MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017287	GGT	2	6	23068	23073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450111
502	NC_017287	AGC	2	6	23084	23089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450111
503	NC_017287	ATG	2	6	23174	23179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450111
504	NC_017287	AGC	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450111
505	NC_017287	GCT	2	6	23197	23202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450111
506	NC_017287	CTG	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450111
507	NC_017287	ATG	2	6	23489	23494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450111
508	NC_017287	TTA	2	6	23507	23512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450111
509	NC_017287	AAG	2	6	23564	23569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450111
510	NC_017287	GA	3	6	23578	23583	50 %	0 %	50 %	0 %	384450111
511	NC_017287	T	7	7	23711	23717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017287	A	6	6	23795	23800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017287	AGA	2	6	23810	23815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017287	TTG	2	6	23920	23925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
515	NC_017287	TGT	2	6	23957	23962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
516	NC_017287	AGT	2	6	23974	23979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450112
517	NC_017287	TTG	2	6	23986	23991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
518	NC_017287	TCC	2	6	24025	24030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450112
519	NC_017287	AGCT	2	8	24075	24082	25 %	25 %	25 %	25 %	384450112
520	NC_017287	TTG	2	6	24262	24267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
521	NC_017287	GAA	2	6	24272	24277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450112
522	NC_017287	T	6	6	24289	24294	0 %	100 %	0 %	0 %	384450112
523	NC_017287	AAAT	2	8	24412	24419	75 %	25 %	0 %	0 %	384450112
524	NC_017287	CTT	2	6	24426	24431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
525	NC_017287	AGG	2	6	24447	24452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450112
526	NC_017287	GTA	2	6	24460	24465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450112
527	NC_017287	GCA	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450112
528	NC_017287	TTA	2	6	24530	24535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
529	NC_017287	AATT	2	8	24537	24544	50 %	50 %	0 %	0 %	384450112
530	NC_017287	ATAA	2	8	24604	24611	75 %	25 %	0 %	0 %	384450112
531	NC_017287	T	8	8	24706	24713	0 %	100 %	0 %	0 %	384450112
532	NC_017287	TGT	2	6	24728	24733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
533	NC_017287	GCT	2	6	24758	24763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450112
534	NC_017287	TTCT	2	8	24835	24842	0 %	75 %	0 %	25 %	384450112
535	NC_017287	ATC	2	6	24850	24855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450112
536	NC_017287	ACC	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450112
537	NC_017287	TAGT	2	8	24893	24900	25 %	50 %	25 %	0 %	384450112
538	NC_017287	TTG	2	6	24918	24923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
539	NC_017287	TTG	2	6	24928	24933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
540	NC_017287	ATT	2	6	25021	25026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
541	NC_017287	TTC	2	6	25147	25152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
542	NC_017287	TTG	2	6	25297	25302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
543	NC_017287	GAAC	2	8	25352	25359	50 %	0 %	25 %	25 %	384450112
544	NC_017287	CAG	2	6	25377	25382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450112
545	NC_017287	TA	3	6	25412	25417	50 %	50 %	0 %	0 %	384450112
546	NC_017287	GCA	2	6	25418	25423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450112
547	NC_017287	GTT	2	6	25451	25456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
548	NC_017287	AG	3	6	25519	25524	50 %	0 %	50 %	0 %	384450112
549	NC_017287	TAA	2	6	25551	25556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450112
550	NC_017287	CTT	3	9	25557	25565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
551	NC_017287	TTA	2	6	25586	25591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
552	NC_017287	TTA	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
553	NC_017287	TAT	2	6	25698	25703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
554	NC_017287	TCA	2	6	25704	25709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450112
555	NC_017287	CCA	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450112
556	NC_017287	TGG	2	6	25731	25736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450112
557	NC_017287	A	6	6	25774	25779	100 %	0 %	0 %	0 %	384450112
558	NC_017287	ATTC	2	8	25791	25798	25 %	50 %	0 %	25 %	384450112
559	NC_017287	TTC	2	6	25804	25809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
560	NC_017287	TCT	2	6	25826	25831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450112
561	NC_017287	T	6	6	25903	25908	0 %	100 %	0 %	0 %	384450112
562	NC_017287	TTTC	2	8	25923	25930	0 %	75 %	0 %	25 %	384450112
563	NC_017287	ATT	2	6	25948	25953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450112
