MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017287	AGAAA	2	10	143256	143265	80 %	0 %	20 %	0 %	384450236
3002	NC_017287	ATT	2	6	143268	143273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450236
3003	NC_017287	TAC	2	6	143286	143291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450236
3004	NC_017287	TGA	2	6	143430	143435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450236
3005	NC_017287	TAC	2	6	143465	143470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450236
3006	NC_017287	CAG	2	6	143474	143479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450236
3007	NC_017287	TTG	3	9	143534	143542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450236
3008	NC_017287	TA	3	6	143597	143602	50 %	50 %	0 %	0 %	384450236
3009	NC_017287	ATG	2	6	143705	143710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450236
3010	NC_017287	TAT	2	6	143724	143729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450236
3011	NC_017287	ATT	2	6	143776	143781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450236
3012	NC_017287	TAG	2	6	143813	143818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450236
3013	NC_017287	TTC	2	6	143819	143824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450236
3014	NC_017287	GTG	2	6	143825	143830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450236
3015	NC_017287	AGA	2	6	143831	143836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450236
3016	NC_017287	TTG	2	6	143842	143847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450236
3017	NC_017287	TTA	2	6	143941	143946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450237
3018	NC_017287	AAT	2	6	143978	143983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450237
3019	NC_017287	GAG	2	6	144007	144012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450237
3020	NC_017287	TCTA	2	8	144050	144057	25 %	50 %	0 %	25 %	384450237
3021	NC_017287	T	6	6	144143	144148	0 %	100 %	0 %	0 %	384450237
3022	NC_017287	TTG	2	6	144178	144183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450237
3023	NC_017287	ATA	2	6	144343	144348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450237
3024	NC_017287	CAG	2	6	144351	144356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450237
3025	NC_017287	TAG	2	6	144361	144366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450237
3026	NC_017287	ATCA	2	8	144401	144408	50 %	25 %	0 %	25 %	384450237
3027	NC_017287	CAA	2	6	144541	144546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450237
3028	NC_017287	TGT	2	6	144573	144578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450237
3029	NC_017287	AT	3	6	144677	144682	50 %	50 %	0 %	0 %	384450237
3030	NC_017287	T	6	6	144734	144739	0 %	100 %	0 %	0 %	384450237
3031	NC_017287	AAT	2	6	144753	144758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450237
3032	NC_017287	TGAA	2	8	144765	144772	50 %	25 %	25 %	0 %	384450237
3033	NC_017287	GGAA	3	12	144773	144784	50 %	0 %	50 %	0 %	384450237
3034	NC_017287	TCC	2	6	144785	144790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450237
3035	NC_017287	AGTA	2	8	144806	144813	50 %	25 %	25 %	0 %	384450237
3036	NC_017287	A	7	7	144822	144828	100 %	0 %	0 %	0 %	384450237
3037	NC_017287	TAT	2	6	144899	144904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017287	TAA	2	6	144906	144911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017287	AAT	2	6	144992	144997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450238
3040	NC_017287	A	7	7	145025	145031	100 %	0 %	0 %	0 %	384450238
3041	NC_017287	TAT	2	6	145089	145094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450238
3042	NC_017287	T	7	7	145126	145132	0 %	100 %	0 %	0 %	384450238
3043	NC_017287	T	7	7	145177	145183	0 %	100 %	0 %	0 %	384450238
3044	NC_017287	TGTC	2	8	145195	145202	0 %	50 %	25 %	25 %	384450238
3045	NC_017287	TTG	2	6	145203	145208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450238
3046	NC_017287	T	7	7	145240	145246	0 %	100 %	0 %	0 %	384450238
3047	NC_017287	TTTA	2	8	145285	145292	25 %	75 %	0 %	0 %	384450238
3048	NC_017287	TTG	2	6	145308	145313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450238
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3050	NC_017287	TTC	2	6	145404	145409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450238
3051	NC_017287	TGTTTT	2	12	145439	145450	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384450238
3052	NC_017287	ACT	2	6	145458	145463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450238
3053	NC_017287	TTA	2	6	145481	145486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450238
3054	NC_017287	CT	4	8	145575	145582	0 %	50 %	0 %	50 %	384450238
3055	NC_017287	TCC	2	6	145636	145641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450238
3056	NC_017287	T	6	6	145673	145678	0 %	100 %	0 %	0 %	384450238
3057	NC_017287	AGA	2	6	145699	145704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450238
3058	NC_017287	GAT	2	6	145813	145818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450238
3059	NC_017287	TA	3	6	145906	145911	50 %	50 %	0 %	0 %	384450238
3060	NC_017287	AAAGA	2	10	145921	145930	80 %	0 %	20 %	0 %	384450238
