MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017285	AGA	2	6	284781	284786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449261
6003	NC_017285	GAA	2	6	284804	284809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449261
6004	NC_017285	GGA	2	6	284923	284928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449261
6005	NC_017285	GAA	2	6	284933	284938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449261
6006	NC_017285	GAG	2	6	284981	284986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449261
6007	NC_017285	CAA	2	6	284999	285004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449261
6008	NC_017285	GCCTTG	2	12	285021	285032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449261
6009	NC_017285	TCCT	2	8	285132	285139	0 %	50 %	0 %	50 %	384449261
6010	NC_017285	GTAAA	2	10	285315	285324	60 %	20 %	20 %	0 %	384449261
6011	NC_017285	CGA	2	6	285329	285334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449261
6012	NC_017285	CTTTG	2	10	285346	285355	0 %	60 %	20 %	20 %	384449261
6013	NC_017285	GCT	2	6	285404	285409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449261
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6015	NC_017285	CTT	2	6	285491	285496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449261
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6017	NC_017285	AGC	2	6	285565	285570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449261
6018	NC_017285	TTC	2	6	285585	285590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449261
6019	NC_017285	TGT	2	6	285595	285600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449261
6020	NC_017285	CTTTAG	2	12	285615	285626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384449261
6021	NC_017285	GAC	2	6	285637	285642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449261
6022	NC_017285	CT	3	6	285749	285754	0 %	50 %	0 %	50 %	384449261
6023	NC_017285	GGGGA	2	10	285785	285794	20 %	0 %	80 %	0 %	384449261
6024	NC_017285	TCT	2	6	285802	285807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449261
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6028	NC_017285	GAT	2	6	286025	286030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449261
6029	NC_017285	TCT	2	6	286080	286085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_017285	CTG	2	6	286348	286353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449262
6031	NC_017285	GTC	2	6	286363	286368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449262
6032	NC_017285	GTC	2	6	286387	286392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449262
6033	NC_017285	TTG	2	6	286411	286416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449262
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6038	NC_017285	T	6	6	286519	286524	0 %	100 %	0 %	0 %	384449262
6039	NC_017285	TTA	2	6	286585	286590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449262
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6043	NC_017285	ATT	2	6	286750	286755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449262
6044	NC_017285	TTGA	2	8	286782	286789	25 %	50 %	25 %	0 %	384449262
6045	NC_017285	TGA	2	6	286844	286849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449262
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6048	NC_017285	TAC	2	6	287027	287032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449262
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6052	NC_017285	TCG	3	9	287141	287149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449262
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6054	NC_017285	GAT	2	6	287249	287254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449262
6055	NC_017285	GA	3	6	287266	287271	50 %	0 %	50 %	0 %	384449262
6056	NC_017285	TTG	2	6	287284	287289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449262
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6058	NC_017285	TGT	2	6	287351	287356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449262
6059	NC_017285	GAA	2	6	287409	287414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449262
6060	NC_017285	GA	3	6	287425	287430	50 %	0 %	50 %	0 %	384449262
6061	NC_017285	GATA	2	8	287437	287444	50 %	25 %	25 %	0 %	384449262
6062	NC_017285	TTC	2	6	287548	287553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449263
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6114	NC_017285	T	6	6	290588	290593	0 %	100 %	0 %	0 %	384449264
6115	NC_017285	TTG	2	6	290622	290627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_017285	ATT	2	6	290688	290693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017285	TTTGTC	2	12	290741	290752	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384449265
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