MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 24915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017289	ATG	2	6	143228	143233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017289	TG	3	6	143311	143316	0 %	50 %	50 %	0 %	384451242
3003	NC_017289	TCCT	2	8	143319	143326	0 %	50 %	0 %	50 %	384451242
3004	NC_017289	GTT	2	6	143340	143345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451242
3005	NC_017289	AGAAA	2	10	143350	143359	80 %	0 %	20 %	0 %	384451242
3006	NC_017289	ATT	2	6	143362	143367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451242
3007	NC_017289	TAC	2	6	143380	143385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451242
3008	NC_017289	TGA	2	6	143524	143529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451242
3009	NC_017289	TAC	2	6	143559	143564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451242
3010	NC_017289	CAG	2	6	143568	143573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451242
3011	NC_017289	TTG	3	9	143628	143636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451242
3012	NC_017289	TA	3	6	143691	143696	50 %	50 %	0 %	0 %	384451242
3013	NC_017289	ATG	2	6	143799	143804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451242
3014	NC_017289	TAT	2	6	143818	143823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451242
3015	NC_017289	ATT	2	6	143870	143875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451242
3016	NC_017289	TAG	2	6	143907	143912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451242
3017	NC_017289	TTC	2	6	143913	143918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451242
3018	NC_017289	GTG	2	6	143919	143924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451242
3019	NC_017289	AGA	2	6	143925	143930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451242
3020	NC_017289	TTG	2	6	143936	143941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451242
3021	NC_017289	TTA	2	6	144035	144040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451243
3022	NC_017289	AAT	2	6	144072	144077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451243
3023	NC_017289	GAG	2	6	144101	144106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451243
3024	NC_017289	TCTA	2	8	144144	144151	25 %	50 %	0 %	25 %	384451243
3025	NC_017289	T	6	6	144237	144242	0 %	100 %	0 %	0 %	384451243
3026	NC_017289	TTG	2	6	144272	144277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451243
3027	NC_017289	ATA	2	6	144437	144442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451243
3028	NC_017289	CAG	2	6	144445	144450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451243
3029	NC_017289	TAG	2	6	144455	144460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451243
3030	NC_017289	ATCA	2	8	144495	144502	50 %	25 %	0 %	25 %	384451243
3031	NC_017289	CAA	2	6	144635	144640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451243
3032	NC_017289	TGT	2	6	144667	144672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451243
3033	NC_017289	AT	3	6	144771	144776	50 %	50 %	0 %	0 %	384451243
3034	NC_017289	T	6	6	144828	144833	0 %	100 %	0 %	0 %	384451243
3035	NC_017289	AAT	2	6	144847	144852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451243
3036	NC_017289	TGAA	2	8	144859	144866	50 %	25 %	25 %	0 %	384451243
3037	NC_017289	GGAA	3	12	144867	144878	50 %	0 %	50 %	0 %	384451243
3038	NC_017289	TCC	2	6	144879	144884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451243
3039	NC_017289	AGTA	2	8	144900	144907	50 %	25 %	25 %	0 %	384451243
3040	NC_017289	A	7	7	144916	144922	100 %	0 %	0 %	0 %	384451243
3041	NC_017289	TAT	2	6	144993	144998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017289	TAA	2	6	145000	145005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017289	AAT	2	6	145086	145091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451244
3044	NC_017289	A	7	7	145119	145125	100 %	0 %	0 %	0 %	384451244
3045	NC_017289	TAT	2	6	145183	145188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451244
3046	NC_017289	T	7	7	145220	145226	0 %	100 %	0 %	0 %	384451244
3047	NC_017289	T	7	7	145271	145277	0 %	100 %	0 %	0 %	384451244
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3049	NC_017289	TTG	2	6	145297	145302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451244
3050	NC_017289	T	7	7	145334	145340	0 %	100 %	0 %	0 %	384451244
3051	NC_017289	TTTA	2	8	145379	145386	25 %	75 %	0 %	0 %	384451244
3052	NC_017289	TTG	2	6	145402	145407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451244
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3055	NC_017289	TGTTTT	2	12	145533	145544	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384451244
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3057	NC_017289	TTA	2	6	145575	145580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451244
3058	NC_017289	CT	4	8	145669	145676	0 %	50 %	0 %	50 %	384451244
3059	NC_017289	TCC	2	6	145730	145735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451244
3060	NC_017289	T	6	6	145767	145772	0 %	100 %	0 %	0 %	384451244
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3062	NC_017289	GAT	2	6	145907	145912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451244
