MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017287	GTT	2	6	118983	118988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450211
2502	NC_017287	GAG	2	6	119066	119071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017287	TTTAC	2	10	119098	119107	20 %	60 %	0 %	20 %	384450212
2504	NC_017287	AGTC	2	8	119127	119134	25 %	25 %	25 %	25 %	384450212
2505	NC_017287	ATG	2	6	119138	119143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450212
2506	NC_017287	AG	4	8	119203	119210	50 %	0 %	50 %	0 %	384450212
2507	NC_017287	ATT	2	6	119276	119281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450212
2508	NC_017287	AGA	2	6	119335	119340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2509	NC_017287	ATC	2	6	119351	119356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450212
2510	NC_017287	TTA	2	6	119375	119380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450212
2511	NC_017287	ATT	2	6	119425	119430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450212
2512	NC_017287	TGG	2	6	119473	119478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450212
2513	NC_017287	AAG	2	6	119511	119516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2514	NC_017287	TAC	2	6	119614	119619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450212
2515	NC_017287	CGT	2	6	119686	119691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450212
2516	NC_017287	AGA	2	6	119710	119715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2517	NC_017287	AAG	2	6	119790	119795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2518	NC_017287	A	6	6	119844	119849	100 %	0 %	0 %	0 %	384450212
2519	NC_017287	GAA	2	6	119857	119862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2520	NC_017287	GAA	2	6	119873	119878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450212
2521	NC_017287	TTC	2	6	119913	119918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450212
2522	NC_017287	AGTT	2	8	119922	119929	25 %	50 %	25 %	0 %	384450212
2523	NC_017287	TTA	2	6	120012	120017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450212
2524	NC_017287	A	6	6	120156	120161	100 %	0 %	0 %	0 %	384450212
2525	NC_017287	AGAA	2	8	120229	120236	75 %	0 %	25 %	0 %	384450213
2526	NC_017287	CCA	2	6	120303	120308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450213
2527	NC_017287	AGAA	2	8	120309	120316	75 %	0 %	25 %	0 %	384450213
2528	NC_017287	ACT	2	6	120322	120327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450213
2529	NC_017287	CGT	2	6	120349	120354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450213
2530	NC_017287	GAT	2	6	120366	120371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450213
2531	NC_017287	AAG	2	6	120455	120460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450213
2532	NC_017287	GGT	2	6	120475	120480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450213
2533	NC_017287	TGG	2	6	120561	120566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450213
2534	NC_017287	TAT	2	6	120621	120626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450213
2535	NC_017287	T	8	8	120650	120657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_017287	ACT	2	6	120667	120672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_017287	TTC	2	6	120752	120757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450214
2538	NC_017287	CAG	2	6	120844	120849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450214
2539	NC_017287	TTG	2	6	120874	120879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450214
2540	NC_017287	A	6	6	120984	120989	100 %	0 %	0 %	0 %	384450214
2541	NC_017287	TAC	2	6	121136	121141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450214
2542	NC_017287	AGA	2	6	121190	121195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450214
2543	NC_017287	ACC	2	6	121206	121211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450214
2544	NC_017287	CGC	2	6	121217	121222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384450214
2545	NC_017287	CA	3	6	121229	121234	50 %	0 %	0 %	50 %	384450214
2546	NC_017287	A	7	7	121256	121262	100 %	0 %	0 %	0 %	384450214
2547	NC_017287	GAA	2	6	121446	121451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450214
2548	NC_017287	GTT	2	6	121461	121466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450214
2549	NC_017287	AAG	2	6	121468	121473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450214
2550	NC_017287	AAG	2	6	121516	121521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450214
2551	NC_017287	TCT	2	6	121527	121532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450214
2552	NC_017287	TTC	2	6	121553	121558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450214
2553	NC_017287	TTA	2	6	121659	121664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450214
2554	NC_017287	TAAA	2	8	121685	121692	75 %	25 %	0 %	0 %	384450214
2555	NC_017287	AGC	2	6	121783	121788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450215
2556	NC_017287	TGT	2	6	121805	121810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450215
2557	NC_017287	T	6	6	121847	121852	0 %	100 %	0 %	0 %	384450215
2558	NC_017287	CTG	2	6	121888	121893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450215
2559	NC_017287	AATTA	2	10	121991	122000	60 %	40 %	0 %	0 %	384450215
2560	NC_017287	AGC	2	6	122006	122011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450215
2561	NC_017287	GAA	2	6	122028	122033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2562	NC_017287	CTC	2	6	122062	122067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450215
2563	NC_017287	CTG	2	6	122077	122082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450215