564	NC_017287	ATAG	2	8	26018	26025	50 %	25 %	25 %	0 %	384450112
565	NC_017287	AAT	2	6	26026	26031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450112
566	NC_017287	TGT	2	6	26119	26124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450112
567	NC_017287	AGG	2	6	26203	26208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450112
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569	NC_017287	TAAA	2	8	26382	26389	75 %	25 %	0 %	0 %	384450112
570	NC_017287	TA	3	6	26422	26427	50 %	50 %	0 %	0 %	384450112
571	NC_017287	AGA	2	6	26431	26436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450112
572	NC_017287	ATT	2	6	26444	26449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017287	T	7	7	26487	26493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017287	TTC	2	6	26523	26528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017287	ATTT	2	8	26564	26571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017287	ATTA	2	8	26575	26582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017287	TTA	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
578	NC_017287	A	6	6	26681	26686	100 %	0 %	0 %	0 %	384450113
579	NC_017287	CCA	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450113
580	NC_017287	TTA	2	6	26732	26737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
581	NC_017287	CAA	2	6	26810	26815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
582	NC_017287	TGA	2	6	26818	26823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
583	NC_017287	AGA	2	6	26866	26871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
584	NC_017287	TAA	2	6	26881	26886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450113
585	NC_017287	CTG	2	6	26964	26969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
586	NC_017287	GTA	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
587	NC_017287	ACA	2	6	27022	27027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
588	NC_017287	TTA	2	6	27041	27046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450113
589	NC_017287	A	6	6	27056	27061	100 %	0 %	0 %	0 %	384450113
590	NC_017287	CTGG	2	8	27095	27102	0 %	25 %	50 %	25 %	384450113
591	NC_017287	AAG	2	6	27183	27188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
592	NC_017287	AGC	2	6	27199	27204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
593	NC_017287	TA	3	6	27282	27287	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
594	NC_017287	TCT	2	6	27323	27328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450113
595	NC_017287	GGT	2	6	27338	27343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450113
596	NC_017287	TC	3	6	27367	27372	0 %	50 %	0 %	50 %	384450113
597	NC_017287	AGA	3	9	27472	27480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
598	NC_017287	ACA	2	6	27502	27507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
599	NC_017287	GCT	2	6	27677	27682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
600	NC_017287	GTT	2	6	27701	27706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450113
601	NC_017287	CAG	2	6	27826	27831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
602	NC_017287	CGC	2	6	27832	27837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384450113
603	NC_017287	AATT	2	8	27868	27875	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
604	NC_017287	TGA	2	6	27883	27888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
605	NC_017287	AAC	2	6	27900	27905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
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607	NC_017287	TA	3	6	27959	27964	50 %	50 %	0 %	0 %	384450113
608	NC_017287	TTG	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450113
609	NC_017287	CTA	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450113
610	NC_017287	ACA	2	6	28013	28018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
611	NC_017287	AAG	2	6	28050	28055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
612	NC_017287	GAC	2	6	28105	28110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
613	NC_017287	AAG	2	6	28170	28175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
614	NC_017287	CAA	2	6	28196	28201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450113
615	NC_017287	GCA	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
616	NC_017287	T	6	6	28525	28530	0 %	100 %	0 %	0 %	384450113
617	NC_017287	TGC	2	6	28618	28623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
618	NC_017287	CAG	2	6	28655	28660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
619	NC_017287	CTG	2	6	28662	28667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450113
620	NC_017287	AAAT	2	8	28717	28724	75 %	25 %	0 %	0 %	384450113
621	NC_017287	AGC	2	6	28744	28749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450113
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624	NC_017287	TAAGTG	2	12	28935	28946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450113
625	NC_017287	GAA	2	6	28985	28990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
626	NC_017287	GGCA	2	8	28995	29002	25 %	0 %	50 %	25 %	384450113
627	NC_017287	AGA	2	6	29017	29022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450113
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