NC_017289	GAAA	2	8	41244	41251	75 %	0 %	25 %	0 %	384451137
108	NC_017289	AGCA	2	8	41415	41422	50 %	0 %	25 %	25 %	384451137
109	NC_017289	CTGT	2	8	41883	41890	0 %	50 %	25 %	25 %	384451137
110	NC_017289	TCTT	2	8	41923	41930	0 %	75 %	0 %	25 %	384451137
111	NC_017289	GAAG	2	8	42334	42341	50 %	0 %	50 %	0 %	384451137
112	NC_017289	AATA	2	8	42365	42372	75 %	25 %	0 %	0 %	384451137
113	NC_017289	GAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	384451141
114	NC_017289	GTCG	2	8	44200	44207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017289	TTAA	2	8	44230	44237	50 %	50 %	0 %	0 %	384451142
116	NC_017289	ATCA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	0 %	25 %	384451142
117	NC_017289	ATGA	2	8	45097	45104	50 %	25 %	25 %	0 %	384451142
118	NC_017289	TAAA	2	8	45996	46003	75 %	25 %	0 %	0 %	384451143
119	NC_017289	GAAA	2	8	46978	46985	75 %	0 %	25 %	0 %	384451145
120	NC_017289	TCTT	2	8	47084	47091	0 %	75 %	0 %	25 %	384451145
121	NC_017289	GCTT	2	8	47613	47620	0 %	50 %	25 %	25 %	384451145
122	NC_017289	AAGA	2	8	48055	48062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017289	TGTT	2	8	48465	48472	0 %	75 %	25 %	0 %	384451146
124	NC_017289	ATAA	2	8	49533	49540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017289	TAAA	2	8	49702	49709	75 %	25 %	0 %	0 %	384451147
126	NC_017289	AAGC	2	8	49731	49738	50 %	0 %	25 %	25 %	384451147
127	NC_017289	CCAA	2	8	49755	49762	50 %	0 %	0 %	50 %	384451147
128	NC_017289	TTCC	2	8	49902	49909	0 %	50 %	0 %	50 %	384451147
129	NC_017289	AACA	2	8	50879	50886	75 %	0 %	0 %	25 %	384451147
130	NC_017289	AAAG	2	8	52613	52620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017289	TTTA	2	8	52623	52630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017289	GAAG	2	8	52726	52733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017289	ATCC	2	8	53032	53039	25 %	25 %	0 %	50 %	384451148
134	NC_017289	AGCA	2	8	53324	53331	50 %	0 %	25 %	25 %	384451148
135	NC_017289	TTCA	2	8	53484	53491	25 %	50 %	0 %	25 %	384451148
136	NC_017289	GTAT	2	8	54137	54144	25 %	50 %	25 %	0 %	384451149
137	NC_017289	CATA	2	8	54332	54339	50 %	25 %	0 %	25 %	384451149
138	NC_017289	AAAG	2	8	54791	54798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017289	TAGC	2	8	55863	55870	25 %	25 %	25 %	25 %	384451151
140	NC_017289	CTGT	2	8	56042	56049	0 %	50 %	25 %	25 %	384451151
141	NC_017289	CTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	0 %	25 %	384451152
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