2564	NC_017287	CTC	2	6	122089	122094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450215
2565	NC_017287	AGA	2	6	122146	122151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2566	NC_017287	A	7	7	122166	122172	100 %	0 %	0 %	0 %	384450215
2567	NC_017287	TAA	2	6	122174	122179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450215
2568	NC_017287	AGT	2	6	122192	122197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450215
2569	NC_017287	ATC	2	6	122201	122206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450215
2570	NC_017287	ATT	2	6	122214	122219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450215
2571	NC_017287	GAA	2	6	122232	122237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2572	NC_017287	GAA	2	6	122244	122249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2573	NC_017287	AAAT	2	8	122258	122265	75 %	25 %	0 %	0 %	384450215
2574	NC_017287	AGA	2	6	122275	122280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2575	NC_017287	ATT	2	6	122288	122293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450215
2576	NC_017287	CCT	2	6	122295	122300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450215
2577	NC_017287	AATT	2	8	122308	122315	50 %	50 %	0 %	0 %	384450215
2578	NC_017287	ATT	2	6	122442	122447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450215
2579	NC_017287	GAA	3	9	122454	122462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2580	NC_017287	CTT	2	6	122500	122505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450215
2581	NC_017287	AGA	2	6	122513	122518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450215
2582	NC_017287	TCT	2	6	122551	122556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_017287	AGT	2	6	122582	122587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_017287	T	6	6	122618	122623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_017287	ATTT	2	8	122667	122674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_017287	AAT	2	6	122679	122684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017287	ATT	2	6	122699	122704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017287	TGG	2	6	122712	122717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017287	CTTTT	2	10	122789	122798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2590	NC_017287	AAAG	2	8	122842	122849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017287	T	6	6	122858	122863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_017287	T	6	6	122876	122881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_017287	T	6	6	122929	122934	0 %	100 %	0 %	0 %	384450216
2594	NC_017287	TTTCTT	2	12	122947	122958	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384450216
2595	NC_017287	TAAT	2	8	123011	123018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017287	GCG	2	6	123037	123042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450217
2597	NC_017287	TTC	3	9	123100	123108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450217
2598	NC_017287	AT	3	6	123122	123127	50 %	50 %	0 %	0 %	384450217
2599	NC_017287	AAC	2	6	123231	123236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450217
2600	NC_017287	AGCA	2	8	123261	123268	50 %	0 %	25 %	25 %	384450217
2601	NC_017287	TCCT	2	8	123270	123277	0 %	50 %	0 %	50 %	384450217
2602	NC_017287	AGAA	2	8	123327	123334	75 %	0 %	25 %	0 %	384450217
2603	NC_017287	GAGAT	2	10	123345	123354	40 %	20 %	40 %	0 %	384450217
2604	NC_017287	ACA	2	6	123400	123405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450217
2605	NC_017287	CAA	2	6	123425	123430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450217
2606	NC_017287	TGA	2	6	123454	123459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450217
2607	NC_017287	CAA	2	6	123488	123493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450217
2608	NC_017287	AAG	2	6	123654	123659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450217
2609	NC_017287	TAC	2	6	123689	123694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450217
2610	NC_017287	AGA	3	9	123759	123767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450217
2611	NC_017287	TTG	2	6	123792	123797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450217
2612	NC_017287	TA	4	8	123968	123975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_017287	TTG	2	6	124106	124111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450218
2614	NC_017287	AGC	2	6	124112	124117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450218
2615	NC_017287	AGC	2	6	124190	124195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450218
2616	NC_017287	GAG	2	6	124307	124312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450218
2617	NC_017287	GCT	3	9	124324	124332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450218
2618	NC_017287	AG	3	6	124376	124381	50 %	0 %	50 %	0 %	384450218
2619	NC_017287	TGT	2	6	124383	124388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450218
2620	NC_017287	TGCATT	2	12	124488	124499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384450218
2621	NC_017287	GTG	2	6	124567	124572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450219
2622	NC_017287	CTTA	2	8	124575	124582	25 %	50 %	0 %	25 %	384450219
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2997	NC_017287	ATG	2	6	143134	143139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_017287	TG	3	6	143217	143222	0 %	50 %	50 %	0 %	384450236
2999	NC_017287	TCCT	2	8	143225	143232	0 %	50 %	0 %	50 %	384450236
3000	NC_017287	GTT	2	6	143246	143251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450236

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