MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017287	ATA	2	6	70616	70621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450153
1502	NC_017287	AGG	2	6	70739	70744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450153
1503	NC_017287	GAA	3	9	70786	70794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450153
1504	NC_017287	T	7	7	70818	70824	0 %	100 %	0 %	0 %	384450153
1505	NC_017287	GGATA	2	10	70859	70868	40 %	20 %	40 %	0 %	384450153
1506	NC_017287	TTC	2	6	70929	70934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450153
1507	NC_017287	T	7	7	70984	70990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017287	A	7	7	71034	71040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017287	CACTT	2	10	71042	71051	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_017287	ATA	2	6	71150	71155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017287	AAT	2	6	71203	71208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450154
1512	NC_017287	ACA	2	6	71223	71228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450154
1513	NC_017287	TCG	2	6	71251	71256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450154
1514	NC_017287	TGT	2	6	71326	71331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450154
1515	NC_017287	TAT	2	6	71363	71368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450154
1516	NC_017287	TGT	2	6	71431	71436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450154
1517	NC_017287	TCA	2	6	71544	71549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450154
1518	NC_017287	A	6	6	71594	71599	100 %	0 %	0 %	0 %	384450154
1519	NC_017287	T	6	6	71628	71633	0 %	100 %	0 %	0 %	384450154
1520	NC_017287	A	6	6	71652	71657	100 %	0 %	0 %	0 %	384450154
1521	NC_017287	GA	3	6	71670	71675	50 %	0 %	50 %	0 %	384450154
1522	NC_017287	ATC	2	6	71747	71752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450154
1523	NC_017287	AAG	2	6	71784	71789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450154
1524	NC_017287	TGT	2	6	71799	71804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450154
1525	NC_017287	AAC	2	6	71818	71823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450154
1526	NC_017287	GT	3	6	71946	71951	0 %	50 %	50 %	0 %	384450154
1527	NC_017287	GAA	2	6	71969	71974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450154
1528	NC_017287	AGA	2	6	71989	71994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450154
1529	NC_017287	GAA	2	6	72004	72009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450154
1530	NC_017287	T	6	6	72035	72040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017287	ATGT	2	8	72067	72074	25 %	50 %	25 %	0 %	384450155
1532	NC_017287	TGTT	2	8	72086	72093	0 %	75 %	25 %	0 %	384450155
1533	NC_017287	T	6	6	72118	72123	0 %	100 %	0 %	0 %	384450155
1534	NC_017287	AGA	2	6	72145	72150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450155
1535	NC_017287	T	7	7	72183	72189	0 %	100 %	0 %	0 %	384450155
1536	NC_017287	TGC	2	6	72214	72219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450155
1537	NC_017287	CAG	2	6	72251	72256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450155
1538	NC_017287	CAA	2	6	72313	72318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450155
1539	NC_017287	ATG	2	6	72333	72338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450155
1540	NC_017287	ACA	2	6	72363	72368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450155
1541	NC_017287	TCA	2	6	72477	72482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450155
1542	NC_017287	CCT	2	6	72543	72548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450155
1543	NC_017287	ATA	3	9	72563	72571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450155
1544	NC_017287	CAG	2	6	72580	72585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450155
1545	NC_017287	GAT	2	6	72649	72654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450155
1546	NC_017287	T	7	7	72749	72755	0 %	100 %	0 %	0 %	384450155
1547	NC_017287	ATAA	2	8	72799	72806	75 %	25 %	0 %	0 %	384450155
1548	NC_017287	AGC	2	6	72822	72827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450155
1549	NC_017287	TAGGGC	2	12	72833	72844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384450155
1550	NC_017287	CCTGAT	2	12	72858	72869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384450155
1551	NC_017287	T	8	8	72943	72950	0 %	100 %	0 %	0 %	384450155
1552	NC_017287	T	7	7	72980	72986	0 %	100 %	0 %	0 %	384450155
1553	NC_017287	TCAT	2	8	73011	73018	25 %	50 %	0 %	25 %	384450155
1554	NC_017287	GTA	2	6	73110	73115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450156
1555	NC_017287	GCA	2	6	73116	73121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450156
1556	NC_017287	CTGC	2	8	73273	73280	0 %	25 %	25 %	50 %	384450156
1557	NC_017287	ACG	2	6	73315	73320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450156
1558	NC_017287	TGT	2	6	73419	73424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450156
1559	NC_017287	GTAA	2	8	73456	73463	50 %	25 %	25 %	0 %	384450156
1560	NC_017287	AAT	2	6	73569	73574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450156
