MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017282	TGA	2	6	36661	36666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442348
1002	NC_017282	AAATA	2	10	36667	36676	80 %	20 %	0 %	0 %	384442348
1003	NC_017282	A	6	6	36787	36792	100 %	0 %	0 %	0 %	384442348
1004	NC_017282	AT	4	8	36867	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
1005	NC_017282	ATT	2	6	36877	36882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442348
1006	NC_017282	AAAT	2	8	36912	36919	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
1007	NC_017282	TAAA	2	8	36930	36937	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
1008	NC_017282	ATA	2	6	36945	36950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442348
1009	NC_017282	AT	3	6	36966	36971	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
1010	NC_017282	A	7	7	36999	37005	100 %	0 %	0 %	0 %	384442348
1011	NC_017282	GTA	2	6	37028	37033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442349
1012	NC_017282	TGA	3	9	37044	37052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442349
1013	NC_017282	AAT	2	6	37053	37058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1014	NC_017282	A	6	6	37063	37068	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1015	NC_017282	TTA	2	6	37163	37168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442349
1016	NC_017282	A	6	6	37185	37190	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1017	NC_017282	GATA	2	8	37303	37310	50 %	25 %	25 %	0 %	384442349
1018	NC_017282	TA	3	6	37376	37381	50 %	50 %	0 %	0 %	384442349
1019	NC_017282	A	6	6	37397	37402	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1020	NC_017282	T	6	6	37421	37426	0 %	100 %	0 %	0 %	384442349
1021	NC_017282	ACA	2	6	37444	37449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442349
1022	NC_017282	ACA	2	6	37464	37469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442349
1023	NC_017282	TAC	2	6	37479	37484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442349
1024	NC_017282	T	7	7	37509	37515	0 %	100 %	0 %	0 %	384442349
1025	NC_017282	A	7	7	37602	37608	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1026	NC_017282	AAAT	2	8	37703	37710	75 %	25 %	0 %	0 %	384442349
1027	NC_017282	TTAAA	2	10	37724	37733	60 %	40 %	0 %	0 %	384442349
1028	NC_017282	AAT	2	6	37738	37743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1029	NC_017282	AAAAAT	2	12	37761	37772	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442349
1030	NC_017282	TAT	2	6	37777	37782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442349
1031	NC_017282	A	7	7	37837	37843	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1032	NC_017282	TTA	2	6	37845	37850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442349
1033	NC_017282	A	6	6	37867	37872	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1034	NC_017282	TAG	2	6	37958	37963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442349
1035	NC_017282	AAG	2	6	37967	37972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442349
1036	NC_017282	AAAG	2	8	37985	37992	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
1037	NC_017282	TAA	2	6	38001	38006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1038	NC_017282	AAG	2	6	38015	38020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442349
1039	NC_017282	A	6	6	38035	38040	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1040	NC_017282	AG	3	6	38068	38073	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
1041	NC_017282	CAA	2	6	38091	38096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442349
1042	NC_017282	ACA	2	6	38104	38109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442349
1043	NC_017282	A	7	7	38109	38115	100 %	0 %	0 %	0 %	384442349
1044	NC_017282	AAT	2	6	38143	38148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1045	NC_017282	GA	4	8	38149	38156	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
1046	NC_017282	TAA	2	6	38199	38204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1047	NC_017282	AAGA	2	8	38231	38238	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
1048	NC_017282	ATA	2	6	38354	38359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1049	NC_017282	AAT	2	6	38383	38388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442349
1050	NC_017282	TA	3	6	38413	38418	50 %	50 %	0 %	0 %	384442350
1051	NC_017282	AAT	2	6	38428	38433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442351
1052	NC_017282	A	7	7	38471	38477	100 %	0 %	0 %	0 %	384442351
1053	NC_017282	GTTT	2	8	38489	38496	0 %	75 %	25 %	0 %	384442351
1054	NC_017282	GGA	2	6	38525	38530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442351
1055	NC_017282	A	6	6	38535	38540	100 %	0 %	0 %	0 %	384442351
1056	NC_017282	A	6	6	38584	38589	100 %	0 %	0 %	0 %	384442351
1057	NC_017282	ATA	2	6	38595	38600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442351
1058	NC_017282	TGG	2	6	38633	38638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442351
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1061	NC_017282	GAA	2	6	38801	38806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442351
1062	NC_017282	AAG	2	6	38824	38829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442351
1063	NC_017282	TA	3	6	38838	38843	50 %	50 %	0 %	0 %	384442351
1064	NC_017282	ATA	2	6	38870	38875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442351
1065	NC_017282	AAG	2	6	38936	38941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017282	AAG	2	6	38990	38995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442352
1067	NC_017282	TAAA	2	8	39041	39048	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
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1069	NC_017282	AAAT	2	8	39072	39079	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
1070	NC_017282	TTGT	2	8	39116	39123	0 %	75 %	25 %	0 %	384442352
1071	NC_017282	TAA	2	6	39125	39130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442352
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1073	NC_017282	TAA	2	6	39168	39173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442353
1074	NC_017282	CAA	2	6	39202	39207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442353
1075	NC_017282	T	6	6	39211	39216	0 %	100 %	0 %	0 %	384442353
1076	NC_017282	AAT	2	6	39256	39261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442353
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1078	NC_017282	CAG	2	6	39285	39290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442353
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1087	NC_017282	TAT	2	6	39777	39782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442353
1088	NC_017282	A	7	7	39793	39799	100 %	0 %	0 %	0 %	384442353
1089	NC_017282	GA	3	6	39800	39805	50 %	0 %	50 %	0 %	384442353
1090	NC_017282	AAT	2	6	39835	39840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442353
