MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017285	ATA	2	6	259296	259301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449238
5502	NC_017285	CTGA	2	8	259322	259329	25 %	25 %	25 %	25 %	384449238
5503	NC_017285	TCCT	2	8	259417	259424	0 %	50 %	0 %	50 %	384449238
5504	NC_017285	T	9	9	259437	259445	0 %	100 %	0 %	0 %	384449238
5505	NC_017285	TGT	2	6	259568	259573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449238
5506	NC_017285	CTA	2	6	259639	259644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017285	TGAA	2	8	259713	259720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017285	T	6	6	259728	259733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017285	AGG	3	9	259734	259742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017285	ATC	2	6	259938	259943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449239
5511	NC_017285	AAG	2	6	259944	259949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449239
5512	NC_017285	TCC	2	6	260016	260021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449239
5513	NC_017285	GTC	2	6	260079	260084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449239
5514	NC_017285	TTC	2	6	260114	260119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449239
5515	NC_017285	CTG	2	6	260151	260156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449239
5516	NC_017285	G	11	11	260321	260331	0 %	0 %	100 %	0 %	384449239
5517	NC_017285	CAAA	2	8	260386	260393	75 %	0 %	0 %	25 %	384449239
5518	NC_017285	GTT	2	6	260410	260415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449239
5519	NC_017285	TCA	2	6	260494	260499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449239
5520	NC_017285	ATC	2	6	260514	260519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449239
5521	NC_017285	TTC	2	6	260592	260597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449239
5522	NC_017285	AGA	2	6	260654	260659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449239
5523	NC_017285	TTG	2	6	260678	260683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449239
5524	NC_017285	CTT	2	6	260702	260707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449239
5525	NC_017285	GAA	2	6	260714	260719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449239
5526	NC_017285	GGA	2	6	260743	260748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449239
5527	NC_017285	CAG	2	6	260756	260761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449239
5528	NC_017285	AG	3	6	260812	260817	50 %	0 %	50 %	0 %	384449239
5529	NC_017285	TCTCG	2	10	261032	261041	0 %	40 %	20 %	40 %	384449239
5530	NC_017285	GAG	2	6	261088	261093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449239
5531	NC_017285	CAA	2	6	261104	261109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449239
5532	NC_017285	CT	3	6	261288	261293	0 %	50 %	0 %	50 %	384449239
5533	NC_017285	ATG	2	6	261295	261300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449239
5534	NC_017285	TCA	2	6	261302	261307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449239
5535	NC_017285	GTATAG	2	12	261337	261348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449239
5536	NC_017285	TACT	2	8	261356	261363	25 %	50 %	0 %	25 %	384449239
5537	NC_017285	CAG	2	6	261407	261412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449239
5538	NC_017285	T	6	6	261427	261432	0 %	100 %	0 %	0 %	384449239
5539	NC_017285	TGAT	2	8	261487	261494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017285	A	6	6	261511	261516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017285	TTTAG	2	10	261564	261573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017285	AGG	2	6	261580	261585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017285	CTTAA	2	10	261632	261641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5544	NC_017285	TAT	2	6	261662	261667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017285	TTTA	2	8	261686	261693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017285	TAA	2	6	261700	261705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017285	TTA	2	6	261731	261736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017285	GTC	2	6	261766	261771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449240
5549	NC_017285	AGA	2	6	261802	261807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
5550	NC_017285	GAA	2	6	261830	261835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
5551	NC_017285	TGT	2	6	261844	261849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449240
5552	NC_017285	TTC	2	6	261850	261855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449240
5553	NC_017285	GAA	2	6	261938	261943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
5554	NC_017285	TTC	2	6	261985	261990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449240
5555	NC_017285	GTT	2	6	262001	262006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449240
5556	NC_017285	TCA	2	6	262016	262021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449240
5557	NC_017285	GAC	2	6	262049	262054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449240
5558	NC_017285	TCAG	2	8	262087	262094	25 %	25 %	25 %	25 %	384449240
5559	NC_017285	ATT	2	6	262186	262191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449240
5560	NC_017285	TAAG	2	8	262257	262264	50 %	25 %	25 %	0 %	384449240
5561	NC_017285	CAT	2	6	262277	262282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449240
5562	NC_017285	AAT	2	6	262328	262333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449240
5563	NC_017285	TCTT	2	8	262396	262403	0 %	75 %	0 %	25 %	384449240
5564	NC_017285	CTG	2	6	262434	262439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449240
5565	NC_017285	CTAC	2	8	262472	262479	25 %	25 %	0 %	50 %	384449240
5566	NC_017285	AGA	2	6	262483	262488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
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5569	NC_017285	CGT	2	6	262580	262585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449240
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5572	NC_017285	AAG	2	6	262719	262724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
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5574	NC_017285	GA	3	6	262759	262764	50 %	0 %	50 %	0 %	384449240
5575	NC_017285	GAT	2	6	262801	262806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449240
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5579	NC_017285	GGT	2	6	263011	263016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017285	T	8	8	263027	263034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017285	TGG	2	6	263049	263054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017285	AGG	2	6	263074	263079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017285	AGA	2	6	263095	263100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
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5587	NC_017285	GCGTG	2	10	263496	263505	0 %	20 %	60 %	20 %	384449241
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5590	NC_017285	TTTG	2	8	263668	263675	0 %	75 %	25 %	0 %	384449241
5591	NC_017285	TCT	2	6	263736	263741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449241
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5594	NC_017285	GCT	2	6	264008	264013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449241
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5596	NC_017285	GAT	2	6	264038	264043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449241
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5598	NC_017285	TTA	2	6	264176	264181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449242
5599	NC_017285	GAAA	2	8	264240	264247	75 %	0 %	25 %	0 %	384449242
5600	NC_017285	TCT	2	6	264253	264258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449242
5601	NC_017285	ATT	2	6	264278	264283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449242
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5603	NC_017285	T	6	6	264351	264356	0 %	100 %	0 %	0 %	384449243
5604	NC_017285	TGA	2	6	264416	264421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449243
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5607	NC_017285	T	6	6	264540	264545	0 %	100 %	0 %	0 %	384449243
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5612	NC_017285	TGAT	2	8	264889	264896	25 %	50 %	25 %	0 %	384449243
5613	NC_017285	GAGC	2	8	265072	265079	25 %	0 %	50 %	25 %	384449243
5614	NC_017285	ACA	2	6	265120	265125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449243
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5616	NC_017285	AGGAG	2	10	265224	265233	40 %	0 %	60 %	0 %	384449243
5617	NC_017285	AGAAA	2	10	265287	265296	80 %	0 %	20 %	0 %	384449243
5618	NC_017285	GA	3	6	265307	265312	50 %	0 %	50 %	0 %	384449243
5619	NC_017285	AAG	2	6	265485	265490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449244
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5622	NC_017285	T	7	7	265591	265597	0 %	100 %	0 %	0 %	384449244
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