1561	NC_017287	T	6	6	73579	73584	0 %	100 %	0 %	0 %	384450156
1562	NC_017287	TAG	2	6	73592	73597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450156
1563	NC_017287	GT	3	6	73608	73613	0 %	50 %	50 %	0 %	384450156
1564	NC_017287	TTG	2	6	73632	73637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450156
1565	NC_017287	TAA	2	6	73794	73799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450156
1566	NC_017287	AAT	2	6	73848	73853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450156
1567	NC_017287	CAA	2	6	73895	73900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450156
1568	NC_017287	TTA	3	9	74002	74010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017287	ACAA	2	8	74161	74168	75 %	0 %	0 %	25 %	384450157
1570	NC_017287	A	6	6	74212	74217	100 %	0 %	0 %	0 %	384450157
1571	NC_017287	TTAT	2	8	74246	74253	25 %	75 %	0 %	0 %	384450157
1572	NC_017287	ATT	2	6	74282	74287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450157
1573	NC_017287	ATAGC	2	10	74298	74307	40 %	20 %	20 %	20 %	384450157
1574	NC_017287	T	6	6	74381	74386	0 %	100 %	0 %	0 %	384450157
1575	NC_017287	GGA	2	6	74471	74476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450157
1576	NC_017287	GA	3	6	74550	74555	50 %	0 %	50 %	0 %	384450157
1577	NC_017287	TTTA	2	8	74604	74611	25 %	75 %	0 %	0 %	384450157
1578	NC_017287	GAA	2	6	74690	74695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450157
1579	NC_017287	TGTTTC	2	12	74914	74925	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384450158
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1581	NC_017287	TAGT	2	8	75123	75130	25 %	50 %	25 %	0 %	384450158
1582	NC_017287	TC	3	6	75138	75143	0 %	50 %	0 %	50 %	384450158
1583	NC_017287	G	6	6	75151	75156	0 %	0 %	100 %	0 %	384450158
1584	NC_017287	TCT	2	6	75174	75179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450158
1585	NC_017287	TGC	2	6	75250	75255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450158
1586	NC_017287	TCG	2	6	75264	75269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450158
1587	NC_017287	ATT	3	9	75278	75286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450158
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1589	NC_017287	AGAA	2	8	75493	75500	75 %	0 %	25 %	0 %	384450158
1590	NC_017287	CTTA	2	8	75507	75514	25 %	50 %	0 %	25 %	384450158
1591	NC_017287	ATT	2	6	75518	75523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450158
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1593	NC_017287	TGG	2	6	75655	75660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450158
1594	NC_017287	CTG	2	6	75771	75776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450158
1595	NC_017287	CAA	2	6	75816	75821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450158
1596	NC_017287	ATT	2	6	75890	75895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450158
1597	NC_017287	CAG	2	6	75930	75935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450158
1598	NC_017287	TC	3	6	75943	75948	0 %	50 %	0 %	50 %	384450158
1599	NC_017287	ATC	2	6	75999	76004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_017287	A	7	7	76063	76069	100 %	0 %	0 %	0 %	384450159
1602	NC_017287	TGA	2	6	76121	76126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450159
1603	NC_017287	AATT	2	8	76154	76161	50 %	50 %	0 %	0 %	384450159
1604	NC_017287	GC	3	6	76175	76180	0 %	0 %	50 %	50 %	384450159
1605	NC_017287	GAA	2	6	76230	76235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450159
1606	NC_017287	TC	3	6	76242	76247	0 %	50 %	0 %	50 %	384450159
1607	NC_017287	TGT	2	6	76253	76258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450159
1608	NC_017287	CAT	2	6	76284	76289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450159
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1610	NC_017287	GTT	2	6	76361	76366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450159
1611	NC_017287	TCCA	2	8	76384	76391	25 %	25 %	0 %	50 %	384450159
1612	NC_017287	GAA	2	6	76395	76400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450159
1613	NC_017287	TGC	2	6	76424	76429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450159
1614	NC_017287	TCC	2	6	76437	76442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450159
1615	NC_017287	ATG	2	6	76462	76467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450159
1616	NC_017287	CA	3	6	76480	76485	50 %	0 %	0 %	50 %	384450159
1617	NC_017287	CGG	2	6	76534	76539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450159
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1620	NC_017287	CT	3	6	76668	76673	0 %	50 %	0 %	50 %	384450159
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1622	NC_017287	GAA	2	6	76758	76763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450159
1623	NC_017287	CG	3	6	76778	76783	0 %	0 %	50 %	50 %	384450159
1624	NC_017287	AGC	2	6	76804	76809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450159
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1626	NC_017287	TCA	2	6	76974	76979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450159
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