3061	NC_017287	AAG	2	6	145937	145942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450238
3062	NC_017287	ATA	2	6	145977	145982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450238
3063	NC_017287	TTAT	2	8	146003	146010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017287	TTAT	2	8	146038	146045	25 %	75 %	0 %	0 %	384450239
3065	NC_017287	GTAA	2	8	146059	146066	50 %	25 %	25 %	0 %	384450239
3066	NC_017287	CCT	2	6	146222	146227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450239
3067	NC_017287	TATT	2	8	146243	146250	25 %	75 %	0 %	0 %	384450239
3068	NC_017287	CTTT	2	8	146296	146303	0 %	75 %	0 %	25 %	384450239
3069	NC_017287	CTT	2	6	146323	146328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450239
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3075	NC_017287	GGT	2	6	146594	146599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450241
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3077	NC_017287	TCT	2	6	146690	146695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017287	AAG	2	6	146715	146720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017287	T	6	6	146725	146730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017287	TCA	2	6	146775	146780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017287	ATAGGC	2	12	146841	146852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3082	NC_017287	GAA	2	6	146919	146924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017287	CTG	2	6	146978	146983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017287	T	6	6	147001	147006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017287	TCT	2	6	147024	147029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017287	CTC	2	6	147067	147072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_017287	GAG	2	6	147102	147107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017287	T	6	6	147111	147116	0 %	100 %	0 %	0 %	384450242
3089	NC_017287	AT	3	6	147122	147127	50 %	50 %	0 %	0 %	384450242
3090	NC_017287	A	6	6	147147	147152	100 %	0 %	0 %	0 %	384450242
3091	NC_017287	TTG	2	6	147168	147173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450242
3092	NC_017287	TGA	2	6	147209	147214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450242
3093	NC_017287	TAC	2	6	147291	147296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450242
3094	NC_017287	TTTA	2	8	147333	147340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017287	AATA	2	8	147388	147395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017287	AGT	2	6	147405	147410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017287	ATTT	3	12	147446	147457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017287	T	6	6	147502	147507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017287	ATT	2	6	147516	147521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017287	T	6	6	147526	147531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017287	T	7	7	147610	147616	0 %	100 %	0 %	0 %	384450243
3102	NC_017287	ACA	2	6	147626	147631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450243
3103	NC_017287	A	6	6	147647	147652	100 %	0 %	0 %	0 %	384450243
3104	NC_017287	CTT	2	6	147665	147670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450243
3105	NC_017287	CTT	2	6	147675	147680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450243
3106	NC_017287	TGA	2	6	147709	147714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450243
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3108	NC_017287	AAG	2	6	147768	147773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450243
3109	NC_017287	CAT	3	9	147791	147799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450243
3110	NC_017287	TGA	2	6	147818	147823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017287	G	6	6	147828	147833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017287	C	6	6	147834	147839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3113	NC_017287	CAT	2	6	147856	147861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017287	TTCCGT	2	12	147936	147947	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017287	T	6	6	147989	147994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017287	TTTTA	2	10	148100	148109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017287	T	6	6	148112	148117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017287	ATT	2	6	148173	148178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017287	TAA	2	6	148183	148188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017287	AGA	2	6	148189	148194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017287	T	6	6	148261	148266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017287	GAA	2	6	148323	148328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017287	CAC	2	6	148382	148387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_017287	CAA	2	6	148473	148478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017287	TAAG	2	8	148513	148520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017287	AAAG	2	8	148543	148550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_017287	GTT	2	6	148565	148570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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