MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_017285	TAC	2	6	1221670	1221675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450066
25503	NC_017285	TCT	2	6	1221717	1221722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450066
25504	NC_017285	TCG	2	6	1221805	1221810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450066
25505	NC_017285	A	7	7	1221826	1221832	100 %	0 %	0 %	0 %	384450066
25506	NC_017285	TC	3	6	1221939	1221944	0 %	50 %	0 %	50 %	384450067
25507	NC_017285	GAA	2	6	1221946	1221951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450067
25508	NC_017285	TTCG	2	8	1221985	1221992	0 %	50 %	25 %	25 %	384450067
25509	NC_017285	AG	3	6	1222005	1222010	50 %	0 %	50 %	0 %	384450067
25510	NC_017285	CGT	2	6	1222011	1222016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450067
25511	NC_017285	TC	3	6	1222017	1222022	0 %	50 %	0 %	50 %	384450067
25512	NC_017285	AAG	2	6	1222055	1222060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450067
25513	NC_017285	GATC	2	8	1222104	1222111	25 %	25 %	25 %	25 %	384450067
25514	NC_017285	AAAC	2	8	1222189	1222196	75 %	0 %	0 %	25 %	384450067
25515	NC_017285	GCCTT	2	10	1222238	1222247	0 %	40 %	20 %	40 %	384450067
25516	NC_017285	CAG	2	6	1222252	1222257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450067
25517	NC_017285	ATCCCT	2	12	1222310	1222321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384450067
25518	NC_017285	CATCGG	2	12	1222332	1222343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384450067
25519	NC_017285	A	6	6	1222355	1222360	100 %	0 %	0 %	0 %	384450067
25520	NC_017285	AAG	3	9	1222424	1222432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_017285	T	6	6	1222442	1222447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_017285	T	6	6	1222495	1222500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_017285	AG	3	6	1222637	1222642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25524	NC_017285	CAT	2	6	1222665	1222670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25525	NC_017285	TC	3	6	1222692	1222697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25526	NC_017285	AACT	2	8	1222698	1222705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25527	NC_017285	GAA	2	6	1222710	1222715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25528	NC_017285	TC	3	6	1222726	1222731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25529	NC_017285	A	6	6	1222808	1222813	100 %	0 %	0 %	0 %	384450068
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25534	NC_017285	A	6	6	1223044	1223049	100 %	0 %	0 %	0 %	384450068
25535	NC_017285	TGC	2	6	1223060	1223065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450068
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25537	NC_017285	GAT	2	6	1223127	1223132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450068
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25539	NC_017285	GCT	2	6	1223232	1223237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450068
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25542	NC_017285	ACT	2	6	1223415	1223420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450068
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25551	NC_017285	G	6	6	1223933	1223938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_017285	T	6	6	1223965	1223970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25553	NC_017285	TAA	2	6	1223975	1223980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_017285	TAC	2	6	1224008	1224013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450069
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25558	NC_017285	TTTC	2	8	1224138	1224145	0 %	75 %	0 %	25 %	384450069
25559	NC_017285	CTT	2	6	1224171	1224176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450069
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25589	NC_017285	T	6	6	1225526	1225531	0 %	100 %	0 %	0 %	384450071
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25604	NC_017285	TAGA	2	8	1226030	1226037	50 %	25 %	25 %	0 %	384450072
25605	NC_017285	CAT	2	6	1226411	1226416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450072
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25609	NC_017285	CTTTA	2	10	1226580	1226589	20 %	60 %	0 %	20 %	384450072
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25615	NC_017285	CAA	2	6	1226932	1226937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450072
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.