3063	NC_017289	TA	3	6	146000	146005	50 %	50 %	0 %	0 %	384451244
3064	NC_017289	AAAGA	2	10	146015	146024	80 %	0 %	20 %	0 %	384451244
3065	NC_017289	AAG	2	6	146031	146036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451244
3066	NC_017289	ATA	2	6	146071	146076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451244
3067	NC_017289	TTAT	2	8	146097	146104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017289	TTAT	2	8	146132	146139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017289	GTAA	2	8	146153	146160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017289	CCT	2	6	146316	146321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451245
3071	NC_017289	TATT	2	8	146337	146344	25 %	75 %	0 %	0 %	384451245
3072	NC_017289	CTTT	2	8	146390	146397	0 %	75 %	0 %	25 %	384451245
3073	NC_017289	CTT	2	6	146417	146422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451245
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3080	NC_017289	GAA	2	6	146718	146723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451246
3081	NC_017289	TCT	2	6	146784	146789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017289	AAG	2	6	146809	146814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017289	T	6	6	146819	146824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017289	TCA	2	6	146869	146874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451247
3085	NC_017289	ATAGGC	2	12	146935	146946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384451247
3086	NC_017289	GAA	2	6	147013	147018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451247
3087	NC_017289	CTG	2	6	147072	147077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017289	T	6	6	147095	147100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017289	TCT	2	6	147118	147123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017289	CTC	2	6	147161	147166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_017289	GAG	2	6	147196	147201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017289	T	6	6	147205	147210	0 %	100 %	0 %	0 %	384451248
3093	NC_017289	AT	3	6	147216	147221	50 %	50 %	0 %	0 %	384451248
3094	NC_017289	A	6	6	147241	147246	100 %	0 %	0 %	0 %	384451248
3095	NC_017289	TTG	2	6	147262	147267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451248
3096	NC_017289	TGA	2	6	147303	147308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451248
3097	NC_017289	TAC	2	6	147385	147390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451248
3098	NC_017289	TTTA	2	8	147427	147434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017289	AATA	2	8	147482	147489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017289	AGT	2	6	147499	147504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017289	ATTT	3	12	147540	147551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017289	T	6	6	147596	147601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017289	ATT	2	6	147610	147615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017289	T	6	6	147620	147625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017289	T	7	7	147704	147710	0 %	100 %	0 %	0 %	384451249
3106	NC_017289	ACA	2	6	147720	147725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451249
3107	NC_017289	A	6	6	147741	147746	100 %	0 %	0 %	0 %	384451249
3108	NC_017289	CTT	2	6	147759	147764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451249
3109	NC_017289	CTT	2	6	147769	147774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451249
3110	NC_017289	TGA	2	6	147803	147808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451249
3111	NC_017289	AAGTAA	2	12	147817	147828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384451249
3112	NC_017289	AAG	2	6	147862	147867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451249
3113	NC_017289	CAT	3	9	147885	147893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451249
3114	NC_017289	TGA	2	6	147912	147917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017289	G	6	6	147922	147927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017289	C	6	6	147928	147933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3117	NC_017289	CAT	2	6	147950	147955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017289	TTCCGT	2	12	148030	148041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_017289	T	6	6	148083	148088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017289	TTTTA	2	10	148194	148203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017289	T	6	6	148206	148211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017289	ATT	2	6	148267	148272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017289	TAA	2	6	148277	148282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017289	AGA	2	6	148283	148288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017289	T	6	6	148355	148360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_017289	CAC	2	6	148476	148481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3373	NC_017289	A	6	6	160597	160602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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