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1093	NC_017282	GTC	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017282	ATG	2	6	39931	39936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017282	ATG	2	6	39961	39966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017282	TCT	2	6	40059	40064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017282	T	7	7	40104	40110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017282	T	6	6	40120	40125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017282	TCT	2	6	40152	40157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017282	CTTT	2	8	40178	40185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_017282	TTGAG	2	10	40263	40272	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017282	ACC	2	6	40319	40324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017282	A	7	7	40349	40355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017282	T	6	6	40357	40362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017282	ATT	2	6	40395	40400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017282	AGT	2	6	40412	40417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017282	TTCT	2	8	40450	40457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_017282	TCA	2	6	40509	40514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017282	TTTC	2	8	40542	40549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017282	TCA	3	9	40614	40622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017282	T	7	7	40703	40709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017282	AGT	2	6	40710	40715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017282	ATT	2	6	40751	40756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017282	TCT	2	6	40791	40796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017282	GTA	2	6	40825	40830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017282	GCA	2	6	40869	40874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017282	CAC	2	6	40882	40887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_017282	TCT	2	6	40896	40901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017282	TTGCT	2	10	40948	40957	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_017282	CAT	2	6	40981	40986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017282	TC	3	6	41037	41042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017282	CTT	2	6	41079	41084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017282	T	6	6	41140	41145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017282	T	6	6	41167	41172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017282	TGAA	2	8	41256	41263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017282	T	7	7	41300	41306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017282	TA	3	6	41317	41322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017282	TCA	2	6	41352	41357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017282	TCT	3	9	41373	41381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017282	TTC	2	6	41414	41419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017282	TTTA	2	8	41420	41427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017282	GTT	2	6	41473	41478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017282	TG	3	6	41508	41513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017282	ATC	2	6	41519	41524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017282	TTA	2	6	41565	41570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017282	ATC	2	6	41588	41593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_017282	TAA	2	6	41605	41610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017282	CAAG	2	8	41649	41656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_017282	ATC	2	6	41675	41680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_017282	TTG	2	6	41681	41686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_017282	CA	3	6	41700	41705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_017282	ATA	2	6	41838	41843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_017282	ATT	2	6	41846	41851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_017282	TGTA	2	8	42039	42046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_017282	AATTG	2	10	42071	42080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_017282	A	6	6	42099	42104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_017282	T	6	6	42110	42115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_017282	AT	3	6	42129	42134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_017282	TCA	2	6	42243	42248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_017282	TAAT	2	8	42250	42257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_017282	T	6	6	42296	42301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_017282	ATC	2	6	42386	42391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_017282	GTTTT	2	10	42392	42401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_017282	T	8	8	42398	42405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_017282	TGTT	2	8	42410	42417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_017282	TCT	2	6	42432	42437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1157	NC_017282	T	6	6	42446	42451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_017282	GT	3	6	42491	42496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_017282	ATG	2	6	42501	42506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_017282	ATT	2	6	42515	42520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_017282	TGT	2	6	42521	42526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_017282	A	7	7	42535	42541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_017282	TAT	2	6	42550	42555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_017282	T	7	7	42557	42563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_017282	ATC	2	6	42566	42571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_017282	TCA	2	6	42618	42623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_017282	TTTA	2	8	42665	42672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_017282	T	6	6	42685	42690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_017282	TGA	2	6	42738	42743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_017282	ATA	2	6	42750	42755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_017282	TA	4	8	42775	42782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_017282	T	7	7	42786	42792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_017282	T	6	6	42797	42802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1174	NC_017282	T	6	6	42948	42953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_017282	T	6	6	43031	43036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_017282	TAA	2	6	43061	43066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1177	NC_017282	CAA	2	6	43076	43081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1178	NC_017282	TTCT	2	8	43096	43103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1179	NC_017282	T	6	6	43171	43176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_017282	AAAT	2	8	43184	43191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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