MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017285	CAA	2	6	47886	47891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449029
1002	NC_017285	TTG	2	6	47901	47906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449029
1003	NC_017285	ACA	2	6	47916	47921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449029
1004	NC_017285	GAA	3	9	47979	47987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1005	NC_017285	CAA	2	6	47996	48001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449029
1006	NC_017285	AAG	2	6	48007	48012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1007	NC_017285	TGCT	2	8	48016	48023	0 %	50 %	25 %	25 %	384449029
1008	NC_017285	AGA	3	9	48074	48082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1009	NC_017285	AGA	2	6	48101	48106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1010	NC_017285	AAG	2	6	48115	48120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1011	NC_017285	AGA	2	6	48128	48133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1012	NC_017285	GAA	2	6	48144	48149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449029
1013	NC_017285	GCT	2	6	48173	48178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449029
1014	NC_017285	A	9	9	48195	48203	100 %	0 %	0 %	0 %	384449029
1015	NC_017285	CAG	2	6	48244	48249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449030
1016	NC_017285	TA	3	6	48256	48261	50 %	50 %	0 %	0 %	384449030
1017	NC_017285	GGAA	2	8	48341	48348	50 %	0 %	50 %	0 %	384449030
1018	NC_017285	AAC	2	6	48368	48373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449030
1019	NC_017285	TGA	2	6	48416	48421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449030
1020	NC_017285	TGA	2	6	48437	48442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449030
1021	NC_017285	GCA	2	6	48537	48542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449030
1022	NC_017285	CAG	2	6	48550	48555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449030
1023	NC_017285	TGT	2	6	48560	48565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449030
1024	NC_017285	TAG	2	6	48587	48592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449030
1025	NC_017285	TTG	2	6	48718	48723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449030
1026	NC_017285	TTC	2	6	48842	48847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449030
1027	NC_017285	TCA	2	6	48869	48874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449030
1028	NC_017285	CTC	2	6	48943	48948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449030
1029	NC_017285	AGAGA	2	10	48978	48987	60 %	0 %	40 %	0 %	384449030
1030	NC_017285	CAAAAA	2	12	49008	49019	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384449030
1031	NC_017285	GAA	2	6	49053	49058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449030
1032	NC_017285	AGC	2	6	49088	49093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449031
1033	NC_017285	T	6	6	49130	49135	0 %	100 %	0 %	0 %	384449031
1034	NC_017285	GAG	2	6	49155	49160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449031
1035	NC_017285	TGC	2	6	49166	49171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449031
1036	NC_017285	AG	3	6	49209	49214	50 %	0 %	50 %	0 %	384449031
1037	NC_017285	CTG	2	6	49267	49272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449031
1038	NC_017285	TCT	2	6	49301	49306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449031
1039	NC_017285	TGT	2	6	49348	49353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449031
1040	NC_017285	AGA	3	9	49364	49372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449031
1041	NC_017285	TGA	2	6	49400	49405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449031
1042	NC_017285	ATT	3	9	49456	49464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449031
1043	NC_017285	ATT	2	6	49484	49489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449031
1044	NC_017285	A	6	6	49607	49612	100 %	0 %	0 %	0 %	384449031
1045	NC_017285	GTC	2	6	49621	49626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449031
1046	NC_017285	AGA	2	6	49637	49642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449031
1047	NC_017285	ATG	2	6	49681	49686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449031
1048	NC_017285	ATA	2	6	49699	49704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449031
1049	NC_017285	GCA	2	6	49715	49720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449031
1050	NC_017285	TC	3	6	49723	49728	0 %	50 %	0 %	50 %	384449031
1051	NC_017285	AAG	2	6	49762	49767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449031
1052	NC_017285	TCAT	2	8	49791	49798	25 %	50 %	0 %	25 %	384449031
1053	NC_017285	GAA	2	6	49833	49838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449031
1054	NC_017285	GCG	2	6	49840	49845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384449031
1055	NC_017285	T	6	6	49872	49877	0 %	100 %	0 %	0 %	384449031
1056	NC_017285	CTC	2	6	49898	49903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449031
1057	NC_017285	CTAAC	2	10	49930	49939	40 %	20 %	0 %	40 %	384449031
1058	NC_017285	CTC	2	6	49951	49956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449031
1059	NC_017285	CTCCC	2	10	49984	49993	0 %	20 %	0 %	80 %	384449031
1060	NC_017285	CAGT	2	8	50038	50045	25 %	25 %	25 %	25 %	384449031
1061	NC_017285	AAAG	2	8	50194	50201	75 %	0 %	25 %	0 %	384449031
