MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017287	AAC	2	6	166056	166061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450258
3502	NC_017287	TGT	2	6	166140	166145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450258
3503	NC_017287	CGAG	2	8	166149	166156	25 %	0 %	50 %	25 %	384450258
3504	NC_017287	GAA	2	6	166168	166173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450258
3505	NC_017287	GAT	2	6	166236	166241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450258
3506	NC_017287	GTG	2	6	166292	166297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450258
3507	NC_017287	GAG	2	6	166312	166317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450258
3508	NC_017287	AAATG	2	10	166347	166356	60 %	20 %	20 %	0 %	384450258
3509	NC_017287	CTT	2	6	166507	166512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450258
3510	NC_017287	AAGAGA	2	12	166547	166558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450258
3511	NC_017287	GAA	2	6	166621	166626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450258
3512	NC_017287	AAT	2	6	166648	166653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450258
3513	NC_017287	TCT	2	6	166665	166670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450258
3514	NC_017287	AGC	2	6	166760	166765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450258
3515	NC_017287	G	6	6	166845	166850	0 %	0 %	100 %	0 %	384450258
3516	NC_017287	TGA	2	6	166917	166922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450258
3517	NC_017287	AAC	2	6	166943	166948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450258
3518	NC_017287	TTGC	2	8	166950	166957	0 %	50 %	25 %	25 %	384450258
3519	NC_017287	TTC	2	6	166966	166971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450258
3520	NC_017287	AC	3	6	167186	167191	50 %	0 %	0 %	50 %	384450258
3521	NC_017287	TC	3	6	167210	167215	0 %	50 %	0 %	50 %	384450258
3522	NC_017287	GGA	2	6	167242	167247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450258
3523	NC_017287	GAA	2	6	167269	167274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450258
3524	NC_017287	TTC	2	6	167281	167286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450258
3525	NC_017287	AGC	2	6	167364	167369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450258
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3529	NC_017287	CAAC	2	8	167566	167573	50 %	0 %	0 %	50 %	384450258
3530	NC_017287	TGT	2	6	167737	167742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450259
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3532	NC_017287	GT	3	6	167819	167824	0 %	50 %	50 %	0 %	384450259
3533	NC_017287	GCA	2	6	167858	167863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450259
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3535	NC_017287	TAC	2	6	167881	167886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450259
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3537	NC_017287	ATA	2	6	167970	167975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450259
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3539	NC_017287	A	8	8	167991	167998	100 %	0 %	0 %	0 %	384450259
3540	NC_017287	TGA	2	6	168113	168118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450259
3541	NC_017287	GGGGA	2	10	168122	168131	20 %	0 %	80 %	0 %	384450259
3542	NC_017287	TTC	2	6	168133	168138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450259
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3544	NC_017287	T	6	6	168314	168319	0 %	100 %	0 %	0 %	384450259
3545	NC_017287	T	6	6	168353	168358	0 %	100 %	0 %	0 %	384450259
3546	NC_017287	GAAG	2	8	168386	168393	50 %	0 %	50 %	0 %	384450259
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3548	NC_017287	A	6	6	168440	168445	100 %	0 %	0 %	0 %	384450259
3549	NC_017287	TG	3	6	168599	168604	0 %	50 %	50 %	0 %	384450259
3550	NC_017287	GAA	2	6	168638	168643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017287	GTT	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450260
3552	NC_017287	T	7	7	168683	168689	0 %	100 %	0 %	0 %	384450260
3553	NC_017287	TGA	2	6	168730	168735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450260
3554	NC_017287	AGA	2	6	168840	168845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450260
3555	NC_017287	T	7	7	168847	168853	0 %	100 %	0 %	0 %	384450260
3556	NC_017287	CTG	2	6	168854	168859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450260
3557	NC_017287	CTTT	2	8	168934	168941	0 %	75 %	0 %	25 %	384450260
3558	NC_017287	T	9	9	168939	168947	0 %	100 %	0 %	0 %	384450260
3559	NC_017287	A	8	8	169010	169017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017287	TTA	2	6	169030	169035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017287	A	6	6	169044	169049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017287	A	6	6	169055	169060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017287	TTTTC	2	10	169171	169180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_017287	TAA	2	6	169181	169186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017287	TTG	2	6	169238	169243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450261
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3571	NC_017287	A	6	6	169498	169503	100 %	0 %	0 %	0 %	384450261
3572	NC_017287	ACA	2	6	169518	169523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450261
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3575	NC_017287	AG	3	6	169640	169645	50 %	0 %	50 %	0 %	384450261
3576	NC_017287	CTGTT	2	10	169650	169659	0 %	60 %	20 %	20 %	384450261
3577	NC_017287	AATGA	2	10	169685	169694	60 %	20 %	20 %	0 %	384450261
3578	NC_017287	TTG	2	6	169713	169718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450261
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3581	NC_017287	TAA	2	6	169892	169897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450261
3582	NC_017287	GTT	2	6	169929	169934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017287	TAGT	2	8	169994	170001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3585	NC_017287	TAC	2	6	170104	170109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450262
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3588	NC_017287	TTCC	2	8	170306	170313	0 %	50 %	0 %	50 %	384450262
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3591	NC_017287	AGT	2	6	170373	170378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450262
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3595	NC_017287	TAT	2	6	170668	170673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450262
3596	NC_017287	TCT	2	6	170677	170682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450262
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3598	NC_017287	GGC	2	6	170779	170784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450263
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3601	NC_017287	GAT	2	6	170913	170918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450263
3602	NC_017287	TC	3	6	170927	170932	0 %	50 %	0 %	50 %	384450263
3603	NC_017287	AAG	2	6	171002	171007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450263
3604	NC_017287	CTT	2	6	171041	171046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450263
3605	NC_017287	GAT	2	6	171065	171070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450263
3606	NC_017287	ATA	2	6	171078	171083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450263
3607	NC_017287	AAC	2	6	171189	171194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450263
3608	NC_017287	T	8	8	171236	171243	0 %	100 %	0 %	0 %	384450263
3609	NC_017287	AGA	2	6	171333	171338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450263
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3611	NC_017287	GA	3	6	171400	171405	50 %	0 %	50 %	0 %	384450263
3612	NC_017287	TCT	2	6	171501	171506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450264
3613	NC_017287	ATC	2	6	171584	171589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450264
3614	NC_017287	TC	3	6	171602	171607	0 %	50 %	0 %	50 %	384450264
3615	NC_017287	GTT	2	6	171712	171717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450264
3616	NC_017287	TGT	2	6	171770	171775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450264
3617	NC_017287	GATA	2	8	171799	171806	50 %	25 %	25 %	0 %	384450264
3618	NC_017287	TTG	2	6	171851	171856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450264
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3622	NC_017287	ACA	2	6	172125	172130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450265
3623	NC_017287	AGG	2	6	172137	172142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450265
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