MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017285	ACG	2	6	188169	188174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4003	NC_017285	TAG	2	6	188214	188219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449177
4004	NC_017285	TTC	2	6	188398	188403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449177
4005	NC_017285	T	6	6	188415	188420	0 %	100 %	0 %	0 %	384449177
4006	NC_017285	TCC	2	6	188456	188461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449177
4007	NC_017285	ACG	2	6	188508	188513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4008	NC_017285	TGCA	2	8	188575	188582	25 %	25 %	25 %	25 %	384449177
4009	NC_017285	ATT	2	6	188641	188646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449177
4010	NC_017285	T	6	6	188645	188650	0 %	100 %	0 %	0 %	384449177
4011	NC_017285	AAC	2	6	188739	188744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449177
4012	NC_017285	CAAAA	2	10	188775	188784	80 %	0 %	0 %	20 %	384449177
4013	NC_017285	CT	3	6	188786	188791	0 %	50 %	0 %	50 %	384449177
4014	NC_017285	AGA	2	6	188812	188817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449177
4015	NC_017285	ACG	2	6	188823	188828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4016	NC_017285	ATGG	2	8	188842	188849	25 %	25 %	50 %	0 %	384449177
4017	NC_017285	ATT	2	6	188870	188875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449177
4018	NC_017285	GTC	2	6	188988	188993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4019	NC_017285	AGGG	2	8	189120	189127	25 %	0 %	75 %	0 %	384449177
4020	NC_017285	GCA	2	6	189247	189252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4021	NC_017285	AAATC	2	10	189346	189355	60 %	20 %	0 %	20 %	384449177
4022	NC_017285	GAA	2	6	189358	189363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449177
4023	NC_017285	TAC	2	6	189519	189524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449177
4024	NC_017285	TGG	2	6	189544	189549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449177
4025	NC_017285	GCT	2	6	189556	189561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449177
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4027	NC_017285	ATC	2	6	189576	189581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449177
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4029	NC_017285	TAAA	2	8	189645	189652	75 %	25 %	0 %	0 %	384449177
4030	NC_017285	TCT	2	6	189716	189721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449177
4031	NC_017285	TCT	2	6	189788	189793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449177
4032	NC_017285	CTCAAG	2	12	189849	189860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384449177
4033	NC_017285	GAA	2	6	189875	189880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449177
4034	NC_017285	TAA	2	6	189907	189912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449177
4035	NC_017285	TC	3	6	189978	189983	0 %	50 %	0 %	50 %	384449177
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4037	NC_017285	TGC	2	6	190138	190143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449177
4038	NC_017285	AG	3	6	190219	190224	50 %	0 %	50 %	0 %	384449177
4039	NC_017285	CA	3	6	190229	190234	50 %	0 %	0 %	50 %	384449177
4040	NC_017285	AGG	2	6	190254	190259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449177
4041	NC_017285	CAG	2	6	190339	190344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
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4043	NC_017285	A	6	6	190499	190504	100 %	0 %	0 %	0 %	384449177
4044	NC_017285	TGA	2	6	190560	190565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449177
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4050	NC_017285	CATTGA	2	12	190893	190904	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384449177
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4052	NC_017285	ATG	2	6	191000	191005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449177
4053	NC_017285	GGA	2	6	191039	191044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449177
4054	NC_017285	A	6	6	191048	191053	100 %	0 %	0 %	0 %	384449177
4055	NC_017285	AGG	2	6	191143	191148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449177
4056	NC_017285	CCTTTA	2	12	191154	191165	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384449177
4057	NC_017285	TCTT	2	8	191239	191246	0 %	75 %	0 %	25 %	384449177
4058	NC_017285	CT	3	6	191342	191347	0 %	50 %	0 %	50 %	384449177
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4061	NC_017285	AGC	2	6	191459	191464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449177
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4063	NC_017285	CCA	2	6	191493	191498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449177
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4065	NC_017285	GAA	2	6	191641	191646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449177
4066	NC_017285	ATG	2	6	191784	191789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449177
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4085	NC_017285	A	6	6	192931	192936	100 %	0 %	0 %	0 %	384449178
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4092	NC_017285	TAT	2	6	193217	193222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449178
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4101	NC_017285	AC	3	6	193471	193476	50 %	0 %	0 %	50 %	384449178
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4105	NC_017285	AC	3	6	193753	193758	50 %	0 %	0 %	50 %	384449178
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4108	NC_017285	ATA	2	6	193916	193921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017285	AATG	2	8	193922	193929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_017285	CTAT	2	8	193955	193962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4113	NC_017285	ATAA	2	8	194009	194016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017285	AAT	2	6	194043	194048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017285	TAC	2	6	194069	194074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4122	NC_017285	TCT	2	6	194282	194287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449179
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4493	NC_017285	AAGC	2	8	210937	210944	50 %	0 %	25 %	25 %	384449195
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