1062	NC_017285	GTG	2	6	50221	50226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449032
1063	NC_017285	A	7	7	50271	50277	100 %	0 %	0 %	0 %	384449032
1064	NC_017285	A	6	6	50286	50291	100 %	0 %	0 %	0 %	384449032
1065	NC_017285	AAG	2	6	50294	50299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449032
1066	NC_017285	GTT	2	6	50304	50309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449032
1067	NC_017285	T	6	6	50353	50358	0 %	100 %	0 %	0 %	384449032
1068	NC_017285	TA	3	6	50499	50504	50 %	50 %	0 %	0 %	384449032
1069	NC_017285	AG	3	6	50520	50525	50 %	0 %	50 %	0 %	384449032
1070	NC_017285	TCA	2	6	50650	50655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449032
1071	NC_017285	CTC	2	6	50656	50661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449032
1072	NC_017285	AG	3	6	50716	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	384449032
1073	NC_017285	TTA	2	6	50747	50752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449032
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1075	NC_017285	CTTT	2	8	50847	50854	0 %	75 %	0 %	25 %	384449032
1076	NC_017285	TCTT	2	8	50863	50870	0 %	75 %	0 %	25 %	384449032
1077	NC_017285	TAA	2	6	50927	50932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449032
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1080	NC_017285	ATC	2	6	51115	51120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449032
1081	NC_017285	GGTTA	2	10	51187	51196	20 %	40 %	40 %	0 %	384449032
1082	NC_017285	TGT	2	6	51230	51235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449032
1083	NC_017285	CAA	2	6	51252	51257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449032
1084	NC_017285	TAGA	2	8	51277	51284	50 %	25 %	25 %	0 %	384449032
1085	NC_017285	GAAA	2	8	51368	51375	75 %	0 %	25 %	0 %	384449032
1086	NC_017285	CT	3	6	51384	51389	0 %	50 %	0 %	50 %	384449032
1087	NC_017285	CTT	2	6	51484	51489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449032
1088	NC_017285	TGA	2	6	51527	51532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449032
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1090	NC_017285	AG	3	6	51638	51643	50 %	0 %	50 %	0 %	384449032
1091	NC_017285	TGG	2	6	51650	51655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449032
1092	NC_017285	GTC	2	6	51664	51669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449032
1093	NC_017285	GAA	2	6	51744	51749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1094	NC_017285	A	8	8	51767	51774	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1095	NC_017285	A	8	8	51776	51783	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1096	NC_017285	T	8	8	51806	51813	0 %	100 %	0 %	0 %	384449033
1097	NC_017285	GCT	2	6	51899	51904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1098	NC_017285	CAG	2	6	51918	51923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1099	NC_017285	TCT	2	6	51987	51992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449033
1100	NC_017285	ACC	2	6	52061	52066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449033
1101	NC_017285	AG	3	6	52081	52086	50 %	0 %	50 %	0 %	384449033
1102	NC_017285	A	7	7	52087	52093	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1103	NC_017285	ACT	2	6	52112	52117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
1104	NC_017285	CTT	2	6	52141	52146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449033
1105	NC_017285	AAG	2	6	52155	52160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1106	NC_017285	GCC	2	6	52178	52183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384449033
1107	NC_017285	GAA	2	6	52217	52222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1108	NC_017285	A	7	7	52270	52276	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1109	NC_017285	GAA	2	6	52351	52356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1110	NC_017285	AGC	2	6	52399	52404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1111	NC_017285	AAC	2	6	52405	52410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449033
1112	NC_017285	GAA	3	9	52436	52444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1113	NC_017285	GTT	2	6	52540	52545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1114	NC_017285	GTAA	2	8	52553	52560	50 %	25 %	25 %	0 %	384449033
1115	NC_017285	GAAC	2	8	52569	52576	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
1116	NC_017285	TAC	2	6	52662	52667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
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1118	NC_017285	TATC	2	8	52720	52727	25 %	50 %	0 %	25 %	384449033
1119	NC_017285	AGT	2	6	52756	52761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1120	NC_017285	TGT	2	6	52795	52800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1121	NC_017285	GCA	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1122	NC_017285	ATT	2	6	52853	52858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449033
1123	NC_017285	ATG	2	6	52875	52880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1124	NC_017285	ATC	2	6	52916	52921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
1125	NC_017285	AGC	2	6	52963	52968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
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1127	NC_017285	GAAC	2	8	53109	53116	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
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