MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017285	GATT	2	8	140655	140662	25 %	50 %	25 %	0 %	384449129
3002	NC_017285	CCA	2	6	140669	140674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449129
3003	NC_017285	AAT	2	6	140726	140731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449129
3004	NC_017285	GAA	2	6	140774	140779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449129
3005	NC_017285	GTT	2	6	140813	140818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449129
3006	NC_017285	AAC	2	6	140835	140840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449129
3007	NC_017285	CGT	2	6	140885	140890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449129
3008	NC_017285	ATG	2	6	140907	140912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449129
3009	NC_017285	TGC	2	6	141040	141045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449129
3010	NC_017285	GAA	2	6	141131	141136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449129
3011	NC_017285	GAA	2	6	141189	141194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449129
3012	NC_017285	TTAA	2	8	141212	141219	50 %	50 %	0 %	0 %	384449129
3013	NC_017285	AGA	2	6	141235	141240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449129
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3015	NC_017285	ATC	2	6	141249	141254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449129
3016	NC_017285	GAA	2	6	141343	141348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449129
3017	NC_017285	TTG	2	6	141371	141376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449129
3018	NC_017285	TAGG	2	8	141417	141424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017285	AAT	2	6	141476	141481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449130
3020	NC_017285	TC	3	6	141490	141495	0 %	50 %	0 %	50 %	384449130
3021	NC_017285	TA	4	8	141496	141503	50 %	50 %	0 %	0 %	384449130
3022	NC_017285	AGT	2	6	141534	141539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449130
3023	NC_017285	AGG	2	6	141647	141652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449130
3024	NC_017285	T	6	6	141732	141737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017285	ATG	2	6	141772	141777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449131
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3029	NC_017285	TCTCC	2	10	141908	141917	0 %	40 %	0 %	60 %	384449131
3030	NC_017285	TTC	2	6	141923	141928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449131
3031	NC_017285	TAG	2	6	141972	141977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449131
3032	NC_017285	ATA	2	6	142037	142042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449131
3033	NC_017285	GAAG	2	8	142058	142065	50 %	0 %	50 %	0 %	384449131
3034	NC_017285	TCA	2	6	142139	142144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449131
3035	NC_017285	CAG	2	6	142181	142186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449131
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3038	NC_017285	CAAA	2	8	142367	142374	75 %	0 %	0 %	25 %	384449131
3039	NC_017285	TATT	2	8	142416	142423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017285	ATT	2	6	142436	142441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017285	ATTT	2	8	142449	142456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017285	TGT	2	6	142461	142466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017285	AAATT	2	10	142495	142504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017285	TG	3	6	142601	142606	0 %	50 %	50 %	0 %	384449132
3045	NC_017285	GAGGG	2	10	142607	142616	20 %	0 %	80 %	0 %	384449132
3046	NC_017285	CTAA	2	8	142633	142640	50 %	25 %	0 %	25 %	384449132
3047	NC_017285	GGA	2	6	142669	142674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449132
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3055	NC_017285	TCT	2	6	143146	143151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449132
3056	NC_017285	GTTT	2	8	143234	143241	0 %	75 %	25 %	0 %	384449132
3057	NC_017285	AAG	4	12	143252	143263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449132
3058	NC_017285	TTA	2	6	143367	143372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449132
3059	NC_017285	ATG	2	6	143432	143437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449132
3060	NC_017285	ATC	3	9	143462	143470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449132
3061	NC_017285	TAT	2	6	143513	143518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449132
3062	NC_017285	GTA	2	6	143573	143578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449132
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3064	NC_017285	TTG	2	6	143706	143711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449132
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3066	NC_017285	GA	3	6	143787	143792	50 %	0 %	50 %	0 %	384449132
3067	NC_017285	GCAC	2	8	143816	143823	25 %	0 %	25 %	50 %	384449132
3068	NC_017285	TCT	2	6	143840	143845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449132
3069	NC_017285	A	6	6	144022	144027	100 %	0 %	0 %	0 %	384449133
3070	NC_017285	GGATA	2	10	144052	144061	40 %	20 %	40 %	0 %	384449133
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3080	NC_017285	TGC	2	6	144470	144475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449133
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3083	NC_017285	C	6	6	144518	144523	0 %	0 %	0 %	100 %	384449133
3084	NC_017285	CAG	2	6	144527	144532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449133
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3090	NC_017285	GCT	2	6	144899	144904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449134
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3092	NC_017285	AAC	2	6	144975	144980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449134
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3095	NC_017285	ATCTA	2	10	145053	145062	40 %	40 %	0 %	20 %	384449134
3096	NC_017285	TA	3	6	145061	145066	50 %	50 %	0 %	0 %	384449134
3097	NC_017285	TCC	2	6	145069	145074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449134
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3099	NC_017285	GAA	3	9	145212	145220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449134
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3101	NC_017285	T	7	7	145333	145339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017285	T	6	6	145351	145356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017285	CTT	2	6	145378	145383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017285	GC	3	6	145401	145406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_017285	ATG	2	6	145432	145437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017285	T	6	6	145501	145506	0 %	100 %	0 %	0 %	384449135
3107	NC_017285	AATATT	2	12	145679	145690	50 %	50 %	0 %	0 %	384449135
3108	NC_017285	GAT	2	6	145727	145732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449135
3109	NC_017285	GTCCT	2	10	145821	145830	0 %	40 %	20 %	40 %	384449135
3110	NC_017285	GTC	2	6	145832	145837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449135
3111	NC_017285	GTC	2	6	145878	145883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449135
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3116	NC_017285	T	6	6	146247	146252	0 %	100 %	0 %	0 %	384449136
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3120	NC_017285	CAA	2	6	146450	146455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449136
3121	NC_017285	TTGC	2	8	146604	146611	0 %	50 %	25 %	25 %	384449136
3122	NC_017285	GA	3	6	146627	146632	50 %	0 %	50 %	0 %	384449136
3123	NC_017285	AAG	2	6	146665	146670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449136
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3499	NC_017285	TAA	2	6	164674	164679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449153
3500	NC_017285	CTT	2	6	164716	164721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449153

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