MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 24915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017289	AAG	2	6	23077	23082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451121
502	NC_017289	AAC	2	6	23108	23113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451121
503	NC_017289	GGT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451121
504	NC_017289	AGC	2	6	23176	23181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451121
505	NC_017289	ATG	2	6	23266	23271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451121
506	NC_017289	AGC	2	6	23283	23288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451121
507	NC_017289	GCT	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451121
508	NC_017289	CTG	2	6	23380	23385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451121
509	NC_017289	ATG	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451121
510	NC_017289	TTA	2	6	23599	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451121
511	NC_017289	AAG	2	6	23656	23661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451121
512	NC_017289	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	384451121
513	NC_017289	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017289	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017289	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017289	TTG	2	6	24012	24017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
517	NC_017289	TGT	2	6	24049	24054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
518	NC_017289	AGT	2	6	24066	24071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451122
519	NC_017289	TTG	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
520	NC_017289	TCC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451122
521	NC_017289	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384451122
522	NC_017289	TTG	2	6	24354	24359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
523	NC_017289	GAA	2	6	24364	24369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451122
524	NC_017289	T	6	6	24381	24386	0 %	100 %	0 %	0 %	384451122
525	NC_017289	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
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528	NC_017289	GTA	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451122
529	NC_017289	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451122
530	NC_017289	TTA	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
531	NC_017289	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384451122
532	NC_017289	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
533	NC_017289	T	8	8	24798	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	384451122
534	NC_017289	TGT	2	6	24820	24825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
535	NC_017289	GCT	2	6	24850	24855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451122
536	NC_017289	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384451122
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539	NC_017289	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384451122
540	NC_017289	TTG	2	6	25010	25015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
541	NC_017289	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
542	NC_017289	ATT	2	6	25113	25118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
543	NC_017289	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
544	NC_017289	TTG	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
545	NC_017289	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384451122
546	NC_017289	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451122
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548	NC_017289	GCA	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451122
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553	NC_017289	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
554	NC_017289	TTA	2	6	25753	25758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
555	NC_017289	TAT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
556	NC_017289	TCA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451122
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558	NC_017289	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451122
559	NC_017289	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	384451122
560	NC_017289	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384451122
561	NC_017289	TTC	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
562	NC_017289	TCT	2	6	25918	25923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
563	NC_017289	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	384451122
564	NC_017289	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384451122
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572	NC_017289	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	384451122
573	NC_017289	AGA	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451122
574	NC_017289	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017289	T	7	7	26579	26585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_017289	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017289	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017289	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451123
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591	NC_017289	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	384451123
592	NC_017289	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384451123
593	NC_017289	AAG	2	6	27275	27280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451123
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599	NC_017289	AGA	3	9	27564	27572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451123
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601	NC_017289	GCT	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451123
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609	NC_017289	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	384451123
610	NC_017289	TTG	2	6	28076	28081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451123
611	NC_017289	CTA	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451123
612	NC_017289	ACA	2	6	28105	28110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451123
613	NC_017289	AAG	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451123
614	NC_017289	GAC	2	6	28197	28202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451123
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619	NC_017289	TGC	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451123
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